RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000370587.5

MCOLN3-202, Transcript of mucolipin 3, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene MCOLN3, Length 2,953 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCOLN3-202ENST00000370587 CARD11Q9BXL7 1154 aa15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 ABCC2Q92887 1545 aa15.25■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 PLXNC1O60486 1568 aa15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa15.23■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 ERICH6BQ5W0A0 696 aa15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa15.22■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 DCAF11Q8TEB1 546 aa15.21■□□□□ 0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 IRX6P78412 446 aaPredicted RBP15.21■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 CCDC144AA2RUR9 1427 aa15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 ERCC6L2Q5T890 1561 aa15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 IQGAP3Q86VI3 1631 aa15.2■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 E9PCH4 1651 aa15.18■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 DUOX2Q9NRD8 1548 aa15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP15.17■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 PRAG1Q86YV5 1406 aa15.16■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP15.15■□□□□ 0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 PPP4R2Q9NY27 417 aa15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 LAMC1P11047 1609 aa15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 ERBINQ96RT1 1412 aa15.14■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PLA2R1Q13018 1463 aa15.13■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 MAGI2Q86UL8 1455 aa15.13■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP15.13■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP15.12■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 A2MP01023 1474 aa15.12■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 CLASP1Q7Z460 1538 aa15.12■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PPP6R1Q9UPN7 881 aa15.12■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PLCH2O75038 1416 aa15.12■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa15.11■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 ABCC1P33527 1531 aa15.11■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 TMC1Q8TDI8 760 aa15.11■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 RGL3Q3MIN7 710 aa15.1■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 GPRASP1Q5JY77 1395 aa15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 ATP10AO60312 1499 aa15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 RALBP1Q15311 655 aa15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP15.09■□□□□ 0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP15.08■□□□□ 0
MCOLN3-202ENST00000370587 NUDCQ9Y266 331 aa15.08■□□□□ 0
MCOLN3-202ENST00000370587 KCNA4P22459 653 aa15.06■□□□□ 0
MCOLN3-202ENST00000370587 ANP32EQ9BTT0 268 aa15.06■□□□□ 0
MCOLN3-202ENST00000370587 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP15.06■□□□□ 0
MCOLN3-202ENST00000370587 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP15.05■□□□□ -0
MCOLN3-202ENST00000370587 NBPF1Q3BBV0 1214 aa15.05■□□□□ -0
MCOLN3-202ENST00000370587 ARAP3Q8WWN8 1544 aa15.04■□□□□ -0
MCOLN3-202ENST00000370587 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP15.04■□□□□ -0
MCOLN3-202ENST00000370587 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa15.04■□□□□ -0
MCOLN3-202ENST00000370587 PARD3Q8TEW0 1356 aa15.02□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 B4GALNT3Q6L9W6 998 aa15.02□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa15.01□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa15.01□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP15□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 NLRP13Q86W25 1043 aa15□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 CEP152O94986 1710 aa15□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa15□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 RNF123Q5XPI4 1314 aa15□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 DISP3Q9P2K9 1392 aa14.99□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 TRPM2O94759 1503 aa14.99□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 DEPDC5O75140 1603 aa14.99□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 TESK2Q96S53 571 aa14.99□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 MADDQ8WXG6 1647 aa14.98□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 TMF1P82094 1093 aa14.97□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa14.97□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 TET3O43151 1660 aa14.97□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP14.97□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 IQGAP1P46940 1657 aa14.96□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 ABCA9Q8IUA7 1624 aa14.96□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 FANCIQ9NVI1 1328 aa14.96□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 WDR7Q9Y4E6 1490 aa14.96□□□□□ -0.01
MCOLN3-202ENST00000370587 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa14.96□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP14.96□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 ATP7AQ04656 1500 aa14.95□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 CLTCL1P53675 1640 aa14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 AFAP1Q8N556 730 aa14.94□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 FANCAO15360 1455 aa14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 PTPRTO14522 1441 aa14.93□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 PANK3Q9H999 370 aa14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 KANK1Q14678 1352 aa14.92□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP14.91□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa14.91□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 STAC3Q96MF2 364 aa14.91□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 VWDEQ8N2E2 1590 aa14.91□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 CCDC136Q96JN2 1154 aa14.91□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 INSRP06213 1382 aa14.9□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 PDE3BQ13370 1112 aa14.9□□□□□ -0.02
MCOLN3-202ENST00000370587 SCAPERQ9BY12 1400 aa14.89□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 ADGRL1O94910 1474 aa14.89□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 SCAF11Q99590 1463 aaKnown RBP14.89□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa14.89□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 SYNMO15061 1565 aa14.88□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP14.88□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 NEURL4Q96JN8 1562 aa14.88□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 MSH5O43196 834 aa14.88□□□□□ -0.03
MCOLN3-202ENST00000370587 MYT1LQ9UL68 1186 aa14.87□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 23.5 ms