RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000486274.5

TBC1D23-208, Transcript of TBC1 domain family member 23, human

TSL 5

Gene TBC1D23, Length 4,054 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TBC1D23-208	ENST00000486274	TRO	Q12816	1431 aa	Predicted RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	EPRS	P07814	1512 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	UPF2	Q9HAU5	1272 aa	Known RBP	13.79	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	RCAN3	Q9UKA8	241 aa		13.79	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	C11orf95	C9JLR9	678 aa	Predicted RBP	13.78	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	RALBP1	Q15311	655 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	GGNBP2	Q9H3C7	697 aa		13.78	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	TIAM1	Q13009	1591 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	APAF1	O14727	1248 aa		13.77	□□□□□ -0.2
TBC1D23-208	ENST00000486274	TPRN	Q4KMQ1	711 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	LAMC3	Q9Y6N6	1575 aa		13.77	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYH16	Q9H6N6	1097 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF330	Q9Y3S2	320 aa	Predicted RBP	13.76	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	C9orf84	Q5VXU9	1444 aa		13.76	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBM33	Q96EV2	1170 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC12A5	Q9H2X9	1139 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC26A8	Q96RN1	970 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	NAIP	Q13075	1403 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	TERF2IP	Q9NYB0	399 aa		13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	PCF11	O94913	1555 aa	Known RBP	13.75	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	GRIN2A	Q12879	1464 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	CSB-PGBD3	P0DP91	1061 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	TAOK2	Q9UL54	1235 aa		13.74	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC7	Q96M83	1385 aa		13.73	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	TXNDC2	Q86VQ3	553 aa		13.72	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	AMPH	P49418	695 aa		13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	CEBPA	P49715	358 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	FBXO31	Q5XUX0	539 aa	Predicted RBP	13.71	□□□□□ -0.21
TBC1D23-208	ENST00000486274	DAPK1	P53355	1430 aa		13.71	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	GOLGA2	Q08379	1002 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	HFM1	A2PYH4	1435 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	IQGAP2	Q13576	1575 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	CENPJ	Q9HC77	1338 aa	Predicted RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	HMOX1	P09601	288 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDCA7L	Q96GN5	454 aa		13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	MYBBP1A	Q9BQG0	1328 aa	Known RBP	13.7	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	PMFBP1	Q8TBY8	1022 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	RTF1	Q92541	710 aa	Known RBP	13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	PTPRK	Q15262	1439 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	SPRYD3	Q8NCJ5	442 aa		13.69	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF3A	Q14152	1382 aa	Known RBP	13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	EFCAB5	A4FU69	1503 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	NECTIN2	Q92692	538 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	PRAM1	Q96QH2	718 aa		13.68	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	EVC2	Q86UK5	1308 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	ITPRIP	Q8IWB1	547 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADAMTS8	Q9UP79	889 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	WDR97	A6NE52	1622 aa		13.67	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	ABCC5	O15440	1437 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC4A10	Q6U841	1118 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	SMC4	Q9NTJ3	1288 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	EXOC6	Q8TAG9	804 aa		13.66	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	RBM19	Q9Y4C8	960 aa	Known RBP	13.65	□□□□□ -0.22
TBC1D23-208	ENST00000486274	MAGI1	Q96QZ7	1491 aa	Predicted RBP	13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	MTHFS	P49914	203 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	MIA2	Q96PC5	1412 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZNF428	Q96B54	188 aa		13.64	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	CCDC9	Q9Y3X0	531 aa	Known RBP	13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	WAPL	Q7Z5K2	1190 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	KIAA1107	Q9UPP5	1409 aa		13.63	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	CGNL1	Q0VF96	1302 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	EHBP1L1	Q8N3D4	1523 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	COG3	Q96JB2	828 aa		13.62	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	OS9	Q13438	667 aa	Predicted RBP	13.62	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	COG6	Q9Y2V7	657 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	CABP1	Q9NZU7	370 aa		13.61	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	THOC2	Q8NI27	1593 aa	Known RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	XPC	Q01831	940 aa	Predicted RBP	13.61	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	NGEF	Q8N5V2	710 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	IDI1	Q13907	227 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	TSHZ2	Q9NRE2	1034 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	ADGRF5	Q8IZF2	1346 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	NCOA1	Q15788	1441 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	CD109	Q6YHK3	1445 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	BIVM-ERCC5	R4GMW8	1640 aa		13.59	□□□□□ -0.23
TBC1D23-208	ENST00000486274	FBLN1	P23142	703 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	PNN	Q9H307	717 aa	Known RBP	13.58	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	PSME1	Q06323	249 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	CRBN	Q96SW2	442 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	HECW1	Q76N89	1606 aa		13.58	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	PLEKHH2	Q8IVE3	1493 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	USP35	Q9P2H5	1018 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	ANKRD30B	Q9BXX2	1392 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	CAMSAP2	Q08AD1	1489 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	NPHP1	O15259	732 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	RIPK4	P57078	832 aa		13.57	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	NLRP6	P59044	892 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	ATP10B	O94823	1461 aa		13.56	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	DIAPH1	O60610	1272 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	EIF2S2	P20042	333 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	PPP2R1A	P30153	589 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	CDK19	Q9BWU1	502 aa		13.54	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	ZBED9	Q6R2W3	1325 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	CNTLN	Q9NXG0	1405 aa		13.53	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	SUPT6H	Q7KZ85	1726 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	NUP153	P49790	1475 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	SLC4A3	P48751	1232 aa		13.52	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	RRS1	Q15050	365 aa	Known RBP	13.52	□□□□□ -0.24
TBC1D23-208	ENST00000486274	ESCO1	Q5FWF5	840 aa		13.52	□□□□□ -0.24

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