RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409457.5

AGAP1-204, Transcript of ArfGAP with GTPase domain, ankyrin repeat and PH domain 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene AGAP1, Length 2,165 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP1-204ENST00000409457 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP41.64■■■■■ 4.26
AGAP1-204ENST00000409457 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP41.63■■■■■ 4.268e-8■■□□□ 12.3
AGAP1-204ENST00000409457 L3MBTL2Q969R5 705 aa41.62■■■■■ 4.25
AGAP1-204ENST00000409457 MYT1LQ9UL68 1186 aa41.61■■■■■ 4.25
AGAP1-204ENST00000409457 FAM69CQ0P6D2 419 aa41.61■■■■■ 4.25
AGAP1-204ENST00000409457 RICTORQ6R327 1708 aa41.6■■■■■ 4.25
AGAP1-204ENST00000409457 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP41.56■■■■■ 4.24
AGAP1-204ENST00000409457 VWDEQ8N2E2 1590 aa41.53■■■■■ 4.24
AGAP1-204ENST00000409457 A2MP01023 1474 aa41.52■■■■■ 4.24
AGAP1-204ENST00000409457 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP41.5■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 ABCA6Q8N139 1617 aa41.5■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 TSPOAP1O95153 1857 aa41.49■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 MROH1Q8NDA8 1641 aa41.49■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 KIF13AQ9H1H9 1805 aa41.49■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 ATP10AO60312 1499 aa41.47■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 TET3O43151 1660 aa41.45■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa41.45■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 RAPGEF3O95398 923 aa41.45■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 PLA2R1Q13018 1463 aa41.45■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 KIF3BO15066 747 aa41.44■■■■■ 4.23
AGAP1-204ENST00000409457 BCORL1Q5H9F3 1711 aa41.44■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP41.44■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 E9PCH4 1651 aa41.44■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 KANK1Q14678 1352 aa41.43■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 CCDC144AA2RUR9 1427 aa41.39■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa41.39■■■■■ 4.22
AGAP1-204ENST00000409457 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa41.36■■■■■ 4.21
AGAP1-204ENST00000409457 NBPF8Q3BBV2 869 aa41.32■■■■■ 4.2
AGAP1-204ENST00000409457 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa41.3■■■■■ 4.2
AGAP1-204ENST00000409457 LMTK2Q8IWU2 1503 aa41.29■■■■■ 4.2
AGAP1-204ENST00000409457 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa41.26■■■■■ 4.2
AGAP1-204ENST00000409457 TRPM2O94759 1503 aa41.25■■■■■ 4.19
AGAP1-204ENST00000409457 PTPRTO14522 1441 aa41.25■■■■■ 4.19
AGAP1-204ENST00000409457 CEP152O94986 1710 aa41.23■■■■■ 4.19
AGAP1-204ENST00000409457 EFCAB6Q5THR3 1501 aa41.22■■■■■ 4.19
AGAP1-204ENST00000409457 YEATS2Q9ULM3 1422 aa41.21■■■■■ 4.19
AGAP1-204ENST00000409457 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP41.14■■■■■ 4.18
AGAP1-204ENST00000409457 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP41.12■■■■■ 4.174e-7■■■■■ 44.2
AGAP1-204ENST00000409457 CLTCL1P53675 1640 aa41.1■■■■■ 4.17
AGAP1-204ENST00000409457 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP41.09■■■■■ 4.17
AGAP1-204ENST00000409457 RALGAPBQ86X10 1494 aa41.09■■■■■ 4.17
AGAP1-204ENST00000409457 DCAF11Q8TEB1 546 aa41.08■■■■■ 4.17
AGAP1-204ENST00000409457 ABCC3O15438 1527 aa41.07■■■■■ 4.17
AGAP1-204ENST00000409457 REREQ9P2R6 1566 aa41.07■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 GGT6Q6P531 493 aa41.06■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa41.06■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP41.03■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP41.02■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 MIER1Q8N108 512 aa41.02■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 NEURL4Q96JN8 1562 aa41.01■■■■■ 4.16
AGAP1-204ENST00000409457 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa41.01■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa41■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP41■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 RGL3Q3MIN7 710 aa40.99■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 PRAG1Q86YV5 1406 aa40.98■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa40.96■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 NPATQ14207 1427 aa40.95■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa40.95■■■■■ 4.15
AGAP1-204ENST00000409457 AGLP35573 1532 aa40.94■■■■■ 4.14
AGAP1-204ENST00000409457 KIF1BO60333 1816 aa40.92■■■■■ 4.14
AGAP1-204ENST00000409457 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa40.91■■■■■ 4.14
AGAP1-204ENST00000409457 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP40.9■■■■■ 4.14
AGAP1-204ENST00000409457 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP40.88■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 UGGT1Q9NYU2 1555 aa40.87■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa40.86■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP40.85■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 CNTLNQ9NXG0 1405 aa40.85■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 USP47Q96K76 1375 aa40.85■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 STAC3Q96MF2 364 aa40.83■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa40.83■■■■■ 4.13
AGAP1-204ENST00000409457 LAMC1P11047 1609 aa40.81■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 NOS1P29475 1434 aa40.79■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 WASHC2AQ641Q2 1341 aa40.79■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 CARD11Q9BXL7 1154 aa40.79■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 MADDQ8WXG6 1647 aa40.79■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP40.77■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 GPRASP1Q5JY77 1395 aa40.77■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 MROH2AA6NES4 1674 aa40.76■■■■■ 4.12
AGAP1-204ENST00000409457 IFT172Q9UG01 1749 aa40.74■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 ADGRB3O60242 1522 aa40.74■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 PPP6R1Q9UPN7 881 aa40.72■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 PIK3C2BO00750 1634 aa40.72■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 CCDC7Q96M83 1385 aa40.71■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 SYNMO15061 1565 aa40.71■■■■■ 4.11
AGAP1-204ENST00000409457 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP40.68■■■■■ 4.1
AGAP1-204ENST00000409457 PREX1Q8TCU6 1659 aa40.67■■■■■ 4.1
AGAP1-204ENST00000409457 MYOM2P54296 1465 aa40.66■■■■■ 4.1
AGAP1-204ENST00000409457 NBPF1Q3BBV0 1214 aa40.64■■■■■ 4.1
AGAP1-204ENST00000409457 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa40.63■■■■■ 4.09
AGAP1-204ENST00000409457 CLTCQ00610 1675 aaKnown RBP40.61■■■■■ 4.09
AGAP1-204ENST00000409457 KIF7Q2M1P5 1343 aa40.59■■■■■ 4.09
AGAP1-204ENST00000409457 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa40.58■■■■■ 4.09
AGAP1-204ENST00000409457 PPLO60437 1756 aa40.57■■■■■ 4.09
AGAP1-204ENST00000409457 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP40.55■■■■■ 4.08
AGAP1-204ENST00000409457 NRXN1Q9ULB1 1477 aa40.53■■■■■ 4.08
AGAP1-204ENST00000409457 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa40.53■■■■■ 4.08
AGAP1-204ENST00000409457 TRHP20396 242 aaPredicted RBP40.52■■■■■ 4.08
AGAP1-204ENST00000409457 IQGAP1P46940 1657 aa40.5■■■■■ 4.07
AGAP1-204ENST00000409457 SLC52A1Q9NWF4 448 aa40.5■■■■■ 4.07
AGAP1-204ENST00000409457 ERVK-7P63135 1459 aa40.49■■■■■ 4.07
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