RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000575194.5

SPNS3-204, Transcript of sphingolipid transporter 3 (putative), humanhuman

TSL 1 (best)

Gene SPNS3, Length 1,721 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPNS3-204ENST00000575194 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP26.65■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 KIF15Q9NS87 1388 aa26.64■■□□□ 1.86
SPNS3-204ENST00000575194 MAGI2Q86UL8 1455 aa26.62■■□□□ 1.85
SPNS3-204ENST00000575194 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.6■■□□□ 1.85
SPNS3-204ENST00000575194 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.57■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 ABCA6Q8N139 1617 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 DUOX2Q9NRD8 1548 aa26.56■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 FOXD1Q16676 465 aa26.55■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.54■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 NUP155O75694 1391 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 UNC13BO14795 1591 aa26.52■■□□□ 1.84
SPNS3-204ENST00000575194 A2MP01023 1474 aa26.5■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 ERBINQ96RT1 1412 aa26.49■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 ATP10AO60312 1499 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 PKD2Q13563 968 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 L3MBTL2Q969R5 705 aa26.48■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.47■■□□□ 1.83
SPNS3-204ENST00000575194 FAM135AQ9P2D6 1515 aa26.44■■□□□ 1.82
SPNS3-204ENST00000575194 REREQ9P2R6 1566 aa26.43■■□□□ 1.82
SPNS3-204ENST00000575194 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.42■■□□□ 1.82
SPNS3-204ENST00000575194 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.4■■□□□ 1.82
SPNS3-204ENST00000575194 BCORL1Q5H9F3 1711 aa26.39■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 KIF3BO15066 747 aa26.38■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.37■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.36■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 AGLP35573 1532 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 DEPDC5O75140 1603 aa26.35■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.33■■□□□ 1.81
SPNS3-204ENST00000575194 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP26.32■■□□□ 1.8
SPNS3-204ENST00000575194 MROH1Q8NDA8 1641 aa26.31■■□□□ 1.8
SPNS3-204ENST00000575194 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.31■■□□□ 1.8
SPNS3-204ENST00000575194 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.28■■□□□ 1.8
SPNS3-204ENST00000575194 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.27■■□□□ 1.8
SPNS3-204ENST00000575194 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.26■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 GGT6Q6P531 493 aa26.25■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.24■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.22■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 ANP32CO43423 234 aa26.2■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 KANK1Q14678 1352 aa26.2■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.2■■□□□ 1.79
SPNS3-204ENST00000575194 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.19■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 PPP6R1Q9UPN7 881 aa26.18■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.16■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 CCER2I3L3R5 266 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa26.15■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 MLECQ14165 292 aa26.14■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 ABCC3O15438 1527 aa26.14■■□□□ 1.78
SPNS3-204ENST00000575194 CEP152O94986 1710 aa26.13■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 TET3O43151 1660 aa26.12■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 CCDC7Q96M83 1385 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 PLA2R1Q13018 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.11■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 USP47Q96K76 1375 aa26.09■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 E9PCH4 1651 aa26.08■■□□□ 1.77
SPNS3-204ENST00000575194 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP26.08■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.07■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.05■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 TRPM2O94759 1503 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26.04■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 DCAF11Q8TEB1 546 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.03■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 NPATQ14207 1427 aa26.02■■□□□ 1.76
SPNS3-204ENST00000575194 LAMC1P11047 1609 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 PRAG1Q86YV5 1406 aa26.01■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.98■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 PTPRTO14522 1441 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 ZMYM3Q14202 1370 aa25.97■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 MROH2AA6NES4 1674 aa25.96■■□□□ 1.75
SPNS3-204ENST00000575194 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.95■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.94■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 MADDQ8WXG6 1647 aa25.93■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.92■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 NOS1P29475 1434 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 CLTCL1P53675 1640 aa25.91■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.9■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP25.89■■□□□ 1.74
SPNS3-204ENST00000575194 PREX1Q8TCU6 1659 aa25.89■■□□□ 1.73
SPNS3-204ENST00000575194 RGL3Q3MIN7 710 aa25.88■■□□□ 1.73
SPNS3-204ENST00000575194 STAC3Q96MF2 364 aa25.87■■□□□ 1.73
SPNS3-204ENST00000575194 C3P01024 1663 aa25.86■■□□□ 1.73
SPNS3-204ENST00000575194 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.86■■□□□ 1.73
SPNS3-204ENST00000575194 ERVK-7P63135 1459 aa25.86■■□□□ 1.73
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