RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000384479.1

RNU6-790P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 790, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-790P, Length 105 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-790P-201ENST00000384479 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa6.87□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEMA3EO15041 775 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP6.86□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 CERKQ8TCT0 537 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCNK17Q96T54 332 aa6.86□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 GRXCR2A6NFK2 248 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 PSEN2P49810 448 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 DMRTA1Q5VZB9 504 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZBED2Q9BTP6 218 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 AXIN2Q9Y2T1 843 aa6.85□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 HRO43593 1189 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 SMYD5Q6GMV2 418 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 SPNS2Q8IVW8 549 aa6.84□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP6.84□□□□□ -1.31
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADGRD1Q6QNK2 874 aa6.83□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP6.82□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAP3K7O43318 606 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 COL9A1P20849 921 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa6.82□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP6.81□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM33Q96EV2 1170 aaKnown RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 RABGEF1Q9UJ41 708 aa6.8□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 TTC13Q8NBP0 860 aa6.79□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 PRSS12P56730 875 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 PTGDRQ13258 359 aa6.78□□□□□ -1.32
RNU6-790P-201ENST00000384479 MMRN1Q13201 1228 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDHR5Q9HBB8 845 aa6.77□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 LAPTM4BQ86VI4 370 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDCA7LQ96GN5 454 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 NBPF3Q9H094 633 aa6.76□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPR37O15354 613 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 PROX2Q3B8N5 592 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 MYT1LQ9UL68 1186 aa6.75□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 FCHSD2O94868 740 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 TSKSQ9UJT2 592 aa6.74□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 HIC1Q14526 733 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 PACS2Q86VP3 889 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 KIAA1468Q9P260 1216 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM198AQ9UFP1 575 aa6.73□□□□□ -1.33
RNU6-790P-201ENST00000384479 NUTM2FA1L443 756 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 NBPF26B4DH59 902 aa6.71□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 FAM98CQ17RN3 349 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 PADI6Q6TGC4 694 aa6.7□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 GNPATO15228 680 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 GPIHBP1Q8IV16 184 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 TATDN2Q93075 761 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 STAC3Q96MF2 364 aa6.69□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 LMOD2Q6P5Q4 547 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 BCANQ96GW7 911 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 EYA1Q99502 592 aa6.68□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP6.67□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 PLSCR2Q9NRY7 297 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 ADGRG1Q9Y653 693 aa6.67□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 C3orf80F5H4A9 247 aa6.66□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 OATP04181 439 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 THSD4Q6ZMP0 1018 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 NUDT18Q6ZVK8 323 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 PNMA3Q9UL41 463 aa6.65□□□□□ -1.34
RNU6-790P-201ENST00000384479 SOWAHBA6NEL2 793 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 ANKK1Q8NFD2 765 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 WNT2BQ93097 391 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 HCSTQ9UBK5 93 aa6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 SEPT9Q9UHD8 586 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 GOLGA8CPA6NN73 597 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 MAP2K5Q13163 448 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 NYAP1Q6ZVC0 841 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 PXYLP1Q8TE99 480 aa6.63□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZMYND10O75800 440 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 FECHP22830 423 aa6.62□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 DNAJB2P25686 324 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 BARGINQ6ZT62 677 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 NECTIN2Q92692 538 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 TMEM134Q9H6X4 195 aa6.61□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 SMAPO00193 183 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 IRF6O14896 467 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 LRCH3Q96II8 777 aa6.6□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 TSR3Q9UJK0 312 aaKnown RBP6.59□□□□□ -1.35
RNU6-790P-201ENST00000384479 RCCD1A6NED2 376 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-790P-201ENST00000384479 HDGFP51858 240 aaKnown RBP6.58□□□□□ -1.36
RNU6-790P-201ENST00000384479 SAMD7Q7Z3H4 446 aa6.58□□□□□ -1.36
RNU6-790P-201ENST00000384479 BCAMP50895 628 aa6.57□□□□□ -1.36
RNU6-790P-201ENST00000384479 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP6.57□□□□□ -1.36
RNU6-790P-201ENST00000384479 SLF2Q8IX21 1173 aa6.57□□□□□ -1.36
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 25.8 ms