RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP25.56■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 PPP4R2Q9NY27 417 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa25.53■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH6BQ5W0A0 696 aa25.52■■□□□ 1.68
SH3BP1-202ENST00000417536 USP47Q96K76 1375 aa25.5■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.49■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa25.48■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCC1P33527 1531 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCAO15360 1455 aa25.47■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 MSH5O43196 834 aa25.46■■□□□ 1.67
SH3BP1-202ENST00000417536 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP25.45■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 BCORL1Q5H9F3 1711 aa25.45■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa25.44■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 RSPH4AQ5TD94 716 aa25.42■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 SCAPERQ9BY12 1400 aa25.4■■□□□ 1.66
SH3BP1-202ENST00000417536 FANCIQ9NVI1 1328 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ADGRL1O94910 1474 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA9Q8IUA7 1624 aa25.38■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM5CP41229 1560 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM135AQ9P2D6 1515 aa25.37■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 RGL3Q3MIN7 710 aa25.35■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.34■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 MAST1Q9Y2H9 1570 aa25.33■■□□□ 1.65
SH3BP1-202ENST00000417536 CD109Q6YHK3 1445 aa25.32■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RALGAPBQ86X10 1494 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 PLXNC1O60486 1568 aa25.3■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 RAPGEF3O95398 923 aa25.29■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 NUDCQ9Y266 331 aa25.28■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 KIF3BO15066 747 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DUOX2Q9NRD8 1548 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 TMC1Q8TDI8 760 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.27■■□□□ 1.64
SH3BP1-202ENST00000417536 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.26■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ERICH6Q7L0X2 663 aa25.25■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP25.24■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP7AQ04656 1500 aa25.24■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 UNC13BO14795 1591 aa25.22■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 ARAP3Q8WWN8 1544 aa25.21■■□□□ 1.63
SH3BP1-202ENST00000417536 PLA2R1Q13018 1463 aa25.2■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 ERBINQ96RT1 1412 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC144AA2RUR9 1427 aa25.18■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 FAM69CQ0P6D2 419 aa25.16■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF123Q5XPI4 1314 aa25.15■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 IQGAP3Q86VI3 1631 aa25.14■■□□□ 1.62
SH3BP1-202ENST00000417536 CCDC136Q96JN2 1154 aa25.14■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 TSPOAP1O95153 1857 aa25.14■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 GGT6Q6P531 493 aa25.13■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP25.12■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa25.11■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 RALBP1Q15311 655 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa25.09■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP25.08■■□□□ 1.61
SH3BP1-202ENST00000417536 MAGI2Q86UL8 1455 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 POGZQ7Z3K3 1410 aa25.07■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 E9PCH4 1651 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 NBPF1Q3BBV0 1214 aa25.06■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP25.04■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 SENP3Q9H4L4 574 aaPredicted RBP25.03■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 UGGT1Q9NYU2 1555 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 A2MP01023 1474 aa25.02■■□□□ 1.6
SH3BP1-202ENST00000417536 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 BCL11AQ9H165 835 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 ATP10AO60312 1499 aa24.99■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 NLRP13Q86W25 1043 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 MROH1Q8NDA8 1641 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 YEATS2Q9ULM3 1422 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 KANK1Q14678 1352 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA6Q8N139 1617 aa24.98■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 CEP152O94986 1710 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 CHGAP10645 457 aaKnown RBP24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 HECW2Q9P2P5 1572 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 PARD3Q8TEW0 1356 aa24.95■■□□□ 1.59
SH3BP1-202ENST00000417536 DEPDC5O75140 1603 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa24.95■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 RRP1P56182 461 aaKnown RBP24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 CFAP74Q9C0B2 1584 aa24.94■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 NOP58Q9Y2X3 529 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 DIP2BQ9P265 1576 aa24.92■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 RCAN3Q9UKA8 241 aa24.91■■□□□ 1.58
SH3BP1-202ENST00000417536 CLTCL1P53675 1640 aa24.91■■□□□ 1.58
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