RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561136.1

TMOD3-209, Transcript of tropomodulin 3, humanhuman

TSL 3

Gene TMOD3, Length 803 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa10.28□□□□□ -0.76
TMOD3-209ENST00000561136 ANKK1Q8NFD2 765 aa10.27□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 EVI5O60447 810 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 BCAMP50895 628 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP10.26□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 SMARCA2P51531 1590 aa10.26□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 HS6ST3Q8IZP7 471 aa10.25□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa10.25□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 SMARCA4P51532 1647 aa10.24□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 PROX2Q3B8N5 592 aa10.23□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa10.23□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 RABGEF1Q9UJ41 708 aa10.22□□□□□ -0.77
TMOD3-209ENST00000561136 NCAPD3P42695 1498 aa10.21□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 HMGXB3Q12766 1538 aa10.21□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa10.2□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 COL9A1P20849 921 aa10.19□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 SOWAHBA6NEL2 793 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 CHGAP10645 457 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 KCNC4Q03721 635 aa10.18□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 WBP1LQ9NX94 342 aa10.17□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 LCE2BO14633 110 aa10.16□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 PDE4AP27815 886 aa10.16□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K9P80192 1104 aa10.16□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 NYAP1Q6ZVC0 841 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa10.15□□□□□ -0.78
TMOD3-209ENST00000561136 LAPTM4AQ15012 233 aa10.14□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 LAPTM4BQ86VI4 370 aa10.14□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 KIAA1468Q9P260 1216 aa10.14□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 GFRA3O60609 400 aa10.13□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 TRAF7Q6Q0C0 670 aa10.12□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa10.09□□□□□ -0.79
TMOD3-209ENST00000561136 TYW1BQ6NUM6 668 aa10.08□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 PEG3Q9GZU2 1588 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 FBXW7Q969H0 707 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 HPS5Q9UPZ3 1129 aa10.07□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 MROH2BQ7Z745 1585 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 EMILIN3Q9NT22 766 aa10.06□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP10.05□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP10.05□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 PHF14O94880 888 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 LRCH3Q96II8 777 aa10.04□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP10.03□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 WDR62O43379 1518 aa10.02□□□□□ -0.8
TMOD3-209ENST00000561136 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 PRKD2Q9BZL6 878 aa10.01□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa10□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 MFSD10Q14728 455 aa10□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP10□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 MRC2Q9UBG0 1479 aa9.99□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 WIZO95785 1651 aa9.98□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
TMOD3-209ENST00000561136 MYT1Q01538 1121 aa9.96□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF787Q6DD87 383 aa9.96□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 PPP4CP60510 307 aa9.95□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 TJAP1Q5JTD0 557 aa9.95□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 EPAS1Q99814 870 aa9.95□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 PPP1R18Q6NYC8 613 aa9.93□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa9.93□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa9.93□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa9.93□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 PDS5BQ9NTI5 1447 aa9.92□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 GTPBP6O43824 516 aaPredicted RBP9.92□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 V9GY48 417 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 PACS2Q86VP3 889 aa9.9□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 MTRQ99707 1265 aa9.9□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 TSKSQ9UJT2 592 aa9.9□□□□□ -0.82
TMOD3-209ENST00000561136 CEP164Q9UPV0 1460 aa9.9□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 DDX12PQ92771 950 aa9.89□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF775Q96BV0 537 aaPredicted RBP9.89□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa9.89□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 DPYSL4O14531 572 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 SAMD7Q7Z3H4 446 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 IL21Q9HBE4 155 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 CADPSQ9ULU8 1353 aa9.88□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 FANCD2Q9BXW9 1451 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 SMAPO00193 183 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF516Q92618 1163 aa9.86□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 CADPS2Q86UW7 1296 aa9.85□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP9.84□□□□□ -0.83
TMOD3-209ENST00000561136 MAP3K7O43318 606 aa9.83□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 PRDM2Q13029 1718 aa9.82□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 NBR1Q14596 966 aa9.82□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 ARHGEF11O15085 1522 aa9.82□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP9.82□□□□□ -0.84
TMOD3-209ENST00000561136 RNF40O75150 1001 aa9.81□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms