RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000462042.5

RABGGTB-205, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

TSL 3

Gene RABGGTB, Length 569 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM66O15016 1216 aa11.88□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.86□□□□□ -0.511e-9■■□□□ 11.9
RABGGTB-205ENST00000462042 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.85□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 CCDC102AQ96A19 550 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.84□□□□□ -0.51
RABGGTB-205ENST00000462042 PDE4DQ08499 809 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 LHX8Q68G74 356 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 OTUD5Q96G74 571 aa11.83□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 LHX6Q9UPM6 363 aa11.82□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 FECHP22830 423 aa11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.81□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 AMHR2Q16671 573 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.8□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.78□□□□□ -0.52
RABGGTB-205ENST00000462042 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.76□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 OATP04181 439 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 PTPREP23469 700 aa11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.74□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 PRSS12P56730 875 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNH8Q96L42 1107 aa11.72□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 PADI6Q6TGC4 694 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 TTC13Q8NBP0 860 aa11.71□□□□□ -0.53
RABGGTB-205ENST00000462042 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.7□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.69□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 CLCN1P35523 988 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.68□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.67□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP11.66□□□□□ -0.54
RABGGTB-205ENST00000462042 ERBB3P21860 1342 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 COL9A1P20849 921 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 ERICH6Q7L0X2 663 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.64□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 IL27Q8NEV9 243 aa11.63□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 PACS2Q86VP3 889 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.62□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF26B4DH59 902 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 ST18O60284 1047 aa11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 EMP3P54852 163 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 KCNK17Q96T54 332 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM117AQ9C073 453 aa11.6□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM161AQ3B820 660 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 PHOX2BQ99453 314 aa11.59□□□□□ -0.55
RABGGTB-205ENST00000462042 PBX2P40425 430 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 VARS2Q5ST30 1063 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 TSKSQ9UJT2 592 aa11.58□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 ARHGAP33O14559 1287 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.57□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 EYA1Q99502 592 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 SLC4A5Q9BY07 1137 aa11.56□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 SSTR3P32745 418 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 TATDN2Q93075 761 aa11.55□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 NUDT18Q6ZVK8 323 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 ZBED2Q9BTP6 218 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 GOPCQ9HD26 462 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 PNMA3Q9UL41 463 aa11.54□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 RCCD1A6NED2 376 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 MS4A1P11836 297 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 DNAJB2P25686 324 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 ZNF687Q8N1G0 1237 aa11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM217BQ9NTX9 383 aaPredicted RBP11.53□□□□□ -0.56
RABGGTB-205ENST00000462042 PROX2Q3B8N5 592 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 MARVELD3Q96A59 401 aa11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 FAM163AQ96GL9 167 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 RSPH6AQ9H0K4 717 aa11.51□□□□□ -0.57
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RABGGTB-205ENST00000462042 SULF1Q8IWU6 871 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 RABGEF1Q9UJ41 708 aa11.5□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 KIAA1468Q9P260 1216 aa11.49□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 DIXDC1Q155Q3 683 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 NLRP7Q8WX94 980 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 BEGAINQ9BUH8 593 aa11.48□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 TMEM134Q9H6X4 195 aa11.47□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 POTEEQ6S8J3 1075 aa11.46□□□□□ -0.57
RABGGTB-205ENST00000462042 SH3D19Q5HYK7 790 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 HS3ST6Q96QI5 342 aa11.45□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 HDGFP51858 240 aaKnown RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 RSPH4AQ5TD94 716 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 AXIN2Q9Y2T1 843 aa11.44□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 C3orf80F5H4A9 247 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 TK2O00142 265 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 DMRTA1Q5VZB9 504 aa11.43□□□□□ -0.58
RABGGTB-205ENST00000462042 NBPF3Q9H094 633 aa11.43□□□□□ -0.58
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