RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000418244.5

FOXD3-AS1-201, FOXD3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene FOXD3-AS1, Length 941 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP27.26■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PREX1Q8TCU6 1659 aa27.25■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP27.23■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KIF15Q9NS87 1388 aa27.22■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP27.22■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZMYM3Q14202 1370 aa27.22■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGRL2O95490 1459 aa27.21■■□□□ 1.95
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KDM5DQ9BY66 1539 aa27.2■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ERBINQ96RT1 1412 aa27.19■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa27.19■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCOA1Q15788 1441 aa27.18■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DMRT2Q9Y5R5 561 aa27.18■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP27.18■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NPATQ14207 1427 aa27.17■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MROH1Q8NDA8 1641 aa27.17■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DISP3Q9P2K9 1392 aa27.16■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP27.15■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa27.15■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CHIC2Q9UKJ5 165 aa27.14■■□□□ 1.94
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ILDR2Q71H61 639 aa27.13■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPRKQ15262 1439 aa27.13■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 DEPDC5O75140 1603 aa27.12■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP27.11■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP27.1■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa27.1■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ABCC3O15438 1527 aa27.1■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SOCS7O14512 581 aa27.09■■□□□ 1.93
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PZPP20742 1482 aa27.07■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEP152O94986 1710 aa27.06■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ROCK1Q13464 1354 aa27.05■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYO3AQ8NEV4 1616 aa27.05■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF142P52746 1687 aaPredicted RBP27.03■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa27.02■■□□□ 1.92
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa27.01■■□□□ 1.91
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 VWDEQ8N2E2 1590 aa27■■□□□ 1.91
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STRCQ7RTU9 1775 aa26.98■■□□□ 1.91
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CEP170BQ9Y4F5 1589 aaPredicted RBP26.97■■□□□ 1.91
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LMTK2Q8IWU2 1503 aa26.95■■□□□ 1.91
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP26.95■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPATA31D1Q6ZQQ2 1576 aa26.95■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KANK1Q14678 1352 aa26.95■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TNRQ92752 1358 aa26.95■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa26.94■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PTPRTO14522 1441 aa26.93■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ITGAEP38570 1179 aa26.93■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP26.92■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 A2ML1A8K2U0 1454 aa26.92■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UNC13BO14795 1591 aa26.92■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ERVK-7P63135 1459 aa26.91■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP26.9■■□□□ 1.9
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NLRP1Q9C000 1473 aa26.87■■□□□ 1.89
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EFCAB6Q5THR3 1501 aa26.85■■□□□ 1.89
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PLA2R1Q13018 1463 aa26.85■■□□□ 1.89
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TET3O43151 1660 aa26.82■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 GCC2Q8IWJ2 1684 aa26.82■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQGAP3Q86VI3 1631 aa26.8■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LTBP4Q8N2S1 1624 aa26.79■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NAIPQ13075 1403 aa26.78■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UGGT1Q9NYU2 1555 aa26.77■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP26.77■■□□□ 1.88
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQSEC2Q5JU85 1478 aa26.76■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 HFM1A2PYH4 1435 aa26.74■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NOS1P29475 1434 aa26.74■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UBR1Q8IWV7 1749 aa26.73■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP26.73■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SYNMO15061 1565 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PKD2Q13563 968 aa26.72■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 E9PCH4 1651 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 THEMISQ8N1K5 641 aaPredicted RBP26.71■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NUP155O75694 1391 aa26.71■■□□□ 1.87
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 KDM5AP29375 1690 aaKnown RBP26.7■■□□□ 1.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 PIK3C2BO00750 1634 aa26.69■■□□□ 1.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NEURL4Q96JN8 1562 aa26.67■■□□□ 1.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 UBAP1LF5GYI3 381 aa26.66■■□□□ 1.86
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ZNF335Q9H4Z2 1342 aaPredicted RBP26.63■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLIT1O75093 1534 aa26.61■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IDI1Q13907 227 aa26.61■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SLC52A1Q9NWF4 448 aa26.61■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ARHGAP23Q9P227 1491 aa26.61■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ANKLE2Q86XL3 938 aa26.6■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MED14O60244 1454 aa26.6■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ADGRB3O60242 1522 aa26.59■■□□□ 1.85
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa26.55■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 IQGAP1P46940 1657 aa26.54■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM2Q9UHN6 1383 aa26.53■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP26.53■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 MYO5BQ9ULV0 1848 aa26.53■■□□□ 1.84
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TMEM131LA2VDJ0 1609 aa26.51■■□□□ 1.83
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 STAG3Q9UJ98 1225 aa26.51■■□□□ 1.83
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 LTKP29376 864 aa26.47■■□□□ 1.83
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRIM52Q96A61 297 aa26.47■■□□□ 1.83
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TXNDC2Q86VQ3 553 aa26.46■■□□□ 1.83
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SETD5Q9C0A6 1442 aa26.45■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 EID1Q9Y6B2 187 aa26.44■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 TRPM2O94759 1503 aa26.44■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP26.43■■□□□ 1.82
FOXD3-AS1-201ENST00000418244 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 28.7 ms