RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513595.1

FOXD1-201, Transcript of forkhead box D1, humanhuman

TSL 3

Gene FOXD1, Length 406 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD1-201ENST00000513595 ABCC1P33527 1531 aa20.74■□□□□ 0.91
FOXD1-201ENST00000513595 FMN1Q68DA7 1419 aa20.72■□□□□ 0.91
FOXD1-201ENST00000513595 A2ML1A8K2U0 1454 aa20.71■□□□□ 0.91
FOXD1-201ENST00000513595 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.7■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP20.7■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 NEURL4Q96JN8 1562 aa20.69■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 VWDEQ8N2E2 1590 aa20.68■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.68■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 ITSN2Q9NZM3 1697 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 GGT6Q6P531 493 aa20.67■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP20.67■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 UPF1Q92900 1129 aaKnown RBP eCLIP20.65■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP20.64■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.64■□□□□ 0.9
FOXD1-201ENST00000513595 ANKLE2Q86XL3 938 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 PREX2Q70Z35 1606 aa20.64■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 FYCO1Q9BQS8 1478 aa20.62■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa20.62■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 CAPN15O75808 1086 aa20.62■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 DSG3P32926 999 aa20.62■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 APLP2Q06481 763 aa20.62■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 A2MP01023 1474 aa20.61■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 LRRC7Q96NW7 1537 aa20.6■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 PLXNC1O60486 1568 aa20.59■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP20.58■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP20.58■□□□□ 0.89
FOXD1-201ENST00000513595 MAP3K1Q13233 1512 aa20.58■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP20.57■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP20.57■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 TNRQ92752 1358 aa20.56■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 MED14O60244 1454 aa20.56■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP20.55■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 ATP7AQ04656 1500 aa20.54■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SYNMO15061 1565 aa20.53■□□□□ 0.88
FOXD1-201ENST00000513595 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.52■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.52■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM52Q96A61 297 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 STRCP1A6NGW2 1772 aa20.51■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 TIAM1Q13009 1591 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 CCDC18Q5T9S5 1454 aa20.49■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP20.48■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 DEPDC5O75140 1603 aa20.48■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa20.47■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 IQGAP1P46940 1657 aa20.46■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP20.46■□□□□ 0.87
FOXD1-201ENST00000513595 MIA2Q96PC5 1412 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 PZPP20742 1482 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.45■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 NLRP1Q9C000 1473 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 FAM135BQ49AJ0 1406 aa20.44■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 UGGT1Q9NYU2 1555 aa20.43■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP20.42■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP20.41■□□□□ 0.86
FOXD1-201ENST00000513595 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa20.39■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.38■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.38■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP20.38■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 KIF3BO15066 747 aa20.37■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.36■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP20.35■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa20.35■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP20.34■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP20.34■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 ROBO1Q9Y6N7 1651 aa20.34■□□□□ 0.85
FOXD1-201ENST00000513595 MTUS2Q5JR59 1369 aa20.33■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa20.32■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 CCNB3Q8WWL7 1395 aa20.32■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 JCADQ9P266 1359 aa20.31■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP20.3■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 RXRBP28702 533 aa20.3■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 MBD5Q9P267 1494 aa20.29■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
FOXD1-201ENST00000513595 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP20.26■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP20.24■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 LRP6O75581 1613 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 LTKP29376 864 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 ZNF219Q9P2Y4 722 aaPredicted RBP20.24■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 PHLPP1O60346 1717 aa20.24■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 TMEM94Q12767 1356 aa20.23■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 TXNDC2Q86VQ3 553 aa20.23■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 SAMD1Q6SPF0 538 aaPredicted RBP20.22■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 ZRANB1Q9UGI0 708 aa20.22■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 ABCB7O75027 752 aa20.21■□□□□ 0.83
FOXD1-201ENST00000513595 CDK12Q9NYV4 1490 aaPredicted RBP20.19■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP20.19■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 NCOA2Q15596 1464 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 ARHGAP23Q9P227 1491 aa20.18■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP20.17■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 ERVK-7P63135 1459 aa20.17■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 NUTM2BA6NNL0 878 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 NUTM2EB1AL46 878 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 KCNA6P17658 529 aa20.16■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.16■□□□□ 0.82
FOXD1-201ENST00000513595 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 22.9 ms