RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516743.1

RNU6-307P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 307, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-307P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-307P-201ENST00000516743 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa7.42□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 PTPREP23469 700 aa7.41□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 OSBPP22059 807 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 PROX2Q3B8N5 592 aa7.4□□□□□ -1.22
RNU6-307P-201ENST00000516743 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 FBXW7Q969H0 707 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 EPAS1Q99814 870 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 WDR70Q9NW82 654 aa7.39□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 NBR1Q14596 966 aa7.38□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 C3orf80F5H4A9 247 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.37□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.36□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RNU6-307P-201ENST00000516743 GRXCR2A6NFK2 248 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 TSKSQ9UJT2 592 aa7.33□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 SEMA3EO15041 775 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 MAP3K7O43318 606 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.31□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 TTC13Q8NBP0 860 aa7.3□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 KCNH8Q96L42 1107 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.29□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.28□□□□□ -1.24
RNU6-307P-201ENST00000516743 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.27□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 P3H3Q8IVL6 736 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.26□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 GPR37O15354 613 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 PRSS12P56730 875 aa7.25□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.25□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 SMAPO00193 183 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 PTGDRQ13258 359 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 NBPF3Q9H094 633 aa7.23□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.23□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 BCAMP50895 628 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 PADI6Q6TGC4 694 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 VSIG10Q8N0Z9 540 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 WNT2BQ93097 391 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 HCSTQ9UBK5 93 aa7.22□□□□□ -1.25
RNU6-307P-201ENST00000516743 CERKQ8TCT0 537 aa7.21□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.2□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.2□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 TATDN2Q93075 761 aa7.19□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 PTPN5P54829 565 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 EYA1Q99502 592 aa7.18□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.17□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 FECHP22830 423 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 PACS2Q86VP3 889 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 WBP1LQ9NX94 342 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 PNMA3Q9UL41 463 aa7.16□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 FAM161AQ3B820 660 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 STAC3Q96MF2 364 aa7.15□□□□□ -1.26
RNU6-307P-201ENST00000516743 PLA2G2EQ9NZK7 142 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.14□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 NBPF26B4DH59 902 aa7.13□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 NUTM2FA1L443 756 aa7.12□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 HPS5Q9UPZ3 1129 aa7.11□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 FCHSD2O94868 740 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 IFFO2Q5TF58 517 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 LRCH3Q96II8 777 aa7.1□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
RNU6-307P-201ENST00000516743 PHOX2BQ99453 314 aa7.08□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 APLP1P51693 650 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 HIC1Q14526 733 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 TMEM134Q9H6X4 195 aa7.07□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 RCCD1A6NED2 376 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 GNPATO15228 680 aa7.06□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 TJAP1Q5JTD0 557 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 NYAP1Q6ZVC0 841 aa7.05□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.05□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 SLC10A3P09131 477 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.04□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 NLRP7Q8WX94 980 aa7.04□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 A0A0G2JS52 829 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 DNAJB2P25686 324 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.03□□□□□ -1.28
RNU6-307P-201ENST00000516743 PPP4CP60510 307 aa7.02□□□□□ -1.29
RNU6-307P-201ENST00000516743 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
RNU6-307P-201ENST00000516743 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.6 ms