RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356128.4

TRAPPC3L-201, Transcript of trafficking protein particle complex 3 like, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene TRAPPC3L, Length 2,421 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARIH1Q9Y4X5 557 aaPredicted RBP9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SYNJ2O15056 1496 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF8Q9UPP1 1060 aa9.73□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GRIN2AQ12879 1464 aa9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF467Q7Z7K2 595 aaPredicted RBP9.72□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GPR37O15354 613 aa9.71□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFSD10Q14728 455 aa9.71□□□□□ -0.85
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FLIIQ13045 1269 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFCAB3Q8N7B9 438 aa9.71□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF428Q96B54 188 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IGSF3O75054 1194 aa9.7□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RAD21O60216 631 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 JPH4Q96JJ6 628 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CEP170Q5SW79 1584 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARAP1Q96P48 1450 aa9.69□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PSEN1P49768 467 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CRISPLD2Q9H0B8 497 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC61Q9Y6R9 512 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRKAR2AP13861 404 aaKnown RBP9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CAMK2BQ13554 666 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FHOD3Q2V2M9 1422 aa9.68□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PARP9Q8IXQ6 854 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RGS22Q8NE09 1264 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 A6NJR5 290 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AEBP1Q8IUX7 1158 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa9.67□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CLASP1Q7Z460 1538 aa9.66□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP9.65□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTMR7Q9Y216 660 aa9.65□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa9.65□□□□□ -0.86
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CTTNBP2Q8WZ74 1663 aa9.65□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IQGAP2Q13576 1575 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DDRGK1Q96HY6 314 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FXR2P51116 673 aaKnown RBP eCLIP9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRAIPQ9BWF2 469 aa9.64□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 VPS8Q8N3P4 1428 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDE4AP27815 886 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC102AQ96A19 550 aa9.63□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NLRP6P59044 892 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CABP2Q9NPB3 220 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MCM6Q14566 821 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 POM121Q96HA1 1249 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MS4A4AQ96JQ5 239 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCGF6Q9BYE7 350 aa9.62□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 NUP160Q12769 1436 aa9.61□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IFNL1Q8IU54 200 aa9.6□□□□□ -0.87
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RETREG2Q8NC44 543 aa9.58□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 AMHR2Q16671 573 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PIP4P2Q8N4L2 257 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EFCAB5A4FU69 1503 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DPYSL4O14531 572 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP3K13O43283 966 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRF5Q13568 498 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FNBP4Q8N3X1 1017 aaPredicted RBP9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FMN1Q68DA7 1419 aa9.57□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FECHP22830 423 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PROSER2Q86WR7 435 aaPredicted RBP9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 EMILIN3Q9NT22 766 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 DISP1Q96F81 1524 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 UGGT2Q9NYU1 1516 aa9.55□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 IRF6O14896 467 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SOX12O15370 315 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CHRDL2Q6WN34 429 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GZF1Q9H116 711 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PTPRGP23470 1445 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MS4A1P11836 297 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GOPCQ9HD26 462 aa9.54□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 RBM25P49756 843 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MAP2K5Q13163 448 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TMCO4Q5TGY1 634 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ZNF579Q8NAF0 562 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SAMD9Q5K651 1589 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIF12Q96FN5 646 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 KIAA0556O60303 1618 aa9.53□□□□□ -0.88
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCF11O94913 1555 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 REPIN1Q9BWE0 567 aaKnown RBP9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SHROOM2Q13796 1616 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 MTUS2Q5JR59 1369 aa9.51□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PLB1Q6P1J6 1458 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PDIA6Q15084 440 aa9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP9.5□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 ITGAEP38570 1179 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 FYCO1Q9BQS8 1478 aa9.49□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CCDC97Q96F63 343 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PPP1R15BQ5SWA1 713 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PHF12Q96QT6 1004 aa9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP9.48□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 SERPINA10Q9UK55 444 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 TRPC6Q9Y210 931 aa9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP9.47□□□□□ -0.89
TRAPPC3L-201ENST00000356128 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP9.46□□□□□ -0.89
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