RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000422465.6

RPS3-202, Transcript of ribosomal protein S3, humanhuman

TSL 2

Gene RPS3, Length 903 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS3-202ENST00000422465 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP15.27■□□□□ 0.034e-23■□□□□ 10.1
RPS3-202ENST00000422465 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa15.26■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 IQSEC2Q5JU85 1478 aa15.26■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP15.26■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 C9orf84Q5VXU9 1444 aa15.26■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 ITGAEP38570 1179 aa15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 VASPP50552 380 aaPredicted RBP15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 ATP10AO60312 1499 aa15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 NCOA2Q15596 1464 aa15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 PTPRTO14522 1441 aa15.25■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP15.24■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 STRCQ7RTU9 1775 aa15.24■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 PIP4P2Q8N4L2 257 aa15.22■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 MYOM3Q5VTT5 1437 aa15.22■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 SCAPERQ9BY12 1400 aa15.22■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 SETD1BQ9UPS6 1966 aaKnown RBP15.22■□□□□ 0.03
RPS3-202ENST00000422465 PLCH2O75038 1416 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 CREBZFQ9NS37 354 aa15.19■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 MIER1Q8N108 512 aa15.18■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP15.18■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 CEBPAP49715 358 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 CHADLQ6NUI6 762 aa15.17■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa15.15■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 LTBP4Q8N2S1 1624 aa15.15■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 PTPN23Q9H3S7 1636 aa15.15■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.15■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 PLCD3Q8N3E9 789 aa15.15■□□□□ 0.02
RPS3-202ENST00000422465 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP15.14■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 PTPRKQ15262 1439 aa15.14■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 HFM1A2PYH4 1435 aa15.13■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 REREQ9P2R6 1566 aa15.13■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 MIA2Q96PC5 1412 aa15.12■□□□□ 0.01
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RPS3-202ENST00000422465 MYO5CQ9NQX4 1742 aa15.12■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.11■□□□□ 0.01
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RPS3-202ENST00000422465 NCOA1Q15788 1441 aa15.09■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 AGLP35573 1532 aa15.08■□□□□ 0.01
RPS3-202ENST00000422465 TIMELESSQ9UNS1 1208 aa15.08■□□□□ 0
RPS3-202ENST00000422465 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
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RPS3-202ENST00000422465 MLH3Q9UHC1 1453 aa15.05■□□□□ -0
RPS3-202ENST00000422465 GCC2Q8IWJ2 1684 aa15.04■□□□□ -0
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RPS3-202ENST00000422465 UBAP1LF5GYI3 381 aa15.04■□□□□ -0
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RPS3-202ENST00000422465 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP15.04■□□□□ -0
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RPS3-202ENST00000422465 ABCA6Q8N139 1617 aa15.01□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP15□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 MROH2AA6NES4 1674 aa15□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 PKD2Q13563 968 aa14.99□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP14.99□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 PLA2R1Q13018 1463 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 SIN3AQ96ST3 1273 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 ROCK1Q13464 1354 aa14.98□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 KLHL34Q8N239 644 aa14.97□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP14.96□□□□□ -0.01
RPS3-202ENST00000422465 DAPK1P53355 1430 aa14.95□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ITSN2Q9NZM3 1697 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ABCC1P33527 1531 aa14.94□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 MED1Q15648 1581 aaPredicted RBP14.94□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP14.93□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ABCC5O15440 1437 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 POTEHQ6S545 545 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 ZMYM3Q14202 1370 aa14.93□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa14.92□□□□□ -0.02
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RPS3-202ENST00000422465 NEUROD1Q13562 356 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 PREX2Q70Z35 1606 aa14.92□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa14.91□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 TOM1O60784 492 aa14.9□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 MYO3AQ8NEV4 1616 aa14.9□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP14.9□□□□□ -0.02
RPS3-202ENST00000422465 CHIC2Q9UKJ5 165 aa14.88□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa14.88□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 CPS1P31327 1500 aa14.87□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 HSPA1LP34931 641 aa14.87□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 TONSLQ96HA7 1378 aa14.86□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 ADGBQ8N7X0 1667 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 ADGRL2O95490 1459 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 SPOCK2Q92563 424 aa14.85□□□□□ -0.03
RPS3-202ENST00000422465 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP14.85□□□□□ -0.03
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