RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000524313.1

IGKV1-22-201, Transcript of immunoglobulin kappa variable 1-22 (pseudogene), humanhuman

BASIC

Gene IGKV1-22, Length 326 nt, Biotype IG V pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGKV1-22-201ENST00000524313 HPS5Q9UPZ3 1129 aa5.01□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 LCE2BO14633 110 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP4.99□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 KIAA1468Q9P260 1216 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa4.99□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 RGL2O15211 777 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PDE4AP27815 886 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPP4CP60510 307 aa4.98□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 V9GY48 417 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 FBXW7Q969H0 707 aa4.97□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 RYDENQ9NUL5 291 aaKnown RBP4.97□□□□□ -1.61
IGKV1-22-201ENST00000524313 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP4.96□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 COL9A1P20849 921 aa4.96□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP4.96□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TYW1BQ6NUM6 668 aa4.96□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 GGCXP38435 758 aa4.95□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPP1R18Q6NYC8 613 aa4.95□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PKDCCQ504Y2 493 aa4.94□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 IL21Q9HBE4 155 aa4.94□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP4.94□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa4.94□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa4.93□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PHF14O94880 888 aa4.93□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa4.93□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 HDGFP51858 240 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 PACS2Q86VP3 889 aa4.92□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 RNF40O75150 1001 aa4.91□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 MTRQ99707 1265 aa4.91□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 EPAS1Q99814 870 aa4.91□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP4.91□□□□□ -1.62
IGKV1-22-201ENST00000524313 TJAP1Q5JTD0 557 aa4.9□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa4.9□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 HS6ST3Q8IZP7 471 aa4.89□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 CHGAP10645 457 aaKnown RBP4.88□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 DGAT1O75907 488 aa4.87□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 PKD2Q13563 968 aa4.87□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 SAMD7Q7Z3H4 446 aa4.87□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 TREML4Q6UXN2 200 aa4.86□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 NECTIN2Q92692 538 aa4.86□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa4.86□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM187AA6NFU0 413 aa4.85□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 MYT1Q01538 1121 aa4.85□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF516Q92618 1163 aa4.85□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 TMUB1Q9BVT8 246 aa4.85□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC4A3P48751 1232 aa4.84□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 STK17AQ9UEE5 414 aa4.84□□□□□ -1.63
IGKV1-22-201ENST00000524313 MAP3K7O43318 606 aa4.83□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLC19A1P41440 591 aa4.83□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 COPS2P61201 443 aa4.83□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 EMILIN3Q9NT22 766 aa4.83□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 NBPF26B4DH59 902 aa4.82□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 SMAPO00193 183 aa4.82□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKX2-3Q8TAU0 364 aa4.82□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSKSQ9UJT2 592 aa4.82□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PNMA3Q9UL41 463 aa4.82□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 POTECB2RU33 542 aa4.81□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 WFS1O76024 890 aa4.81□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 DDX12PQ92771 950 aa4.81□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 NBR1Q14596 966 aa4.8□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 MFSD10Q14728 455 aa4.8□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP4.8□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 APLP1P51693 650 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR20EP86478 221 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR20CP86479 221 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR20DP86480 221 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR20BP86481 221 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR20AP86496 221 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZNF697Q5TEC3 545 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 SPRYD7Q5W111 196 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 TATDN2Q93075 761 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 CDCA7LQ96GN5 454 aa4.79□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 FAM181BA6NEQ2 426 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 DPYSL4O14531 572 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 ZPR1O75312 459 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 SLF2Q8IX21 1173 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 CERKQ8TCT0 537 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRR14Q9BWN1 585 aa4.78□□□□□ -1.64
IGKV1-22-201ENST00000524313 TNFRSF10AO00220 468 aa4.77□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 PRSS12P56730 875 aa4.77□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 NKX1-1Q15270 411 aaPredicted RBP4.77□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 TRIM67Q6ZTA4 783 aa4.77□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 PCDHB3Q9Y5E6 796 aa4.77□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 RNF223E7ERA6 249 aa4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 ST8SIA5O15466 376 aa4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 AAASQ9NRG9 546 aa4.76□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 NUDT18Q6ZVK8 323 aa4.75□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 ANKLE1Q8NAG6 615 aa4.75□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 AXIN1O15169 862 aa4.73□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 FOXC1Q12948 553 aa4.73□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.73□□□□□ -1.65
IGKV1-22-201ENST00000524313 PPEF1O14829 653 aaPredicted RBP4.72□□□□□ -1.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 53.1 ms