RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000511028.1

SPATA18-209, Transcript of spermatogenesis associated 18, human

TSL 2

Gene SPATA18, Length 1,919 nt, Biotype retained intron.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SPATA18-209	ENST00000511028	DHX29	Q7Z478	1369 aa	Known RBP	32.71	■■■□□ 2.83
SPATA18-209	ENST00000511028	DIP2B	Q9P265	1576 aa		32.69	■■■□□ 2.82
SPATA18-209	ENST00000511028	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SPATA18-209	ENST00000511028	HECW2	Q9P2P5	1572 aa		32.67	■■■□□ 2.82
SPATA18-209	ENST00000511028	FAM69C	Q0P6D2	419 aa		32.64	■■■□□ 2.82
SPATA18-209	ENST00000511028	CCDC144A	A2RUR9	1427 aa		32.64	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	KIF3B	O15066	747 aa		32.62	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	HIRIP3	Q9BW71	556 aa	Predicted RBP	32.62	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	NBPF8	Q3BBV2	869 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	KANK1	Q14678	1352 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	A2M	P01023	1474 aa		32.61	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	PLA2R1	Q13018	1463 aa		32.6	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	MIER1	Q8N108	512 aa		32.59	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	ATP10A	O60312	1499 aa		32.58	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	PRDM15	P57071	1507 aa	Predicted RBP	32.58	■■■□□ 2.81
SPATA18-209	ENST00000511028	VWDE	Q8N2E2	1590 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	RAPGEF3	O95398	923 aa		32.57	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	RICTOR	Q6R327	1708 aa		32.56	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028		E9PCH4	1651 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	TET3	O43151	1660 aa		32.55	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	MROH1	Q8NDA8	1641 aa		32.54	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	ABCA6	Q8N139	1617 aa		32.53	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	EIF4G2	P78344	907 aa	Known RBP eCLIP	32.53	■■■□□ 2.8
SPATA18-209	ENST00000511028	FRMPD1	Q5SYB0	1578 aa		32.5	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	HSPA5	P11021	654 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	UHRF1BP1	Q6BDS2	1440 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	RNF17	Q9BXT8	1623 aa	Known RBP	32.49	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	TSPOAP1	O95153	1857 aa		32.49	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	ZNF326	Q5BKZ1	582 aa	Known RBP	32.47	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	PPRC1	Q5VV67	1664 aa	Known RBP	32.46	■■■□□ 2.79
SPATA18-209	ENST00000511028	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	BCORL1	Q5H9F3	1711 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	DCAF11	Q8TEB1	546 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	DIP2C	Q9Y2E4	1556 aa		32.44	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	DDX10	Q13206	875 aa	Known RBP	32.43	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	TRPM2	O94759	1503 aa		32.43	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	PTPRT	O14522	1441 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	KDM2A	Q9Y2K7	1162 aa		32.41	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	KIF13A	Q9H1H9	1805 aa		32.39	■■■□□ 2.78
SPATA18-209	ENST00000511028	LMTK2	Q8IWU2	1503 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	RALGAPB	Q86X10	1494 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	RGL3	Q3MIN7	710 aa		32.38	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	ZMYM4	Q5VZL5	1548 aa		32.37	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	CEP152	O94986	1710 aa		32.36	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	SPATA31E1	Q6ZUB1	1445 aa		32.34	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	YEATS2	Q9ULM3	1422 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	GGT6	Q6P531	493 aa		32.33	■■■□□ 2.77
SPATA18-209	ENST00000511028	CLTCL1	P53675	1640 aa		32.31	■■■□□ 2.76
SPATA18-209	ENST00000511028	PRAG1	Q86YV5	1406 aa		32.29	■■■□□ 2.76
SPATA18-209	ENST00000511028	USP47	Q96K76	1375 aa		32.27	■■■□□ 2.76
SPATA18-209	ENST00000511028	WASHC2A	Q641Q2	1341 aa		32.26	■■■□□ 2.76
SPATA18-209	ENST00000511028	TRPM1	Q7Z4N2	1603 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPATA18-209	ENST00000511028	ABCC3	O15438	1527 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPATA18-209	ENST00000511028	WASHC2C	Q9Y4E1	1318 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPATA18-209	ENST00000511028	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		32.24	■■■□□ 2.75
SPATA18-209	ENST00000511028	ROCK2	O75116	1388 aa	Known RBP	32.21	■■■□□ 2.75
SPATA18-209	ENST00000511028	POLR1A	O95602	1720 aa	Predicted RBP	32.2	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	NEURL4	Q96JN8	1562 aa		32.19	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	NPAT	Q14207	1427 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	CAMSAP1	Q5T5Y3	1602 aa		32.18	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	CCDC7	Q96M83	1385 aa		32.17	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	ZC3H13	Q5T200	1668 aa	Known RBP	32.17	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	32.15	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	KIF1B	O60333	1816 aa		32.15	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	STAC3	Q96MF2	364 aa		32.14	■■■□□ 2.74
SPATA18-209	ENST00000511028	RERE	Q9P2R6	1566 aa		32.13	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	ANP32C	O43423	234 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	GPRASP1	Q5JY77	1395 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	LAMC1	P11047	1609 aa		32.1	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	YTHDC1	Q96MU7	727 aa	Known RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	COL17A1	Q9UMD9	1497 aa	Predicted RBP	32.09	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	MADD	Q8WXG6	1647 aa		32.09	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	KIF7	Q2M1P5	1343 aa		32.08	■■■□□ 2.73
SPATA18-209	ENST00000511028	CFAP65	Q6ZU64	1925 aa	Known RBP	32.07	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	CENPB	P07199	599 aa	Predicted RBP	32.06	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	NBPF1	Q3BBV0	1214 aa		32.06	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	ARHGAP31	Q2M1Z3	1444 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	AGL	P35573	1532 aa		32.05	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	ARHGEF40	Q8TER5	1519 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	MROH2A	A6NES4	1674 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	NOS1	P29475	1434 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	ST20-MTHFS	A0A0A6YYL1	179 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	SIGLEC1	Q9BZZ2	1709 aa		32.02	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	ARID4B	Q4LE39	1312 aa	Predicted RBP	32.01	■■■□□ 2.72
SPATA18-209	ENST00000511028	ADGRB3	O60242	1522 aa		32	■■■□□ 2.71
SPATA18-209	ENST00000511028	MYOM2	P54296	1465 aa		31.98	■■■□□ 2.71
SPATA18-209	ENST00000511028	IFT172	Q9UG01	1749 aa		31.97	■■■□□ 2.71
SPATA18-209	ENST00000511028	SYNM	O15061	1565 aa		31.95	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	CHGA	P10645	457 aa	Known RBP	31.94	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	PPP6R1	Q9UPN7	881 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	PIK3C2B	O00750	1634 aa		31.94	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	CCER2	I3L3R5	266 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	KIAA1210	Q9ULL0	1709 aa		31.92	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	POLR3GL	Q9BT43	218 aa		31.9	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	PREX1	Q8TCU6	1659 aa		31.89	■■■□□ 2.7
SPATA18-209	ENST00000511028	IQGAP1	P46940	1657 aa		31.85	■■■□□ 2.69
SPATA18-209	ENST00000511028	PPL	O60437	1756 aa		31.85	■■■□□ 2.69

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