RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000567065.5

INO80E-208, Transcript of INO80 complex subunit E, humanhuman

TSL 3

Gene INO80E, Length 883 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80E-208ENST00000567065 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.57■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 SOCS7O14512 581 aa23.56■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 CCDC141Q6ZP82 1450 aa23.56■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa23.55■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 NCOA2Q15596 1464 aa23.55■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.54■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 NEURL4Q96JN8 1562 aa23.53■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 MAP3K1Q13233 1512 aa23.53■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 PZPP20742 1482 aa23.52■■□□□ 1.36
INO80E-208ENST00000567065 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.51■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 UBAP1LF5GYI3 381 aa23.5■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 KIF3BO15066 747 aa23.5■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.49■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP23.49■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 TNRQ92752 1358 aa23.49■■□□□ 1.35
INO80E-208ENST00000567065 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP23.44■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 CPS1P31327 1500 aa23.43■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa23.43■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 APLP2Q06481 763 aa23.43■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 DEPDC5O75140 1603 aa23.42■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 NLRP1Q9C000 1473 aa23.42■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 MIA2Q96PC5 1412 aa23.42■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.41■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa23.41■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.41■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.4■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 UGGT1Q9NYU2 1555 aa23.4■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 MED14O60244 1454 aa23.39■■□□□ 1.34
INO80E-208ENST00000567065 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP23.39■■□□□ 1.333e-8■■■■■ 27.7
INO80E-208ENST00000567065 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 TSPY4P0CV99 314 aa23.37■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 TSPY10P0CW01 314 aa23.37■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 ANKLE2Q86XL3 938 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP23.36■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 ABCC3O15438 1527 aa23.36■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 MROH1Q8NDA8 1641 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 IQGAP1P46940 1657 aa23.35■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 STRCP1A6NGW2 1772 aa23.33■■□□□ 1.33
INO80E-208ENST00000567065 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP23.33■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP23.33■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP23.32■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 CEP152O94986 1710 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 ALKQ9UM73 1620 aa23.32■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 TOM1O60784 492 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 HSPA1LP34931 641 aa23.3■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 ERVK-7P63135 1459 aa23.29■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 UBR1Q8IWV7 1749 aa23.28■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP23.28■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 PIP4K2BP78356 416 aa23.27■■□□□ 1.32
INO80E-208ENST00000567065 MYOM3Q5VTT5 1437 aa23.25■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.24■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP23.24■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 SYNMO15061 1565 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 CROCC2H7BZ55 1655 aa23.23■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 LRRC7Q96NW7 1537 aa23.21■■□□□ 1.31
INO80E-208ENST00000567065 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.2■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 SLIT1O75093 1534 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 ARHGAP23Q9P227 1491 aa23.17■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa23.16■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP23.16■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP23.15■■□□□ 1.3
INO80E-208ENST00000567065 PTPN23Q9H3S7 1636 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 ERBINQ96RT1 1412 aa23.14■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 ABCC5O15440 1437 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 KIF15Q9NS87 1388 aa23.13■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 PIK3C2BO00750 1634 aa23.11■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 LTKP29376 864 aa23.1■■□□□ 1.29
INO80E-208ENST00000567065 DAPK1P53355 1430 aa23.07■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 TXNDC2Q86VQ3 553 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23.06■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 LMTK2Q8IWU2 1503 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 FGD6Q6ZV73 1430 aa23.05■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 TMEM2Q9UHN6 1383 aa23.02■■□□□ 1.28
INO80E-208ENST00000567065 EFCAB6Q5THR3 1501 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP23■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23■■□□□ 1.277e-7■□□□□ 10.6
INO80E-208ENST00000567065 EID1Q9Y6B2 187 aa23■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP22.99■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 TET3O43151 1660 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 KANK1Q14678 1352 aa22.99■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 IDI1Q13907 227 aa22.96■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa22.96■■□□□ 1.27
INO80E-208ENST00000567065 NOS1P29475 1434 aa22.95■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 ADGRB3O60242 1522 aa22.93■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 FAM135BQ49AJ0 1406 aa22.92■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 STAG3Q9UJ98 1225 aa22.92■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 ADGRL2O95490 1459 aa22.92■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 MYO5BQ9ULV0 1848 aa22.92■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP22.91■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 CHIC2Q9UKJ5 165 aa22.91■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 NWD1Q149M9 1564 aa22.91■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 TMEM94Q12767 1356 aa22.9■■□□□ 1.26
INO80E-208ENST00000567065 KCNA6P17658 529 aa22.89■■□□□ 1.25
INO80E-208ENST00000567065 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP22.89■■□□□ 1.25
INO80E-208ENST00000567065 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa22.89■■□□□ 1.25
INO80E-208ENST00000567065 CHD2O14647 1828 aaKnown RBP22.86■■□□□ 1.25
INO80E-208ENST00000567065 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP22.85■■□□□ 1.25
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