RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546585.1

CS-203, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 2

Gene CS, Length 1,803 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-203ENST00000546585 ATP7AQ04656 1500 aa10.02□□□□□ -0.8
CS-203ENST00000546585 TONSLQ96HA7 1378 aa10.02□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 ERBINQ96RT1 1412 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 PLA2R1Q13018 1463 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 MROH1Q8NDA8 1641 aa10.01□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 VWDEQ8N2E2 1590 aa10□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 HECW2Q9P2P5 1572 aa10□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 FAM69CQ0P6D2 419 aa10□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 POGZQ7Z3K3 1410 aa10□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP9.99□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 NUP155O75694 1391 aa9.99□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 L3MBTL2Q969R5 705 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 MLH3Q9UHC1 1453 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 ATP10AO60312 1499 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 PKD2Q13563 968 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 BCORL1Q5H9F3 1711 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 AFAP1Q8N556 730 aa9.98□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 E9PCH4 1651 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 NBPF8Q3BBV2 869 aa9.97□□□□□ -0.81
CS-203ENST00000546585 ABCA6Q8N139 1617 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 MIER1Q8N108 512 aa9.96□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP9.95□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa9.95□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 TET3O43151 1660 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa9.93□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP9.91□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 A2MP01023 1474 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 REREQ9P2R6 1566 aa9.91□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 PTPRTO14522 1441 aa9.9□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CS-203ENST00000546585 TRPM2O94759 1503 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 LMTK2Q8IWU2 1503 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 CEP152O94986 1710 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 RAPGEF3O95398 923 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 RALGAPBQ86X10 1494 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa9.89□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 CLTCL1P53675 1640 aa9.88□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 MYT1LQ9UL68 1186 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 EFCAB6Q5THR3 1501 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 NEURL4Q96JN8 1562 aa9.87□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 YEATS2Q9ULM3 1422 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP9.86□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 WASHC2AQ641Q2 1341 aa9.86□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 CCDC144AA2RUR9 1427 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 PRAG1Q86YV5 1406 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 LAMC1P11047 1609 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 AGLP35573 1532 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 IFT172Q9UG01 1749 aa9.85□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 KANK1Q14678 1352 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 KIF3BO15066 747 aa9.84□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP9.84□□□□□ -0.83
CS-203ENST00000546585 MROH2AA6NES4 1674 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 MADDQ8WXG6 1647 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP9.83□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 GPRASP1Q5JY77 1395 aa9.83□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 UGGT1Q9NYU2 1555 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.82□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 ABCC3O15438 1527 aa9.82□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP9.81□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 CCDC7Q96M83 1385 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 PIK3C2BO00750 1634 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 KIF1BO60333 1816 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 NPATQ14207 1427 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 USP47Q96K76 1375 aa9.8□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 IQGAP1P46940 1657 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 ADGRB3O60242 1522 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 SYNMO15061 1565 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa9.78□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 KIF7Q2M1P5 1343 aa9.77□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 DCAF11Q8TEB1 546 aa9.77□□□□□ -0.84
CS-203ENST00000546585 NOS1P29475 1434 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 CNTLNQ9NXG0 1405 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP9.77□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 NRXN1Q9ULB1 1477 aa9.77□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 PPLO60437 1756 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 PREX1Q8TCU6 1659 aa9.76□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 GGT6Q6P531 493 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 MYOM2P54296 1465 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 KCNA4P22459 653 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 NBPF1Q3BBV0 1214 aa9.75□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa9.74□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 RGL3Q3MIN7 710 aa9.73□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 MYO5BQ9ULV0 1848 aa9.72□□□□□ -0.85
CS-203ENST00000546585 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP9.72□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 37 ms