RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488277.1

EPB41-211, Transcript of erythrocyte membrane protein band 4.1, humanhuman

TSL 3

Gene EPB41, Length 262 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41-211ENST00000488277 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.06□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 PBX2P40425 430 aa6.05□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 POTEEQ6S8J3 1075 aa6.05□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 ARHGAP33O14559 1287 aa6.04□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 PSEN2P49810 448 aa6.04□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.04□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 NUTM2FA1L443 756 aa6.03□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.03□□□□□ -1.44
EPB41-211ENST00000488277 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa6.02□□□□□ -1.45
EPB41-211ENST00000488277 COL9A1P20849 921 aa6.02□□□□□ -1.45
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EPB41-211ENST00000488277 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.02□□□□□ -1.45
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EPB41-211ENST00000488277 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP6□□□□□ -1.45
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EPB41-211ENST00000488277 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP5.98□□□□□ -1.45
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EPB41-211ENST00000488277 ADGRG1Q9Y653 693 aa5.89□□□□□ -1.47
EPB41-211ENST00000488277 GOLGA8CPA6NN73 597 aa5.88□□□□□ -1.47
EPB41-211ENST00000488277 MAP2K5Q13163 448 aa5.88□□□□□ -1.47
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EPB41-211ENST00000488277 MYT1LQ9UL68 1186 aa5.87□□□□□ -1.47
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EPB41-211ENST00000488277 CCDC102AQ96A19 550 aa5.86□□□□□ -1.47
EPB41-211ENST00000488277 EYA1Q99502 592 aa5.86□□□□□ -1.47
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EPB41-211ENST00000488277 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP5.84□□□□□ -1.47
EPB41-211ENST00000488277 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP5.84□□□□□ -1.47
EPB41-211ENST00000488277 SLC24A3Q9HC58 644 aa5.84□□□□□ -1.47
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EPB41-211ENST00000488277 HDGFP51858 240 aaKnown RBP5.83□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 MMRN1Q13201 1228 aa5.83□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP5.82□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 SAMD7Q7Z3H4 446 aa5.82□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 NLRP7Q8WX94 980 aa5.82□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 LRCH3Q96II8 777 aa5.82□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 PHOX2BQ99453 314 aa5.82□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 RNF40O75150 1001 aa5.81□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 BCAMP50895 628 aa5.81□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 AK7Q96M32 723 aa5.81□□□□□ -1.48
EPB41-211ENST00000488277 TMEM134Q9H6X4 195 aa5.81□□□□□ -1.48
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