RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436072.6

SFRP4-201, Transcript of secreted frizzled related protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SFRP4, Length 2,966 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP4-201ENST00000436072 NUP155O75694 1391 aa20.61■□□□□ 0.89
SFRP4-201ENST00000436072 C9orf84Q5VXU9 1444 aa20.61■□□□□ 0.89
SFRP4-201ENST00000436072 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa20.61■□□□□ 0.89
SFRP4-201ENST00000436072 PDE4AP27815 886 aa20.6■□□□□ 0.89
SFRP4-201ENST00000436072 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
SFRP4-201ENST00000436072 PLIN1O60240 522 aa20.58■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 ADGBQ8N7X0 1667 aa20.57■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP20.56■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP20.56■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 KIF15Q9NS87 1388 aa20.55■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 CROCC2H7BZ55 1655 aa20.55■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 RCAN3Q9UKA8 241 aa20.55■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 CARD11Q9BXL7 1154 aa20.54■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 ADGRL2O95490 1459 aa20.54■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 CDCA7LQ96GN5 454 aa20.53■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa20.53■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 BCORL1Q5H9F3 1711 aa20.52■□□□□ 0.88
SFRP4-201ENST00000436072 SLC4A3P48751 1232 aa20.52■□□□□ 0.87
SFRP4-201ENST00000436072 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa20.51■□□□□ 0.87
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SFRP4-201ENST00000436072 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa20.48■□□□□ 0.87
SFRP4-201ENST00000436072 MBD5Q9P267 1494 aa20.48■□□□□ 0.87
SFRP4-201ENST00000436072 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa20.48■□□□□ 0.87
SFRP4-201ENST00000436072 TTC37Q6PGP7 1564 aa20.47■□□□□ 0.87
SFRP4-201ENST00000436072 SYCP2Q9BX26 1530 aa20.45■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC141Q6ZP82 1450 aa20.44■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 SHROOM2Q13796 1616 aa20.44■□□□□ 0.86
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SFRP4-201ENST00000436072 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.43■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP20.43■□□□□ 0.86
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SFRP4-201ENST00000436072 SHANK2Q9UPX8 1470 aa20.43■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 CRBNQ96SW2 442 aa20.42■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 ABCC2Q92887 1545 aa20.42■□□□□ 0.86
SFRP4-201ENST00000436072 PREX2Q70Z35 1606 aa20.41■□□□□ 0.86
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SFRP4-201ENST00000436072 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP20.37■□□□□ 0.85
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SFRP4-201ENST00000436072 C20orf194Q5TEA3 1177 aa20.37■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 ARHGEF5Q12774 1597 aa20.37■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP20.36■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 RSPH4AQ5TD94 716 aa20.36■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 MS4A1P11836 297 aa20.34■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 USP35Q9P2H5 1018 aa20.34■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 AFAP1Q8N556 730 aa20.34■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa20.33■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP20.33■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP20.33■□□□□ 0.85
SFRP4-201ENST00000436072 KDM5CP41229 1560 aa20.32■□□□□ 0.84
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SFRP4-201ENST00000436072 NLRP13Q86W25 1043 aa20.32■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP20.32■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 FAM135AQ9P2D6 1515 aa20.32■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 MYO5CQ9NQX4 1742 aa20.31■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 CLASP1Q7Z460 1538 aa20.3■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 GSE1Q14687 1217 aa20.29■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa20.29■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP20.28■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP20.28■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 NBPF1Q3BBV0 1214 aa20.28■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 CCDC144AA2RUR9 1427 aa20.27■□□□□ 0.84
SFRP4-201ENST00000436072 PLCH2O75038 1416 aa20.27■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa20.27■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 PDE3BQ13370 1112 aa20.26■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 DDRGK1Q96HY6 314 aa20.26■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP20.25■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 RGS3P49796 1198 aa20.25■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 KDM5DQ9BY66 1539 aa20.24■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP20.23■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 RALGAPBQ86X10 1494 aa20.22■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 PANK3Q9H999 370 aa20.21■□□□□ 0.83
SFRP4-201ENST00000436072 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SFRP4-201ENST00000436072 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP20.2■□□□□ 0.82
SFRP4-201ENST00000436072 PLA2R1Q13018 1463 aa20.19■□□□□ 0.82
SFRP4-201ENST00000436072 ADAMTS8Q9UP79 889 aa20.19■□□□□ 0.82
SFRP4-201ENST00000436072 PARD3Q8TEW0 1356 aa20.18■□□□□ 0.82
SFRP4-201ENST00000436072 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa20.18■□□□□ 0.82
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SFRP4-201ENST00000436072 C8orf34Q49A92 452 aa20.13■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 FAM161AQ3B820 660 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 KIF3BO15066 747 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 KDM2BQ8NHM5 1336 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 DISP3Q9P2K9 1392 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 WDR7Q9Y4E6 1490 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 UNC13BO14795 1591 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 PLXNC1O60486 1568 aa20.12■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 PRAG1Q86YV5 1406 aa20.1■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 FANCAO15360 1455 aa20.1■□□□□ 0.81
SFRP4-201ENST00000436072 SCAPERQ9BY12 1400 aa20.1■□□□□ 0.81
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