RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000403888.7

KCTD17-202, Transcript of potassium channel tetramerization domain containing 17, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCTD17, Length 1,763 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCTD17-202ENST00000403888 PLA2R1Q13018 1463 aa36.71■■■■□ 3.47
KCTD17-202ENST00000403888 USP47Q96K76 1375 aa36.69■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 DEPDC5O75140 1603 aa36.69■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP36.69■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 ATP7AQ04656 1500 aa36.68■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP36.66■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 ADGRL1O94910 1474 aa36.66■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP36.63■■■■□ 3.46
KCTD17-202ENST00000403888 KIF7Q2M1P5 1343 aa36.63■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP36.62■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 AFAP1Q8N556 730 aa36.62■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP36.62■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 CFAP74Q9C0B2 1584 aa36.62■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 SCAPERQ9BY12 1400 aa36.59■■■■□ 3.45
KCTD17-202ENST00000403888 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP36.57■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 DCAF11Q8TEB1 546 aa36.57■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 PRAG1Q86YV5 1406 aa36.56■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa36.55■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 BCORL1Q5H9F3 1711 aa36.55■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 VWDEQ8N2E2 1590 aa36.55■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 LAMC1P11047 1609 aa36.53■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 TET3O43151 1660 aa36.52■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 E9PCH4 1651 aa36.51■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 CARD11Q9BXL7 1154 aa36.51■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 A2MP01023 1474 aa36.51■■■■□ 3.44
KCTD17-202ENST00000403888 ZNF518AQ6AHZ1 1483 aa36.5■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP36.49■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 TRPM2O94759 1503 aa36.48■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP36.48■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP36.47■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 GPRASP1Q5JY77 1395 aa36.47■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 PTPRTO14522 1441 aa36.46■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa36.45■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 KANK1Q14678 1352 aa36.45■■■■□ 3.43
KCTD17-202ENST00000403888 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa36.43■■■■□ 3.42
KCTD17-202ENST00000403888 CD109Q6YHK3 1445 aa36.43■■■■□ 3.42
KCTD17-202ENST00000403888 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa36.43■■■■□ 3.42
KCTD17-202ENST00000403888 PRKRIP1Q9H875 184 aaPredicted RBP36.43■■■■□ 3.42
KCTD17-202ENST00000403888 NEURL4Q96JN8 1562 aa36.39■■■■□ 3.42
KCTD17-202ENST00000403888 MROH1Q8NDA8 1641 aa36.38■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 CEP152O94986 1710 aa36.38■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 STAC3Q96MF2 364 aa36.38■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 POGZQ7Z3K3 1410 aa36.36■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 MLH3Q9UHC1 1453 aa36.34■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 NEO1Q92859 1461 aa36.32■■■■□ 3.41
KCTD17-202ENST00000403888 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP36.31■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 RGL3Q3MIN7 710 aa36.31■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 LMTK2Q8IWU2 1503 aa36.31■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa36.29■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 KIF3BO15066 747 aa36.27■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 CLTCL1P53675 1640 aa36.27■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 HECW2Q9P2P5 1572 aa36.27■■■■□ 3.4
KCTD17-202ENST00000403888 EFCAB6Q5THR3 1501 aa36.24■■■■□ 3.39
KCTD17-202ENST00000403888 MYT1LQ9UL68 1186 aa36.24■■■■□ 3.39
KCTD17-202ENST00000403888 MADDQ8WXG6 1647 aa36.22■■■■□ 3.39
KCTD17-202ENST00000403888 NBPF1Q3BBV0 1214 aa36.16■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP36.15■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 GLI2P10070 1586 aa36.15■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa36.15■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa36.14■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP36.14■■■■□ 3.38
KCTD17-202ENST00000403888 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP36.13■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP36.12■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa36.11■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 MRS2Q9HD23 443 aa36.11■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 ABCA6Q8N139 1617 aa36.09■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 IQGAP1P46940 1657 aa36.08■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP36.07■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 CCDC184Q52MB2 194 aa36.07■■■■□ 3.37
KCTD17-202ENST00000403888 POLR3GLQ9BT43 218 aa36.07■■■■□ 3.36
KCTD17-202ENST00000403888 KIF1BO60333 1816 aa36.06■■■■□ 3.36
KCTD17-202ENST00000403888 MYOM2P54296 1465 aa36.06■■■■□ 3.36
KCTD17-202ENST00000403888 TESK2Q96S53 571 aa36.04■■■■□ 3.36
KCTD17-202ENST00000403888 RICTORQ6R327 1708 aa36.02■■■■□ 3.36
KCTD17-202ENST00000403888 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa35.99■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 IFT172Q9UG01 1749 aa35.99■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa35.98■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 RALBP1Q15311 655 aa35.97■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP35.97■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 TMF1P82094 1093 aa35.95■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa35.95■■■■□ 3.35
KCTD17-202ENST00000403888 ABCC3O15438 1527 aa35.94■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 ADGRB3O60242 1522 aa35.93■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 ZBED9Q6R2W3 1325 aa35.92■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 DISP3Q9P2K9 1392 aa35.91■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 NPATQ14207 1427 aa35.91■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 UGGT1Q9NYU2 1555 aa35.91■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 NRXN1Q9ULB1 1477 aa35.91■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 FAM9BQ8IZU0 186 aa35.89■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP35.89■■■■□ 3.34
KCTD17-202ENST00000403888 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 MROH2AA6NES4 1674 aa35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 NEFLP07196 543 aa35.87■■■■□ 3.33
KCTD17-202ENST00000403888 CYB5RLQ6IPT4 315 aa35.87■■■■□ 3.33
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms