RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000433137.1

MED28P4-201, Transcript of mediator complex subunit 28 pseudogene 4, humanhuman

BASIC

Gene MED28P4, Length 572 nt, Biotype processed pseudogene.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED28P4-201ENST00000433137 HOXB3P14651 431 aaPredicted RBP11.34□□□□□ -0.59
MED28P4-201ENST00000433137 PTGDRQ13258 359 aa11.34□□□□□ -0.59
MED28P4-201ENST00000433137 PCDHGA10Q9Y5H3 936 aa11.34□□□□□ -0.59
MED28P4-201ENST00000433137 CFTRP13569 1480 aa11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 GNPATO15228 680 aa11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 EN1Q05925 392 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 SLAIN1Q8ND83 568 aa11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 CDHR5Q9HBB8 845 aa11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP11.33□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 MAP2K5Q13163 448 aa11.32□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 HIC1Q14526 733 aa11.32□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 EPAS1Q99814 870 aa11.32□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.32□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 KHSRPQ92945 711 aaKnown RBP eCLIP11.31□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 CCDC102AQ96A19 550 aa11.31□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 IRF6O14896 467 aa11.3□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 PDE4DQ08499 809 aa11.3□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP11.3□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP11.3□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 NESP48681 1621 aa11.29□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 DOK7Q18PE1 504 aa11.29□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 ARSIQ5FYB1 569 aa11.29□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa11.29□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 MAP3K7O43318 606 aa11.28□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 NUDT7P0C024 238 aa11.28□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP11.28□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 JPH4Q96JJ6 628 aa11.28□□□□□ -0.6
MED28P4-201ENST00000433137 FOSBP53539 338 aa11.27□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 TYW1BQ6NUM6 668 aa11.27□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 SCUBE2Q9NQ36 999 aa11.27□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa11.27□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 GPR153Q6NV75 609 aa11.26□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 MAMSTRQ6ZN01 415 aa11.25□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 KDM4CQ9H3R0 1056 aa11.25□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 FBXW7Q969H0 707 aa11.23□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa11.23□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF454Q8N9F8 522 aa11.22□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 PDS5BQ9NTI5 1447 aa11.22□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 AMHR2Q16671 573 aa11.21□□□□□ -0.61
MED28P4-201ENST00000433137 RIMBP2O15034 1052 aa11.2□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 ZDHHC16Q969W1 377 aa11.2□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 PARP9Q8IXQ6 854 aa11.19□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 ZNF710Q8N1W2 664 aa11.19□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 ADAM33Q9BZ11 813 aa11.19□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa11.18□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 IL27Q8NEV9 243 aa11.18□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 LHX6Q9UPM6 363 aa11.18□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 FANCD2Q9BXW9 1451 aa11.18□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa11.16□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 FAM117AQ9C073 453 aa11.15□□□□□ -0.62
MED28P4-201ENST00000433137 PHOX2BQ99453 314 aa11.14□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 PRDM2Q13029 1718 aa11.13□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 FAM161AQ3B820 660 aa11.13□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 OTUD5Q96G74 571 aa11.13□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP11.13□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 PADI6Q6TGC4 694 aa11.12□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 CERKQ8TCT0 537 aa11.11□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 PLEKHG3A1L390 1219 aa11.1□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 TTC13Q8NBP0 860 aa11.1□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 CEP164Q9UPV0 1460 aa11.1□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa11.1□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 SNPHO15079 494 aa11.09□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 COL9A1P20849 921 aa11.09□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 TMUB1Q9BVT8 246 aa11.09□□□□□ -0.63
MED28P4-201ENST00000433137 ERCC6Q03468 1493 aa11.08□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 PPP4R3BQ5MIZ7 849 aa11.08□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 ADGRG1Q9Y653 693 aa11.08□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 MS4A1P11836 297 aa11.07□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 BCL2L12Q9HB09 334 aa11.07□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 PRSS12P56730 875 aa11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 MDM2Q00987 491 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 NLRP7Q8WX94 980 aa11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 FAM198AQ9UFP1 575 aa11.06□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 PSDA5PKW4 1024 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 ABCC8Q09428 1581 aa11.05□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 PXYLP1Q8TE99 480 aa11.05□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.05□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 MRC2Q9UBG0 1479 aa11.05□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP11.04□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 DDRGK1Q96HY6 314 aa11.04□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 OATP04181 439 aa11.03□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 CLCN1P35523 988 aa11.03□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 GPCPD1Q9NPB8 672 aa11.03□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 CUX1P39880 1505 aa11.03□□□□□ -0.64
MED28P4-201ENST00000433137 TOPBP1Q92547 1522 aa11.02□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 WDR62O43379 1518 aa11.01□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 PTPREP23469 700 aa11.01□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP11.01□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa11□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 LHX8Q68G74 356 aa11□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 TSKSQ9UJT2 592 aa11□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 DNMBPQ6XZF7 1577 aa10.99□□□□□ -0.65
MED28P4-201ENST00000433137 C3orf80F5H4A9 247 aa10.99□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.5 ms