RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504624.1

PDE4D-211, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 300 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-211ENST00000504624 A0A0G2JS52 829 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 DPYSL4O14531 572 aa6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP6.24□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 IFFO2Q5TF58 517 aa6.23□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 TYW1BQ6NUM6 668 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 FBXW7Q969H0 707 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 WDR70Q9NW82 654 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.22□□□□□ -1.41
PDE4D-211ENST00000504624 CAMK2BQ13554 666 aa6.21□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 PROX2Q3B8N5 592 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 DDX12PQ92771 950 aa6.2□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 PHF14O94880 888 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 BCAMP50895 628 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 E2F4Q16254 413 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa6.19□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 COL9A1P20849 921 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.18□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 EPAS1Q99814 870 aa6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.16□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 KCNC4Q03721 635 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 LRCH3Q96II8 777 aa6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
PDE4D-211ENST00000504624 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 ITGBL1O95965 494 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 Q6ZNB5 142 aa6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.14□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 PLCB2Q00722 1185 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 WBP1LQ9NX94 342 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 HPS5Q9UPZ3 1129 aa6.13□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 PACS2Q86VP3 889 aa6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.12□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 MAP3K7O43318 606 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 HAP1P54257 671 aaPredicted RBP6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 NBR1Q14596 966 aa6.11□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 PDIA6Q15084 440 aa6.1□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.1□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 SPDYE16A6NNV3 312 aaPredicted RBP6.09□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 PPP4CP60510 307 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 KCNV2Q8TDN2 545 aa6.09□□□□□ -1.43
PDE4D-211ENST00000504624 RNF40O75150 1001 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.07□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 LAPTM4AQ15012 233 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa6.07□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 OSBPP22059 807 aa6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP6.06□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 NBPF26B4DH59 902 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.04□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 SMAPO00193 183 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 SEMA3EO15041 775 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 GFRA3O60609 400 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 SLC4A3P48751 1232 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 CERKQ8TCT0 537 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.03□□□□□ -1.44
PDE4D-211ENST00000504624 C3orf80F5H4A9 247 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 PRSS12P56730 875 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 TSKSQ9UJT2 592 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 PNMA3Q9UL41 463 aa6.02□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 PRKD2Q9BZL6 878 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 IL21Q9HBE4 155 aa6.01□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 NECTIN2Q92692 538 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 MTRQ99707 1265 aa6□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 GGCXP38435 758 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 TATDN2Q93075 761 aa5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.99□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 TJAP1Q5JTD0 557 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 TRAF7Q6Q0C0 670 aa5.98□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 NUTM2FA1L443 756 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 NRG2O14511 850 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 NUDT18Q6ZVK8 323 aa5.97□□□□□ -1.45
PDE4D-211ENST00000504624 FAM161AQ3B820 660 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 PPP1R18Q6NYC8 613 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 SLF2Q8IX21 1173 aa5.96□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 P3H3Q8IVL6 736 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 EIF4ENIF1Q9NRA8 985 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 V9GY48 417 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 COPS2P61201 443 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 PADI6Q6TGC4 694 aa5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 APLP1P51693 650 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 PRR14Q9BWN1 585 aa5.93□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP5.92□□□□□ -1.46
PDE4D-211ENST00000504624 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.92□□□□□ -1.46
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