RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488243.1

NISCH-211, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 584 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-211ENST00000488243 CROCC2H7BZ55 1655 aa17.6■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 ADGRL2O95490 1459 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP17.59■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 UBAP1LF5GYI3 381 aa17.59■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa17.58■□□□□ 0.41
NISCH-211ENST00000488243 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP17.58■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 CNTLNQ9NXG0 1405 aa17.57■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 ITGAEP38570 1179 aa17.56■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 PTPRKQ15262 1439 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa17.55■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP17.54■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 ADGBQ8N7X0 1667 aa17.54■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 PLXNC1O60486 1568 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP17.53■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 HFM1A2PYH4 1435 aa17.53■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 ATP7AQ04656 1500 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 PCGF6Q9BYE7 350 aa17.52■□□□□ 0.4
NISCH-211ENST00000488243 ZMYM3Q14202 1370 aa17.52■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 HRCP23327 699 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 CHIC2Q9UKJ5 165 aa17.51■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 NPATQ14207 1427 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 MROH2AA6NES4 1674 aa17.5■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 DUOX2Q9NRD8 1548 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 KIF15Q9NS87 1388 aa17.48■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP17.48■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 NAIPQ13075 1403 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 SETD5Q9C0A6 1442 aa17.47■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 ERBINQ96RT1 1412 aa17.46■□□□□ 0.39
NISCH-211ENST00000488243 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 PKD2Q13563 968 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 GGT6Q6P531 493 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 MYO3AQ8NEV4 1616 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 GCC2Q8IWJ2 1684 aa17.45■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 HSPA1LP34931 641 aa17.44■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP17.43■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 A2MP01023 1474 aa17.43■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP17.42■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP17.42■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 PLA2R1Q13018 1463 aa17.41■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 PIP4K2BP78356 416 aa17.4■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP17.39■□□□□ 0.38
NISCH-211ENST00000488243 PPP6R1Q9UPN7 881 aa17.39■□□□□ 0.37
NISCH-211ENST00000488243 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa17.38■□□□□ 0.37
NISCH-211ENST00000488243 TOM1O60784 492 aa17.36■□□□□ 0.37
NISCH-211ENST00000488243 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP17.35■□□□□ 0.37
NISCH-211ENST00000488243 A2ML1A8K2U0 1454 aa17.33■□□□□ 0.37
NISCH-211ENST00000488243 KIF3BO15066 747 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 FAM135AQ9P2D6 1515 aa17.31■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 KANK1Q14678 1352 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP17.3■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 UNC13BO14795 1591 aa17.3■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 DEPDC5O75140 1603 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP17.29■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 CPS1P31327 1500 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 KDM5DQ9BY66 1539 aa17.29■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP17.28■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 TNRQ92752 1358 aa17.28■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 TRIM52Q96A61 297 aa17.27■□□□□ 0.36
NISCH-211ENST00000488243 NEURL4Q96JN8 1562 aa17.27■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP17.26■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 NUP155O75694 1391 aa17.26■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 VWDEQ8N2E2 1590 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 PZPP20742 1482 aa17.23■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 LMTK2Q8IWU2 1503 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 IQGAP3Q86VI3 1631 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 ANKLE2Q86XL3 938 aa17.22■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP17.22■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 MROH1Q8NDA8 1641 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 ALKQ9UM73 1620 aa17.21■□□□□ 0.35
NISCH-211ENST00000488243 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 MPHOSPH9Q99550 1183 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP17.2■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP17.2■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 CLSPNQ9HAW4 1339 aa17.2■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP17.19■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP17.18■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 UGGT1Q9NYU2 1555 aa17.18■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP17.17■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 RGS17Q9UGC6 210 aaPredicted RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 NLRP1Q9C000 1473 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 TET3O43151 1660 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 ABCC3O15438 1527 aa17.16■□□□□ 0.34
NISCH-211ENST00000488243 MED14O60244 1454 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 IQGAP1P46940 1657 aa17.13■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 EFCAB6Q5THR3 1501 aa17.12■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP17.11■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 STRCP1A6NGW2 1772 aa17.1■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 LRRC7Q96NW7 1537 aa17.09■□□□□ 0.33
NISCH-211ENST00000488243 CEP152O94986 1710 aa17.07■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 E9PCH4 1651 aa17.05■□□□□ 0.32
NISCH-211ENST00000488243 SYNMO15061 1565 aa17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.5 ms