RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000483015.1

MIB2-211, Transcript of mindbomb E3 ubiquitin protein ligase 2, humanhuman

TSL 3

Gene MIB2, Length 1,058 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MIB2-211ENST00000483015 ABCC5O15440 1437 aa37.87■■■■□ 3.65
MIB2-211ENST00000483015 FAM135AQ9P2D6 1515 aa37.86■■■■□ 3.65
MIB2-211ENST00000483015 GGT6Q6P531 493 aa37.85■■■■□ 3.65
MIB2-211ENST00000483015 KIF3BO15066 747 aa37.81■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP37.8■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 DUOX2Q9NRD8 1548 aa37.8■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP37.79■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 NCOA1Q15788 1441 aa37.78■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa37.77■■■■□ 3.64
MIB2-211ENST00000483015 KIF15Q9NS87 1388 aa37.75■■■■□ 3.63
MIB2-211ENST00000483015 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP37.75■■■■□ 3.63
MIB2-211ENST00000483015 ERBINQ96RT1 1412 aa37.71■■■■□ 3.63
MIB2-211ENST00000483015 KDM5DQ9BY66 1539 aa37.7■■■■□ 3.63
MIB2-211ENST00000483015 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa37.69■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP37.68■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 PTPRKQ15262 1439 aa37.68■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP37.68■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 ADGRL2O95490 1459 aa37.66■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa37.64■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP37.64■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 PKD2Q13563 968 aa37.64■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa37.64■■■■□ 3.62
MIB2-211ENST00000483015 PLA2R1Q13018 1463 aa37.63■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 IQSEC2Q5JU85 1478 aa37.63■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 MYO3AQ8NEV4 1616 aa37.61■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 CHIC2Q9UKJ5 165 aa37.6■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP37.6■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 LTBP4Q8N2S1 1624 aa37.59■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP37.58■■■■□ 3.61
MIB2-211ENST00000483015 PZPP20742 1482 aa37.52■■■■□ 3.6
MIB2-211ENST00000483015 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa37.51■■■■□ 3.6
MIB2-211ENST00000483015 ROCK1Q13464 1354 aa37.51■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP37.51■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 KANK1Q14678 1352 aa37.5■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP37.5■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 A2ML1A8K2U0 1454 aa37.49■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 ABCC3O15438 1527 aa37.49■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 MROH1Q8NDA8 1641 aa37.47■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 DEPDC5O75140 1603 aa37.46■■■■□ 3.59
MIB2-211ENST00000483015 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa37.44■■■■□ 3.58
MIB2-211ENST00000483015 TNRQ92752 1358 aa37.41■■■■□ 3.58
MIB2-211ENST00000483015 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP37.36■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 ITGAEP38570 1179 aa37.34■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP37.34■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP37.34■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa37.33■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 CEP152O94986 1710 aa37.33■■■■□ 3.57
MIB2-211ENST00000483015 LMTK2Q8IWU2 1503 aa37.31■■■■□ 3.56
MIB2-211ENST00000483015 NLRP1Q9C000 1473 aa37.31■■■■□ 3.56
MIB2-211ENST00000483015 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP37.29■■■■□ 3.56
MIB2-211ENST00000483015 VWDEQ8N2E2 1590 aa37.29■■■■□ 3.56
MIB2-211ENST00000483015 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa37.28■■■■□ 3.56
MIB2-211ENST00000483015 ERVK-7P63135 1459 aa37.26■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 ANKLE2Q86XL3 938 aa37.24■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP37.24■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 DISP3Q9P2K9 1392 aa37.23■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 UNC13BO14795 1591 aa37.21■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 UBAP1LF5GYI3 381 aa37.2■■■■□ 3.55
MIB2-211ENST00000483015 UGGT1Q9NYU2 1555 aa37.18■■■■□ 3.54
MIB2-211ENST00000483015 EFCAB6Q5THR3 1501 aa37.16■■■■□ 3.54
MIB2-211ENST00000483015 NEURL4Q96JN8 1562 aa37.16■■■■□ 3.54
MIB2-211ENST00000483015 CPS1P31327 1500 aa37.15■■■■□ 3.54
MIB2-211ENST00000483015 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP37.14■■■■□ 3.54
MIB2-211ENST00000483015 MED14O60244 1454 aa37.12■■■■□ 3.53
MIB2-211ENST00000483015 TET3O43151 1660 aa37.1■■■■□ 3.53
MIB2-211ENST00000483015 IQGAP3Q86VI3 1631 aa37.06■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 GCC2Q8IWJ2 1684 aa37.05■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP37.05■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 HFM1A2PYH4 1435 aa37.04■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 NUP155O75694 1391 aa37.04■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 NAIPQ13075 1403 aa37.03■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 TOM1O60784 492 aa37.02■■■■□ 3.52
MIB2-211ENST00000483015 NOS1P29475 1434 aa37■■■■□ 3.51
MIB2-211ENST00000483015 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP36.99■■■■□ 3.51
MIB2-211ENST00000483015 SLC52A1Q9NWF4 448 aa36.97■■■■□ 3.51
MIB2-211ENST00000483015 IQGAP1P46940 1657 aa36.96■■■■□ 3.51
MIB2-211ENST00000483015 ILDR2Q71H61 639 aa36.95■■■■□ 3.51
MIB2-211ENST00000483015 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP36.93■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 STAG3Q9UJ98 1225 aa36.93■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 UBR1Q8IWV7 1749 aa36.92■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 SOCS7O14512 581 aa36.91■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP36.9■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 SYNMO15061 1565 aa36.9■■■■□ 3.5
MIB2-211ENST00000483015 PIK3C2BO00750 1634 aa36.87■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 E9PCH4 1651 aa36.86■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP36.85■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 IDI1Q13907 227 aa36.84■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 SLIT1O75093 1534 aa36.84■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP36.83■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 PIP4K2BP78356 416 aa36.83■■■■□ 3.49
MIB2-211ENST00000483015 ADGRB3O60242 1522 aa36.82■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 EID1Q9Y6B2 187 aa36.82■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 ARHGAP23Q9P227 1491 aa36.81■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 TXNDC2Q86VQ3 553 aa36.78■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 TRIM52Q96A61 297 aa36.78■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 TMEM2Q9UHN6 1383 aa36.78■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 HSPA1LP34931 641 aa36.77■■■■□ 3.48
MIB2-211ENST00000483015 LRRC7Q96NW7 1537 aa36.74■■■■□ 3.47
MIB2-211ENST00000483015 LTKP29376 864 aa36.72■■■■□ 3.47
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.7 ms