RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531496.5

SYTL2-223, Transcript of synaptotagmin like 2, human

TSL 2

Gene SYTL2, Length 942 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SYTL2-223	ENST00000531496	PBRM1	Q86U86	1689 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SYTL2-223	ENST00000531496	EMILIN3	Q9NT22	766 aa		10.6	□□□□□ -0.71
SYTL2-223	ENST00000531496	E2F4	Q16254	413 aa		10.59	□□□□□ -0.71
SYTL2-223	ENST00000531496	ERCC6L2	Q5T890	1561 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	SLC34A2	O95436	690 aa		10.58	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	HOXB3	P14651	431 aa	Predicted RBP	10.58	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	SLAIN1	Q8ND83	568 aa		10.57	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	WDR70	Q9NW82	654 aa		10.56	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	ABCA10	Q8WWZ4	1543 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	OXER1	Q8TDS5	423 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	PTCD2	Q8WV60	388 aa	Known RBP	10.54	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	JPH4	Q96JJ6	628 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		10.54	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	FAM163A	Q96GL9	167 aa	Predicted RBP	10.53	□□□□□ -0.72
SYTL2-223	ENST00000531496	KDM4F	A0A1W2PPD8	638 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	SUPT5H	O00267	1087 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	P3H3	Q8IVL6	736 aa		10.52	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	ARHGEF1	Q92888	912 aa	Known RBP	10.52	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	GRIN2A	Q12879	1464 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	CEP170	Q5SW79	1584 aa		10.51	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	NUP160	Q12769	1436 aa		10.49	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	WRN	Q14191	1432 aa	Predicted RBP eCLIP	10.49	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	FHAD1	B1AJZ9	1412 aa		10.47	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	PRG4	Q92954	1404 aa	Predicted RBP	10.47	□□□□□ -0.73
SYTL2-223	ENST00000531496	SHROOM2	Q13796	1616 aa		10.46	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	PDIA6	Q15084	440 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	GPR153	Q6NV75	609 aa		10.45	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	DPYSL4	O14531	572 aa		10.44	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	ANO8	Q9HCE9	1232 aa	Predicted RBP	10.43	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	TSPOAP1	O95153	1857 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	ZSWIM6	Q9HCJ5	1215 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	PCDHGA4	Q9Y5G9	962 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	ADAMTS12	P58397	1594 aa		10.42	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.41	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	UPF1	Q92900	1129 aa	Known RBP eCLIP	10.41	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	TOP2B	Q02880	1626 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	ERICH3	Q5RHP9	1530 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	ABCC10	Q5T3U5	1492 aa		10.4	□□□□□ -0.74
SYTL2-223	ENST00000531496	SPDYE16	A6NNV3	312 aa	Predicted RBP	10.39	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	TESPA1	A2RU30	521 aa	Predicted RBP	10.38	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	SNPH	O15079	494 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	PTGER2	P43116	358 aa		10.38	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	SEMA3E	O15041	775 aa		10.37	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	KHSRP	Q92945	711 aa	Known RBP eCLIP	10.37	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	TTBK1	Q5TCY1	1321 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	HOXB1	P14653	301 aa	Predicted RBP	10.36	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	MAP3K9	P80192	1104 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	ARSI	Q5FYB1	569 aa		10.36	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	EVI5	O60447	810 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	BCAN	Q96GW7	911 aa		10.35	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	CDAN1	Q8IWY9	1227 aa		10.34	□□□□□ -0.75
SYTL2-223	ENST00000531496	ST18	O60284	1047 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	IGF1R	P08069	1367 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	ADCY10	Q96PN6	1610 aa		10.33	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	DIP2B	Q9P265	1576 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	TBC1D12	O60347	775 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	MLLT3	P42568	568 aa	Predicted RBP	10.32	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	KDM6B	O15054	1643 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	MAPKBP1	O60336	1514 aa		10.32	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	NUDT7	P0C024	238 aa		10.31	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.3	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	PTPRG	P23470	1445 aa		10.29	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	PRIM1	P49642	420 aa	Known RBP	10.28	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	NBR1	Q14596	966 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	ZNF710	Q8N1W2	664 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	RUSC2	Q8N2Y8	1516 aa		10.28	□□□□□ -0.76
SYTL2-223	ENST00000531496	OSBP	P22059	807 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	FOSB	P53539	338 aa		10.26	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	DHX30	Q7L2E3	1194 aa	Known RBP eCLIP	10.25	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	LHX6	Q9UPM6	363 aa		10.25	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	PCDHGA10	Q9Y5H3	936 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	CARMIL1	Q5VZK9	1371 aa		10.24	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	ZNF316	A6NFI3	1004 aa	Predicted RBP	10.23	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	PHF14	O94880	888 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	TNIK	Q9UKE5	1360 aa		10.23	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	POTEB3	A0JP26	581 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	POTEB	Q6S5H4	581 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	DDX12P	Q92771	950 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	ASXL2	Q76L83	1435 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	KIF27	Q86VH2	1401 aa		10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	10.22	□□□□□ -0.77
SYTL2-223	ENST00000531496	CUL7	Q14999	1698 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	CARMIL2	Q6F5E8	1435 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	PLB1	Q6P1J6	1458 aa		10.2	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	GLI2	P10070	1586 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	ABCC2	Q92887	1545 aa		10.19	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	GPR37	O15354	613 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	MARVELD3	Q96A59	401 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	EPAS1	Q99814	870 aa		10.18	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	ADGRL1	O94910	1474 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	UACA	Q9BZF9	1416 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	GRXCR2	A6NFK2	248 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	KCNH8	Q96L42	1107 aa		10.17	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	EN1	Q05925	392 aa	Predicted RBP	10.16	□□□□□ -0.78
SYTL2-223	ENST00000531496	RBM26	Q5T8P6	1007 aa	Known RBP	10.16	□□□□□ -0.78

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 17.9 ms