RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561685.1

RRN3-204, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

TSL 5

Gene RRN3, Length 615 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-204ENST00000561685 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa9.45□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 ZBED2Q9BTP6 218 aa9.44□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 DDX12PQ92771 950 aa9.41□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 PLCB2Q00722 1185 aa9.4□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 NBPF3Q9H094 633 aa9.4□□□□□ -0.9
RRN3-204ENST00000561685 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP9.39□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 NBR1Q14596 966 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa9.39□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP9.38□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 HCSTQ9UBK5 93 aa9.38□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 COL9A1P20849 921 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP9.36□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 RABGEF1Q9UJ41 708 aa9.36□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 MAP3K7O43318 606 aa9.35□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 P3H3Q8IVL6 736 aa9.35□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.35□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP9.34□□□□□ -0.91
RRN3-204ENST00000561685 GOLGA8CPA6NN73 597 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 PROX2Q3B8N5 592 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 KCNV2Q8TDN2 545 aa9.33□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 GRXCR2A6NFK2 248 aa9.32□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 LAPTM4BQ86VI4 370 aa9.31□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 CERKQ8TCT0 537 aa9.31□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa9.3□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.29□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 WNT2BQ93097 391 aa9.29□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 OSBPP22059 807 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 THSD4Q6ZMP0 1018 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 KIAA1468Q9P260 1216 aa9.28□□□□□ -0.92
RRN3-204ENST00000561685 ANKK1Q8NFD2 765 aa9.26□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 PACS2Q86VP3 889 aa9.25□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP9.24□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP9.23□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 PTPN5P54829 565 aa9.23□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 PRSS12P56730 875 aa9.23□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 CDCA7LQ96GN5 454 aa9.23□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 TSKSQ9UJT2 592 aa9.23□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP9.22□□□□□ -0.93
RRN3-204ENST00000561685 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa9.21□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP9.21□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 SOWAHBA6NEL2 793 aa9.2□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 CDHR5Q9HBB8 845 aa9.2□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 NBPF26B4DH59 902 aa9.19□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.19□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 NYAP1Q6ZVC0 841 aa9.18□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 BCAMP50895 628 aa9.16□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 LRCH3Q96II8 777 aa9.16□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 FAM198AQ9UFP1 575 aa9.16□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 TATDN2Q93075 761 aa9.15□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP9.15□□□□□ -0.94
RRN3-204ENST00000561685 SEMA3EO15041 775 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 IFFO2Q5TF58 517 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 TTC13Q8NBP0 860 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 PNMA3Q9UL41 463 aa9.14□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 PADI6Q6TGC4 694 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 VSIG10Q8N0Z9 540 aa9.12□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP9.12□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 SMAPO00193 183 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 PTGDRQ13258 359 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 NUDT18Q6ZVK8 323 aa9.11□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 HDGFP51858 240 aaKnown RBP9.1□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 WBP1LQ9NX94 342 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 HPS5Q9UPZ3 1129 aa9.1□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.09□□□□□ -0.95
RRN3-204ENST00000561685 NUTM2FA1L443 756 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 C3orf80F5H4A9 247 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 NECTIN2Q92692 538 aa9.08□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 FCHSD2O94868 740 aa9.07□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP9.07□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 PPP4CP60510 307 aa9.06□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 SLC4A3P48751 1232 aa9.04□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP9.03□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 EYA1Q99502 592 aa9.03□□□□□ -0.96
RRN3-204ENST00000561685 HIC1Q14526 733 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 SLF2Q8IX21 1173 aa9.02□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 A0A0G2JS52 829 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 RNF40O75150 1001 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP9.01□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 ADGRG1Q9Y653 693 aa9.01□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 RGS20O76081 388 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 DNAJB2P25686 324 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 KCNC4Q03721 635 aa9□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP9□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP8.98□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 OATP04181 439 aa8.97□□□□□ -0.97
RRN3-204ENST00000561685 GNPATO15228 680 aa8.96□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 PRR14Q9BWN1 585 aa8.96□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 TMEM134Q9H6X4 195 aa8.96□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP8.95□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 GPR37O15354 613 aa8.95□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 RCCD1A6NED2 376 aa8.94□□□□□ -0.98
RRN3-204ENST00000561685 GPIHBP1Q8IV16 184 aa8.94□□□□□ -0.98
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.7 ms