RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000557657.5

TMEM260-216, Transcript of transmembrane protein 260, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene TMEM260, Length 2,572 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM260-216ENST00000557657 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.05■■■□□ 2.24
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TMEM260-216ENST00000557657 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.02■■■□□ 2.24
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TMEM260-216ENST00000557657 MYO5CQ9NQX4 1742 aa28.97■■■□□ 2.23
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TMEM260-216ENST00000557657 VWDEQ8N2E2 1590 aa28.34■■■□□ 2.13
TMEM260-216ENST00000557657 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP28.34■■■□□ 2.13
TMEM260-216ENST00000557657 RCAN3Q9UKA8 241 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM260-216ENST00000557657 ADAMTS8Q9UP79 889 aa28.33■■■□□ 2.13
TMEM260-216ENST00000557657 CHGAP10645 457 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM260-216ENST00000557657 RRP1P56182 461 aaKnown RBP28.32■■■□□ 2.12
TMEM260-216ENST00000557657 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP28.32■■■□□ 2.12
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TMEM260-216ENST00000557657 PPP2R1AP30153 589 aa28.3■■■□□ 2.12
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