RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000512194.1

HERC3-210, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 836 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-210ENST00000512194 EVI5O60447 810 aa12.51□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP12.48□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 OSBPP22059 807 aa12.48□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 IFT140Q96RY7 1462 aa12.47□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 TMEM132AQ24JP5 1023 aa12.47□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP12.47□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP12.46□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 CYB5RLQ6IPT4 315 aa12.46□□□□□ -0.41
HERC3-210ENST00000512194 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP12.45□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 DDX12PQ92771 950 aa12.45□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 AK7Q96M32 723 aa12.45□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 TOPBP1Q92547 1522 aa12.44□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP12.42□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 GPR37O15354 613 aa12.42□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 NUTM2FA1L443 756 aa12.41□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 NEUROD2Q15784 382 aa12.4□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 PCDHGA4Q9Y5G9 962 aa12.4□□□□□ -0.42
HERC3-210ENST00000512194 PHF14O94880 888 aa12.38□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 EPAS1Q99814 870 aa12.38□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 FCHSD2O94868 740 aa12.37□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 DNMBPQ6XZF7 1577 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP12.36□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 HIC1Q14526 733 aa12.36□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP12.36□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 POTEJP0CG39 1038 aa12.35□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 CLASP1Q7Z460 1538 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 GNPATO15228 680 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 MAMSTRQ6ZN01 415 aa12.34□□□□□ -0.43
HERC3-210ENST00000512194 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 MAP2K5Q13163 448 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 DOK7Q18PE1 504 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 SCUBE2Q9NQ36 999 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 CCDC88BA6NC98 1476 aa12.33□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 POTEB2H3BUK9 544 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 TRIM66O15016 1216 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP12.32□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 PTGDRQ13258 359 aa12.32□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 SLAIN1Q8ND83 568 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa12.3□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 IRF6O14896 467 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 RIMBP2O15034 1052 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 TYW1BQ6NUM6 668 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 FBXW7Q969H0 707 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 JPH4Q96JJ6 628 aa12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP12.29□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP12.28□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa12.28□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 ABCC8Q09428 1581 aa12.27□□□□□ -0.44
HERC3-210ENST00000512194 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP12.27□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 PDE4DQ08499 809 aa12.27□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 MAP3K7O43318 606 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa12.26□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 CCDC102AQ96A19 550 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa12.25□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 FOSBP53539 338 aa12.24□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 FECHP22830 423 aa12.23□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP12.23□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 SYNJ1O43426 1573 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 ARSIQ5FYB1 569 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 GPR153Q6NV75 609 aa12.22□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP12.22□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 NUDT7P0C024 238 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 AMHR2Q16671 573 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 ZNF710Q8N1W2 664 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 KDM4CQ9H3R0 1056 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 CDHR5Q9HBB8 845 aa12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP12.21□□□□□ -0.45
HERC3-210ENST00000512194 WDR97A6NE52 1622 aa12.21□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP12.2□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 CERKQ8TCT0 537 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 ZDHHC16Q969W1 377 aa12.2□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 PBRM1Q86U86 1689 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP12.19□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 ZNF454Q8N9F8 522 aa12.19□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 SNPHO15079 494 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP12.18□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 KIF13AQ9H1H9 1805 aa12.18□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 ERCC6L2Q5T890 1561 aa12.17□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 ERICH6Q7L0X2 663 aa12.16□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 GAPVD1Q14C86 1478 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 FGD5Q6ZNL6 1462 aa12.15□□□□□ -0.46
HERC3-210ENST00000512194 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP12.15□□□□□ -0.46
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HERC3-210ENST00000512194 SOGA1O94964 1423 aa12.14□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 CUX1P39880 1505 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP12.12□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 SYNJ2O15056 1496 aa12.12□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 PARP9Q8IXQ6 854 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 IL27Q8NEV9 243 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 ADAM33Q9BZ11 813 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 LHX6Q9UPM6 363 aa12.11□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 GRIN2BQ13224 1484 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa12.1□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP12.09□□□□□ -0.47
HERC3-210ENST00000512194 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
HERC3-210ENST00000512194 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP12.08□□□□□ -0.48
HERC3-210ENST00000512194 DDRGK1Q96HY6 314 aa12.08□□□□□ -0.48
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