RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489845.1

DCLRE1C-215, Transcript of DNA cross-link repair 1C, humanhuman

TSL 3

Gene DCLRE1C, Length 294 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DCLRE1C-215ENST00000489845 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.61□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 ERBB3P21860 1342 aa6.6□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.6□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 EPAS1Q99814 870 aa6.6□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 ZMYND10O75800 440 aa6.59□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 PSEN2P49810 448 aa6.59□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 PTGDRQ13258 359 aa6.59□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 HS3ST6Q96QI5 342 aa6.59□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 SLC24A3Q9HC58 644 aa6.59□□□□□ -1.35
DCLRE1C-215ENST00000489845 C3orf80F5H4A9 247 aa6.58□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM161AQ3B820 660 aa6.58□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.58□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa6.57□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.57□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 BARGINQ6ZT62 677 aa6.56□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 FBXW7Q969H0 707 aa6.56□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 KCNK17Q96T54 332 aa6.56□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 BCL2L12Q9HB09 334 aa6.56□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 PROX2Q3B8N5 592 aa6.55□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 GNPATO15228 680 aa6.54□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 FCHSD2O94868 740 aa6.54□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 PADI6Q6TGC4 694 aa6.54□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 NLRP7Q8WX94 980 aa6.53□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 TSKSQ9UJT2 592 aa6.53□□□□□ -1.36
DCLRE1C-215ENST00000489845 PTPREP23469 700 aa6.52□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 HIC1Q14526 733 aa6.52□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 ZNF687Q8N1G0 1237 aa6.52□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 PHOX2BQ99453 314 aa6.52□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 CCDC102AQ96A19 550 aa6.51□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.51□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 SMAPO00193 183 aa6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 PRSS12P56730 875 aa6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 TTC13Q8NBP0 860 aa6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.5□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 ARHGAP33O14559 1287 aa6.49□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 MAP2K5Q13163 448 aa6.49□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 POTEGQ6S5H5 508 aa6.49□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.49□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.49□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 POTEMA6NI47 508 aa6.48□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 IRF6O14896 467 aa6.48□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.48□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.47□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 TRIM66O15016 1216 aa6.47□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP6.47□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP6.47□□□□□ -1.37
DCLRE1C-215ENST00000489845 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.46□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.46□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.46□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 BRPF1P55201 1214 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.45□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 AK7Q96M32 723 aa6.45□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.45□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6.44□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 CERKQ8TCT0 537 aa6.44□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 EYA1Q99502 592 aa6.44□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 PDE4DQ08499 809 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 CDAN1Q8IWY9 1227 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 TATDN2Q93075 761 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 PNMA3Q9UL41 463 aa6.43□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 PBX2P40425 430 aa6.42□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.42□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.42□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 HRO43593 1189 aa6.41□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP6.41□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 NEUROD2Q15784 382 aa6.41□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 PARP9Q8IXQ6 854 aa6.41□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 RCCD1A6NED2 376 aa6.4□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 TMUB1Q9BVT8 246 aa6.4□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 SLC4A5Q9BY07 1137 aa6.4□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.4□□□□□ -1.38
DCLRE1C-215ENST00000489845 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.39□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 AMHR2Q16671 573 aa6.39□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 MS4A1P11836 297 aa6.38□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 PACS2Q86VP3 889 aa6.38□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 KCNH8Q96L42 1107 aa6.38□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 KDM4CQ9H3R0 1056 aa6.38□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 NISCHQ9Y2I1 1504 aa6.37□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 NBPF26B4DH59 902 aa6.37□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 OATP04181 439 aa6.37□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 TK2O00142 265 aa6.36□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP6.36□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 FAM117AQ9C073 453 aa6.35□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.35□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.34□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 GPCPD1Q9NPB8 672 aa6.34□□□□□ -1.39
DCLRE1C-215ENST00000489845 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
DCLRE1C-215ENST00000489845 PLEKHG3A1L390 1219 aa6.33□□□□□ -1.4
DCLRE1C-215ENST00000489845 SLC10A3P09131 477 aa6.33□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 21.8 ms