RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000356100.6

PTPRT-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type T, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene PTPRT, Length 12,480 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRT-201ENST00000356100 FHOD3Q2V2M9 1422 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-201ENST00000356100 EVC2Q86UK5 1308 aa7.46□□□□□ -1.21
PTPRT-201ENST00000356100 FANCD2Q9BXW9 1451 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa7.46□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 ZBED9Q6R2W3 1325 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 ISY1Q9ULR0 285 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 FYCO1Q9BQS8 1478 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 VGFO15240 615 aaPredicted RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TPM3P06753 285 aa7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP7.45□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TAF7LQ5H9L4 462 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TRHP20396 242 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TPRNQ4KMQ1 711 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 E9PSI1 815 aa7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 SUPT6HQ7KZ85 1726 aaKnown RBP7.44□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 HECW1Q76N89 1606 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 REC8O95072 547 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 GAPVD1Q14C86 1478 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 USP47Q96K76 1375 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 RASSF8Q8NHQ8 419 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TPM1P09493 284 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TPM2P07951 284 aa7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC70Q6NSX1 233 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 AMOTL1Q8IY63 956 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 RUFY2Q8WXA3 655 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 KIF3BO15066 747 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 COG3Q96JB2 828 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 STK26Q9P289 416 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 WASHC2AQ641Q2 1341 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 NEXNQ0ZGT2 675 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 MLECQ14165 292 aa7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 HOOK1Q9UJC3 728 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 AMPHP49418 695 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CEP89Q96ST8 783 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 PTPRGP23470 1445 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 EHBP1L1Q8N3D4 1523 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 RBM19Q9Y4C8 960 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CNTLNQ9NXG0 1405 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa7.41□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CHMP3Q9Y3E7 222 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 ABCF1Q8NE71 845 aaKnown RBP eCLIP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 DDX19BQ9UMR2 479 aa7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 CPLX2Q6PUV4 134 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.22
PTPRT-201ENST00000356100 A0A0U1RQG5 324 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 SOX12O15370 315 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 GPS2Q13227 327 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 ANKRD20A12PQ8NF67 263 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 C1orf141Q5JVX7 400 aa7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 DEKP35659 375 aaKnown RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP7.4□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 NOL10Q9BSC4 688 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 AKAP17AQ02040 695 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 RNF20Q5VTR2 975 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 G3V3G9 751 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 DCAF8Q5TAQ9 597 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 FGD6Q6ZV73 1430 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 FGD5Q6ZNL6 1462 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 NINLQ9Y2I6 1382 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 MFAP1P55081 439 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 TTC5Q8N0Z6 440 aa7.39□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 L3MBTL2Q969R5 705 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 TAOK2Q9UL54 1235 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 H3BQV1 296 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 IPO7O95373 1038 aaKnown RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 HSP90AB4PQ58FF6 505 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 IFFO2Q5TF58 517 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 SYNE3Q6ZMZ3 975 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 DIAPH3Q9NSV4 1193 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 SLKQ9H2G2 1235 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 FAM161AQ3B820 660 aa7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 SETQ01105 290 aaPredicted RBP7.38□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 APBB1O00213 710 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 API5Q9BZZ5 524 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 CCDC47Q96A33 483 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 DDX58O95786 925 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 RSPH6AQ9H0K4 717 aa7.37□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 HMGXB3Q12766 1538 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 HMGB2P26583 209 aaKnown RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP7.36□□□□□ -1.23
PTPRT-201ENST00000356100 TCEAL9Q9UHQ7 104 aa7.36□□□□□ -1.23
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