RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000435136.6

SH3BP2-202, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene SH3BP2, Length 2,318 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-202ENST00000435136 POGZQ7Z3K3 1410 aa26.32■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP26.3■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM4FA0A1W2PPD8 638 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa26.29■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa26.28■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 YEATS2Q9ULM3 1422 aa26.27■■□□□ 1.8
SH3BP2-202ENST00000435136 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP26.26■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.25■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 NBPF8Q3BBV2 869 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa26.23■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP10AO60312 1499 aa26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 MYT1LQ9UL68 1186 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP26.21■■□□□ 1.79
SH3BP2-202ENST00000435136 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 DEPDC5O75140 1603 aa26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 ATP7AQ04656 1500 aa26.19■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 RALGAPBQ86X10 1494 aa26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM5CP41229 1560 aa26.17■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 CCER2I3L3R5 266 aa26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC144AA2RUR9 1427 aa26.14■■□□□ 1.78
SH3BP2-202ENST00000435136 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa26.14■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 ANP32CO43423 234 aa26.13■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 AEBP2Q6ZN18 517 aaPredicted RBP26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 WASHC2AQ641Q2 1341 aa26.12■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 PLA2R1Q13018 1463 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 MLH3Q9UHC1 1453 aa26.11■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 CCDC7Q96M83 1385 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 VWDEQ8N2E2 1590 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa26.08■■□□□ 1.77
SH3BP2-202ENST00000435136 HECW2Q9P2P5 1572 aa26.08■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 CNTLNQ9NXG0 1405 aa26.07■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 TET3O43151 1660 aa26.06■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 MLECQ14165 292 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa26.05■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP26.04■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 E9PCH4 1651 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.03■■□□□ 1.767e-8■■□□□ 12
SH3BP2-202ENST00000435136 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 USP47Q96K76 1375 aa26.03■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCA6Q8N139 1617 aa26.02■■□□□ 1.76
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPM2O94759 1503 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 LAMC1P11047 1609 aa26.01■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa26■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 KANK1Q14678 1352 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.99■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRTO14522 1441 aa25.98■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 NEURL4Q96JN8 1562 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 A2MP01023 1474 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 MROH1Q8NDA8 1641 aa25.97■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP25.96■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.95■■□□□ 1.75
SH3BP2-202ENST00000435136 CEP152O94986 1710 aa25.95■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF7Q2M1P5 1343 aa25.94■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP25.93■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 LMTK2Q8IWU2 1503 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 ADAMTSL3P82987 1691 aa25.92■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP25.91■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 STAC3Q96MF2 364 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.89■■□□□ 1.74
SH3BP2-202ENST00000435136 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 REREQ9P2R6 1566 aa25.88■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 MADDQ8WXG6 1647 aa25.87■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 EFCAB6Q5THR3 1501 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 PLPPR3Q6T4P5 718 aa25.86■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 CLTCL1P53675 1640 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.85■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 AGLP35573 1532 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 PTPRMP28827 1452 aa25.84■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF3BO15066 747 aa25.83■■□□□ 1.73
SH3BP2-202ENST00000435136 GGT6Q6P531 493 aa25.82■■□□□ 1.72
SH3BP2-202ENST00000435136 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP25.8■■□□□ 1.72
SH3BP2-202ENST00000435136 RIMS1Q86UR5 1692 aaKnown RBP25.78■■□□□ 1.72
SH3BP2-202ENST00000435136 RGL3Q3MIN7 710 aa25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP25.76■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa25.75■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 KIF1BO60333 1816 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 FER1L4A9Z1Z3 1794 aa25.73■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP25.72■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.71■■□□□ 1.71
SH3BP2-202ENST00000435136 MYOM2P54296 1465 aa25.7■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 IQGAP1P46940 1657 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 IFT172Q9UG01 1749 aa25.68■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 ABCC3O15438 1527 aa25.66■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.64■■□□□ 1.7
SH3BP2-202ENST00000435136 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.64■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.6 ms