RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372616.1

CTPS1-201, Transcript of CTP synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 2 BASIC

Gene CTPS1, Length 2,037 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1-201ENST00000372616 PITPNM1O00562 1244 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 PSEN1P49768 467 aa10.14□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 PTPRGP23470 1445 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 EPRSP07814 1512 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa10.13□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 TESPA1A2RU30 521 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 ABCA8O94911 1581 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 NEFLP07196 543 aa10.12□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 MTUS2Q5JR59 1369 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 EFCAB3Q8N7B9 438 aa10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 RBM42Q9BTD8 480 aaKnown RBP10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 MYT1LQ9UL68 1186 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 PHF8Q9UPP1 1060 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 PLB1Q6P1J6 1458 aa10.1□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
CTPS1-201ENST00000372616 BCL11AQ9H165 835 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 UACAQ9BZF9 1416 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 NCKAP5LQ9HCH0 1330 aa10.08□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 GPBP1L1Q9HC44 474 aaPredicted RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 CABP2Q9NPB3 220 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ZMYND10O75800 440 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 FBXO22Q8NEZ5 403 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 LARP6Q9BRS8 491 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ERCC6L2Q5T890 1561 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 CDK13Q14004 1512 aaKnown RBP10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC2Q92887 1545 aa10.07□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 CCNB3Q8WWL7 1395 aa10.06□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 CCER2I3L3R5 266 aa10.05□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 IFNL1Q8IU54 200 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 CCDC61Q9Y6R9 512 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 IL27Q8NEV9 243 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 NCOA2Q15596 1464 aa10.04□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 TROQ12816 1431 aaPredicted RBP10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ATP10BO94823 1461 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ADCY10Q96PN6 1610 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 ARHGEF11O15085 1522 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa10.03□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 PLEKHD1A6NEE1 506 aa10.02□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 FARP1Q9Y4F1 1045 aaPredicted RBP10.02□□□□□ -0.8
CTPS1-201ENST00000372616 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP10.02□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 PHLDB1Q86UU1 1377 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 MYOM3Q5VTT5 1437 aa10.01□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 KDM5BQ9UGL1 1544 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 KIF14Q15058 1648 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 NLRP6P59044 892 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP10□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ITSN2Q9NZM3 1697 aa10□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 FGD6Q6ZV73 1430 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 MIA2Q96PC5 1412 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ERICH6BQ5W0A0 696 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ARID3CA6NKF2 412 aa9.99□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 MAP3K13O43283 966 aa9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 MLLT3P42568 568 aaPredicted RBP9.98□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 SETD5Q9C0A6 1442 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 MAPKBP1O60336 1514 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 BARGINQ6ZT62 677 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 FANCIQ9NVI1 1328 aa9.97□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 ANP32CO43423 234 aa9.96□□□□□ -0.81
CTPS1-201ENST00000372616 RAB3GAP2Q9H2M9 1393 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PTPN23Q9H3S7 1636 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.95□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 SMYD5Q6GMV2 418 aa9.94□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 SOX12O15370 315 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PDE4AP27815 886 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PODXL2Q9NZ53 605 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 ABCC10Q5T3U5 1492 aa9.93□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP9.92□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PPP1R15AO75807 674 aaPredicted RBP9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 WDR7Q9Y4E6 1490 aa9.91□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 AK7Q96M32 723 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 ARID3AQ99856 593 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 KDM4CQ9H3R0 1056 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 MYO5CQ9NQX4 1742 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PREX2Q70Z35 1606 aa9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP9.9□□□□□ -0.82
CTPS1-201ENST00000372616 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 GPIHBP1Q8IV16 184 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 KIF12Q96FN5 646 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 MFSD10Q14728 455 aa9.89□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 ARAP3Q8WWN8 1544 aa9.88□□□□□ -0.83
CTPS1-201ENST00000372616 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP9.88□□□□□ -0.83
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