RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409178.5

C10orf55-201, Transcript of chromosome 10 open reading frame 55, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene C10orf55, Length 2,513 nt, Biotype antisense RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C10orf55-201ENST00000409178 UNC13BO14795 1591 aa29.71■■■□□ 2.35
C10orf55-201ENST00000409178 CCDC144AA2RUR9 1427 aa29.69■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 PLA2R1Q13018 1463 aa29.69■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 PLCH2O75038 1416 aa29.68■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 PLXNC1O60486 1568 aa29.68■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa29.68■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 RGL3Q3MIN7 710 aa29.66■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP29.65■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa29.65■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP29.64■■■□□ 2.34
C10orf55-201ENST00000409178 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa29.63■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP29.62■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 DUOX2Q9NRD8 1548 aa29.61■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 PRAG1Q86YV5 1406 aa29.6■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa29.6■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 IQGAP3Q86VI3 1631 aa29.6■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 ABCC1P33527 1531 aa29.58■■■□□ 2.33
C10orf55-201ENST00000409178 ZBED9Q6R2W3 1325 aa29.57■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 ERBINQ96RT1 1412 aa29.56■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 A2MP01023 1474 aa29.56■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.55■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 MAGI2Q86UL8 1455 aa29.54■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa29.53■■■□□ 2.32
C10orf55-201ENST00000409178 AFAP1Q8N556 730 aa29.5■■■□□ 2.31
C10orf55-201ENST00000409178 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP29.46■■■□□ 2.31
C10orf55-201ENST00000409178 ATP10AO60312 1499 aa29.44■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 GPRASP1Q5JY77 1395 aa29.43■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa29.41■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 WDR7Q9Y4E6 1490 aa29.4■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa29.4■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 E9PCH4 1651 aa29.39■■■□□ 2.3
C10orf55-201ENST00000409178 TMC1Q8TDI8 760 aa29.38■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.38■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 ARAP3Q8WWN8 1544 aa29.37■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa29.36■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP29.36■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 TESK2Q96S53 571 aa29.34■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 DISP3Q9P2K9 1392 aa29.33■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 FANCAO15360 1455 aa29.33■■■□□ 2.29
C10orf55-201ENST00000409178 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP29.32■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 LAMC1P11047 1609 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 RALBP1Q15311 655 aa29.31■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 ABCA9Q8IUA7 1624 aa29.28■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP29.28■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.27■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP29.26■■■□□ 2.28
C10orf55-201ENST00000409178 ERICH6BQ5W0A0 696 aa29.26■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 MYT1LQ9UL68 1186 aa29.26■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 ATP7AQ04656 1500 aa29.26■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP29.25■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 PPP4R2Q9NY27 417 aa29.25■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 SCAPERQ9BY12 1400 aa29.24■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 TRPM2O94759 1503 aa29.24■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP29.24■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRL1O94910 1474 aa29.24■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP29.24■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP29.23■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 ASXL2Q76L83 1435 aa29.23■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 NUDCQ9Y266 331 aa29.23■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 DEPDC5O75140 1603 aa29.22■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 PARD3Q8TEW0 1356 aa29.22■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP29.22■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 KIF3BO15066 747 aa29.21■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 PTPRTO14522 1441 aa29.21■■■□□ 2.27
C10orf55-201ENST00000409178 CLTCL1P53675 1640 aa29.2■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 MADDQ8WXG6 1647 aa29.19■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 TMF1P82094 1093 aa29.19■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 PANK3Q9H999 370 aa29.18■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa29.18■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP29.17■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 NLRP13Q86W25 1043 aa29.17■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa29.16■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 KANK1Q14678 1352 aa29.16■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 TET3O43151 1660 aa29.15■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 VWDEQ8N2E2 1590 aa29.14■■■□□ 2.26
C10orf55-201ENST00000409178 CEP152O94986 1710 aa29.13■■■□□ 2.25
C10orf55-201ENST00000409178 MROH1Q8NDA8 1641 aa29.09■■■□□ 2.25
C10orf55-201ENST00000409178 UGGT1Q9NYU2 1555 aa29.07■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 RNF123Q5XPI4 1314 aa29.07■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 IQGAP1P46940 1657 aa29.07■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP29.07■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa29.06■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP29.03■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa29.02■■■□□ 2.24
C10orf55-201ENST00000409178 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP29■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 OSCARQ8IYS5 282 aa29■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 STAC3Q96MF2 364 aa29■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa28.98■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 EFCAB6Q5THR3 1501 aa28.97■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 CFAP70Q5T0N1 1121 aa28.95■■■□□ 2.23
C10orf55-201ENST00000409178 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa28.95■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP28.94■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 CD109Q6YHK3 1445 aa28.94■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 KNSTRNQ9Y448 316 aa28.92■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 NEURL4Q96JN8 1562 aa28.9■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 POGZQ7Z3K3 1410 aa28.9■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.22
C10orf55-201ENST00000409178 CDCA8Q53HL2 280 aa28.89■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.9 ms