RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362869.1

RNU6-552P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 552, pseudogene, humanhuman

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Gene RNU6-552P, Length 119 nt, Biotype snRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-552P-201ENST00000362869 OSBPP22059 807 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.78□□□□□ -1.16
RNU6-552P-201ENST00000362869 PSEN2P49810 448 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 SMYD5Q6GMV2 418 aa7.77□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP7.76□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 LSM11P83369 360 aaKnown RBP eCLIP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.75□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 C6orf132Q5T0Z8 1188 aa7.75□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 PPP1R3GB7ZBB8 358 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 DMRTA1Q5VZB9 504 aa7.74□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDHR5Q9HBB8 845 aa7.73□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 COL9A1P20849 921 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKRD13DQ6ZTN6 518 aa7.72□□□□□ -1.17
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP7.7□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRD1Q6QNK2 874 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 CERKQ8TCT0 537 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZBED2Q9BTP6 218 aa7.7□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUTM2FA1L443 756 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 TK2O00142 265 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCANQ96GW7 911 aa7.69□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 PROX2Q3B8N5 592 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC4A5Q9BY07 1137 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 VPS9D1Q9Y2B5 631 aa7.68□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTGDRQ13258 359 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPIHBP1Q8IV16 184 aa7.66□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDCA7LQ96GN5 454 aa7.65□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 NPDC1Q9NQX5 325 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
RNU6-552P-201ENST00000362869 FCHSD2O94868 740 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 PRSS12P56730 875 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 LMOD2Q6P5Q4 547 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 RABGEF1Q9UJ41 708 aa7.64□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 HRO43593 1189 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 SPNS2Q8IVW8 549 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF3Q9H094 633 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TSKSQ9UJT2 592 aa7.63□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 ONECUT3O60422 494 aaPredicted RBP7.62□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 PADI6Q6TGC4 694 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 STAC3Q96MF2 364 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 KIAA1468Q9P260 1216 aa7.62□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 BHMG1C9JSJ3 638 aaPredicted RBP7.61□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 GPR37O15354 613 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 HIC1Q14526 733 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 PACS2Q86VP3 889 aa7.61□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 NBPF26B4DH59 902 aa7.6□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 GNPATO15228 680 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM198AQ9UFP1 575 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 MYT1LQ9UL68 1186 aa7.59□□□□□ -1.19
RNU6-552P-201ENST00000362869 TTC13Q8NBP0 860 aa7.58□□□□□ -1.2
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RNU6-552P-201ENST00000362869 MMRN1Q13201 1228 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 LAPTM4BQ86VI4 370 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 PNMA3Q9UL41 463 aa7.57□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 GOLGA8CPA6NN73 597 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 NUDT18Q6ZVK8 323 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 TATDN2Q93075 761 aa7.56□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF166Q96A37 237 aaPredicted RBP7.56□□□□□ -1.2
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RNU6-552P-201ENST00000362869 FECHP22830 423 aa7.55□□□□□ -1.2
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RNU6-552P-201ENST00000362869 C3orf80F5H4A9 247 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ADGRG1Q9Y653 693 aa7.54□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 FAM161AQ3B820 660 aa7.53□□□□□ -1.2
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RNU6-552P-201ENST00000362869 KCTD12Q96CX2 325 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZFRQ96KR1 1074 aaKnown RBP7.53□□□□□ -1.2
RNU6-552P-201ENST00000362869 MAP2K5Q13163 448 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ANKK1Q8NFD2 765 aa7.52□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RBM46Q8TBY0 533 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 OATP04181 439 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 METTL3Q86U44 580 aaKnown RBP7.5□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 EYA1Q99502 592 aa7.5□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 ZMYND10O75800 440 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 PXYLP1Q8TE99 480 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 LRCH3Q96II8 777 aa7.49□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 DNAJB2P25686 324 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BCAMP50895 628 aa7.48□□□□□ -1.21
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RNU6-552P-201ENST00000362869 THSD4Q6ZMP0 1018 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 BARGINQ6ZT62 677 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SAMD7Q7Z3H4 446 aa7.48□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP7.48□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RCCD1A6NED2 376 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 SOWAHBA6NEL2 793 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 KRI1Q8N9T8 703 aaKnown RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CCDC102AQ96A19 550 aa7.47□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 CDKN2AIPQ9NXV6 580 aaPredicted RBP7.47□□□□□ -1.21
RNU6-552P-201ENST00000362869 RPL17-C18orf32A0A0A6YYL6 228 aaKnown RBP7.46□□□□□ -1.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 IRF6O14896 467 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 RNF40O75150 1001 aa7.46□□□□□ -1.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SLC4A3P48751 1232 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 PTPN5P54829 565 aa7.45□□□□□ -1.22
RNU6-552P-201ENST00000362869 SWT1Q5T5J6 900 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
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