RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000459646.1

SH3BP1-204, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP1, Length 330 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-204ENST00000459646 NCOA1Q15788 1441 aa13.44□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 DISP3Q9P2K9 1392 aa13.42□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 PKD2Q13563 968 aa13.41□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP13.4□□□□□ -0.26
SH3BP1-204ENST00000459646 TNRQ92752 1358 aa13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP13.39□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 KDM5DQ9BY66 1539 aa13.38□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 MYOM3Q5VTT5 1437 aa13.37□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 A2ML1A8K2U0 1454 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 LTBP4Q8N2S1 1624 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 MAP3K1Q13233 1512 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 UBAP1LF5GYI3 381 aa13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP13.36□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKLE2Q86XL3 938 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP13.35□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 CEP152O94986 1710 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 MIA2Q96PC5 1412 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 CHIC2Q9UKJ5 165 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 PZPP20742 1482 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 PLA2R1Q13018 1463 aa13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP13.34□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.33□□□□□ -0.27
SH3BP1-204ENST00000459646 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 PTPN23Q9H3S7 1636 aa13.32□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa13.31□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM135AQ9P2D6 1515 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP13.3□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 DUOX2Q9NRD8 1548 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 PIP4K2BP78356 416 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 KIF15Q9NS87 1388 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 IQSEC2Q5JU85 1478 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCC3O15438 1527 aa13.29□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 CROCC2H7BZ55 1655 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 STAG3Q9UJ98 1225 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 NLRP1Q9C000 1473 aa13.28□□□□□ -0.28
SH3BP1-204ENST00000459646 KANK1Q14678 1352 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ABCC5O15440 1437 aa13.27□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 DAPK1P53355 1430 aa13.26□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 FGD6Q6ZV73 1430 aa13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP13.25□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 NEURL4Q96JN8 1562 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ERVK-7P63135 1459 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 SHANK2Q9UPX8 1470 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 TOM1O60784 492 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.24□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 IQGAP1P46940 1657 aa13.23□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 ERBINQ96RT1 1412 aa13.22□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 EID1Q9Y6B2 187 aa13.21□□□□□ -0.29
SH3BP1-204ENST00000459646 DEPDC5O75140 1603 aa13.21□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 CPS1P31327 1500 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 BCANQ96GW7 911 aa13.2□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ITGAEP38570 1179 aa13.19□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.18□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 PIK3C2BO00750 1634 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 MED14O60244 1454 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 LTKP29376 864 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 HSPA1LP34931 641 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 STRCP1A6NGW2 1772 aa13.17□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP13.16□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 IDI1Q13907 227 aa13.15□□□□□ -0.3
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 CHGAP10645 457 aaKnown RBP13.14□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC26A8Q96RN1 970 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa13.12□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 MYO5BQ9ULV0 1848 aa13.11□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 TMEM2Q9UHN6 1383 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 SLIT1O75093 1534 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 EFCAB6Q5THR3 1501 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 ADGRL2O95490 1459 aa13.1□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 SYNMO15061 1565 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 PHF23Q9BUL5 403 aaPredicted RBP13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 SLC52A1Q9NWF4 448 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 ARHGAP23Q9P227 1491 aa13.09□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 LMTK2Q8IWU2 1503 aa13.08□□□□□ -0.31
SH3BP1-204ENST00000459646 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP13.08□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 HDGFP51858 240 aaKnown RBP13.07□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 TET3O43151 1660 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 GCC2Q8IWJ2 1684 aa13.06□□□□□ -0.32
SH3BP1-204ENST00000459646 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP13.06□□□□□ -0.32
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