RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568561.5

NME3-211, Transcript of NME/NM23 nucleoside diphosphate kinase 3, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene NME3, Length 813 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NME3-211ENST00000568561 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa24.77■■□□□ 1.56
NME3-211ENST00000568561 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP24.75■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.75■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 PKD2Q13563 968 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP24.74■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.74■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 PZPP20742 1482 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 TNRQ92752 1358 aa24.73■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.71■■□□□ 1.55
NME3-211ENST00000568561 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa24.7■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 NEURL4Q96JN8 1562 aa24.7■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa24.69■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 RSPH4AQ5TD94 716 aa24.69■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP24.68■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 MAST1Q9Y2H9 1570 aa24.67■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP24.67■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 TSPY4P0CV99 314 aa24.66■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 TSPY10P0CW01 314 aa24.66■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 ILDR2Q71H61 639 aa24.64■■□□□ 1.54
NME3-211ENST00000568561 ABCC3O15438 1527 aa24.63■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 UBAP1LF5GYI3 381 aa24.63■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.62■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 CEP152O94986 1710 aa24.62■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 MYOM3Q5VTT5 1437 aa24.61■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.61■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP24.61■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 MAP3K1Q13233 1512 aa24.61■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 MIA2Q96PC5 1412 aa24.61■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 UGGT1Q9NYU2 1555 aa24.6■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 NLRP1Q9C000 1473 aa24.59■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP24.59■■□□□ 1.53
NME3-211ENST00000568561 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.56■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 VWDEQ8N2E2 1590 aa24.54■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 SHANK2Q9UPX8 1470 aa24.54■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 ERVK-7P63135 1459 aa24.53■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 DEPDC5O75140 1603 aa24.53■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 IQGAP1P46940 1657 aa24.53■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 CPS1P31327 1500 aa24.52■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 ANKLE2Q86XL3 938 aa24.52■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP24.52■■□□□ 1.52
NME3-211ENST00000568561 DUOX2Q9NRD8 1548 aa24.51■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP24.51■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 PTPN23Q9H3S7 1636 aa24.5■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 MED14O60244 1454 aa24.48■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 UBR1Q8IWV7 1749 aa24.48■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP24.48■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 STRCP1A6NGW2 1772 aa24.47■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP24.46■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 KIF15Q9NS87 1388 aa24.46■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 ABCC5O15440 1437 aa24.45■■□□□ 1.51
NME3-211ENST00000568561 PIP4K2BP78356 416 aa24.45■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 SOCS7O14512 581 aa24.43■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa24.41■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 ALKQ9UM73 1620 aa24.41■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 DAPK1P53355 1430 aa24.41■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 ERBINQ96RT1 1412 aa24.41■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 FGD6Q6ZV73 1430 aa24.39■■□□□ 1.5
NME3-211ENST00000568561 HSPA1LP34931 641 aa24.39■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 APLP2Q06481 763 aa24.38■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 TOM1O60784 492 aa24.37■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.37■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 PIK3C2BO00750 1634 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 SYNMO15061 1565 aa24.36■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP24.35■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 LRRC7Q96NW7 1537 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa24.35■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP24.34■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 CHIC2Q9UKJ5 165 aa24.33■■□□□ 1.49
NME3-211ENST00000568561 ARHGAP23Q9P227 1491 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 SLIT1O75093 1534 aa24.32■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 LTKP29376 864 aa24.3■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP24.29■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP24.28■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 KANK1Q14678 1352 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa24.28■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 TXNDC2Q86VQ3 553 aa24.27■■□□□ 1.48
NME3-211ENST00000568561 LMTK2Q8IWU2 1503 aa24.25■■□□□ 1.47
NME3-211ENST00000568561 EFCAB6Q5THR3 1501 aa24.24■■□□□ 1.47
NME3-211ENST00000568561 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP24.22■■□□□ 1.47
NME3-211ENST00000568561 TMEM2Q9UHN6 1383 aa24.22■■□□□ 1.47
NME3-211ENST00000568561 ADGRL2O95490 1459 aa24.2■■□□□ 1.47
NME3-211ENST00000568561 STAG3Q9UJ98 1225 aa24.2■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 EID1Q9Y6B2 187 aa24.2■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 IDI1Q13907 227 aa24.18■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.18■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 ADGRB3O60242 1522 aa24.18■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 MYO5BQ9ULV0 1848 aa24.16■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 NOS1P29475 1434 aa24.16■■□□□ 1.46
NME3-211ENST00000568561 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa24.12■■□□□ 1.45
NME3-211ENST00000568561 TET3O43151 1660 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-211ENST00000568561 GCC2Q8IWJ2 1684 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-211ENST00000568561 SLC26A8Q96RN1 970 aa24.11■■□□□ 1.45
NME3-211ENST00000568561 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP24.09■■□□□ 1.45
NME3-211ENST00000568561 TMEM94Q12767 1356 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP24.07■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 UNC13BO14795 1591 aa24.07■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24.06■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 NWD1Q149M9 1564 aa24.05■■□□□ 1.44
NME3-211ENST00000568561 KCNA6P17658 529 aa24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 16.3 ms