RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000561040.1

MEIS3-209, Transcript of Meis homeobox 3, humanhuman

TSL 2

Gene MEIS3, Length 1,809 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MEIS3-209ENST00000561040 NBPF8Q3BBV2 869 aa23.05■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.05■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 NEO1Q92859 1461 aa23.04■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.04■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.03■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 KDM5CP41229 1560 aa23.03■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.03■■□□□ 1.28
MEIS3-209ENST00000561040 TET3O43151 1660 aa23.01■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.01■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 KANK1Q14678 1352 aa23■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 POGZQ7Z3K3 1410 aa23■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 RALGAPBQ86X10 1494 aa23■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 GLI2P10070 1586 aa23■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 VWDEQ8N2E2 1590 aa22.99■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 PLA2R1Q13018 1463 aa22.98■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 MLH3Q9UHC1 1453 aa22.98■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP22.98■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa22.98■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.98■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 E9PCH4 1651 aa22.97■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 HECW2Q9P2P5 1572 aa22.97■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 MYT1LQ9UL68 1186 aa22.96■■□□□ 1.27
MEIS3-209ENST00000561040 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.94■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 TRPM2O94759 1503 aa22.93■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 ANP32CO43423 234 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 A2MP01023 1474 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 CYB5RLQ6IPT4 315 aa22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.91■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.9■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 CEP152O94986 1710 aa22.89■■□□□ 1.26
MEIS3-209ENST00000561040 PTPRTO14522 1441 aa22.89■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 USP47Q96K76 1375 aa22.89■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 KIF3BO15066 747 aa22.89■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.89■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 CCDC7Q96M83 1385 aa22.88■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 CCER2I3L3R5 266 aa22.88■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.88■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.88■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.87■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 LAMC1P11047 1609 aa22.86■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.86■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.86■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.86■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.85■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 RICTORQ6R327 1708 aa22.84■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 STAC3Q96MF2 364 aa22.84■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 ABCA6Q8N139 1617 aa22.84■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.83■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 DIP2BQ9P265 1576 aa22.83■■□□□ 1.25
MEIS3-209ENST00000561040 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.82■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.82■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.81■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 CLTCL1P53675 1640 aa22.79■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.79■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.78■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.78■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.77■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 RGL3Q3MIN7 710 aa22.77■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
MEIS3-209ENST00000561040 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.75■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 KIF1BO60333 1816 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.74■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 MADDQ8WXG6 1647 aa22.72■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 RAPGEF3O95398 923 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.71■■□□□ 1.23
MEIS3-209ENST00000561040 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.68■■□□□ 1.22
MEIS3-209ENST00000561040 ABCC3O15438 1527 aa22.67■■□□□ 1.22
MEIS3-209ENST00000561040 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.67■■□□□ 1.22
MEIS3-209ENST00000561040 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.64■■□□□ 1.22
MEIS3-209ENST00000561040 TSPOAP1O95153 1857 aa22.64■■□□□ 1.22
MEIS3-209ENST00000561040 MYOM2P54296 1465 aa22.64■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 IFT172Q9UG01 1749 aa22.63■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 REREQ9P2R6 1566 aa22.62■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 NPATQ14207 1427 aa22.62■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 GGT6Q6P531 493 aa22.62■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.62■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.6■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 IQGAP1P46940 1657 aa22.6■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 ADGRB3O60242 1522 aa22.6■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.6■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.59■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa22.59■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.58■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP22.58■■□□□ 1.21
MEIS3-209ENST00000561040 MROH2AA6NES4 1674 aa22.57■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.57■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.55■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 NOS1P29475 1434 aa22.55■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 AGLP35573 1532 aa22.55■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 PIK3C2BO00750 1634 aa22.53■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP22.53■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.53■■□□□ 1.2
MEIS3-209ENST00000561040 PPLO60437 1756 aa22.52■■□□□ 1.2
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