RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539741.5

TM7SF3-208, Transcript of transmembrane 7 superfamily member 3, humanhuman

TSL 4

Gene TM7SF3, Length 573 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM7SF3-208ENST00000539741 RSPH4AQ5TD94 716 aa29.7■■■□□ 2.35
TM7SF3-208ENST00000539741 NAIPQ13075 1403 aa29.7■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGBQ8N7X0 1667 aa29.69■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.69■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 ADGRL2O95490 1459 aa29.68■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 IQSEC2Q5JU85 1478 aa29.68■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 CCDC141Q6ZP82 1450 aa29.68■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 CNTLNQ9NXG0 1405 aa29.68■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 NCOA1Q15788 1441 aa29.67■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 MBD5Q9P267 1494 aa29.67■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 SYCP2Q9BX26 1530 aa29.66■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 MROH2AA6NES4 1674 aa29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
TM7SF3-208ENST00000539741 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa29.61■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 CHIC2Q9UKJ5 165 aa29.61■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 CLSPNQ9HAW4 1339 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa29.6■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 MAST1Q9Y2H9 1570 aa29.59■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 TSPY4P0CV99 314 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 TSPY10P0CW01 314 aa29.58■■■□□ 2.33
TM7SF3-208ENST00000539741 NPATQ14207 1427 aa29.57■■■□□ 2.32
TM7SF3-208ENST00000539741 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-208ENST00000539741 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa29.56■■■□□ 2.32
TM7SF3-208ENST00000539741 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP29.51■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 ZMYM3Q14202 1370 aa29.5■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 MYO3AQ8NEV4 1616 aa29.49■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 PLXNC1O60486 1568 aa29.47■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP29.45■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 UBAP1LF5GYI3 381 aa29.45■■■□□ 2.31
TM7SF3-208ENST00000539741 ATP7AQ04656 1500 aa29.44■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP29.43■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 KIF15Q9NS87 1388 aa29.42■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 PLA2R1Q13018 1463 aa29.42■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.41■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.41■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.4■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 PKD2Q13563 968 aa29.4■■■□□ 2.3
TM7SF3-208ENST00000539741 A2MP01023 1474 aa29.37■■■□□ 2.29
TM7SF3-208ENST00000539741 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.33■■■□□ 2.29
TM7SF3-208ENST00000539741 GGT6Q6P531 493 aa29.32■■■□□ 2.28
TM7SF3-208ENST00000539741 TRIM52Q96A61 297 aa29.29■■■□□ 2.28
TM7SF3-208ENST00000539741 PPP6R1Q9UPN7 881 aa29.29■■■□□ 2.28
TM7SF3-208ENST00000539741 ERBINQ96RT1 1412 aa29.28■■■□□ 2.28
TM7SF3-208ENST00000539741 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP29.26■■■□□ 2.27
TM7SF3-208ENST00000539741 A2ML1A8K2U0 1454 aa29.25■■■□□ 2.27
TM7SF3-208ENST00000539741 KDM5DQ9BY66 1539 aa29.25■■■□□ 2.27
TM7SF3-208ENST00000539741 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
TM7SF3-208ENST00000539741 UNC13BO14795 1591 aa29.19■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP29.18■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 MPHOSPH9Q99550 1183 aa29.17■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 PZPP20742 1482 aa29.17■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 CPS1P31327 1500 aa29.16■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 PIP4K2BP78356 416 aa29.16■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 HSPA1LP34931 641 aa29.15■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 NEURL4Q96JN8 1562 aa29.14■■■□□ 2.26
TM7SF3-208ENST00000539741 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.12■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 TOM1O60784 492 aa29.12■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 NUP155O75694 1391 aa29.12■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP29.11■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 TNRQ92752 1358 aa29.11■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP29.09■■■□□ 2.25
TM7SF3-208ENST00000539741 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa29.07■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.05■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 FAM135AQ9P2D6 1515 aa29.05■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP29.05■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 DEPDC5O75140 1603 aa29.03■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 KIF3BO15066 747 aa29.03■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.02■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 ANKLE2Q86XL3 938 aa29.02■■■□□ 2.24
TM7SF3-208ENST00000539741 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa28.99■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa28.98■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP28.98■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 UGGT1Q9NYU2 1555 aa28.97■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 NLRP1Q9C000 1473 aa28.97■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.96■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 SIN3AQ96ST3 1273 aa28.96■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 IQGAP1P46940 1657 aa28.96■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP28.95■■■□□ 2.23
TM7SF3-208ENST00000539741 KANK1Q14678 1352 aa28.95■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 NEUROD1Q13562 356 aa28.94■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 MED14O60244 1454 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 TONSLQ96HA7 1378 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 ALKQ9UM73 1620 aa28.93■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP28.9■■■□□ 2.22
TM7SF3-208ENST00000539741 STRCP1A6NGW2 1772 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 MROH1Q8NDA8 1641 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 FOXD1Q16676 465 aa28.88■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 SYNMO15061 1565 aa28.86■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 TET3O43151 1660 aa28.85■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP28.84■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 LMTK2Q8IWU2 1503 aa28.83■■■□□ 2.21
TM7SF3-208ENST00000539741 LRRC7Q96NW7 1537 aa28.82■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 64.7 ms