RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000338546.9

HPS1-202, Transcript of HPS1, biogenesis of lysosomal organelles complex 3 subunit 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HPS1, Length 1,580 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS1-202ENST00000338546 DEPDC5O75140 1603 aa23.13■■□□□ 1.29
HPS1-202ENST00000338546 ATP10AO60312 1499 aa23.12■■□□□ 1.29
HPS1-202ENST00000338546 KIDINS220Q9ULH0 1771 aa23.1■■□□□ 1.29
HPS1-202ENST00000338546 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.06■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 VWDEQ8N2E2 1590 aa23.05■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 KANK1Q14678 1352 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 HECW2Q9P2P5 1572 aa23.04■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 DIP2BQ9P265 1576 aa23.03■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 MYT1LQ9UL68 1186 aa23.02■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP23.02■■□□□ 1.28
HPS1-202ENST00000338546 A2MP01023 1474 aa23.02■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 PLA2R1Q13018 1463 aa23.02■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 TET3O43151 1660 aa23■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 BCORL1Q5H9F3 1711 aa22.99■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP22.99■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 NBPF8Q3BBV2 869 aa22.98■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP22.97■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 KIF3BO15066 747 aa22.97■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 RICTORQ6R327 1708 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 FAM69CQ0P6D2 419 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 MIER1Q8N108 512 aa22.96■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 MROH1Q8NDA8 1641 aa22.95■■□□□ 1.27
HPS1-202ENST00000338546 LMTK2Q8IWU2 1503 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 E9PCH4 1651 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 PTPRTO14522 1441 aa22.95■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 TRPM2O94759 1503 aa22.92■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 HSPA5P11021 654 aaKnown RBP22.92■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 ABCA6Q8N139 1617 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 FRMPD1Q5SYB0 1578 aa22.91■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 RALGAPBQ86X10 1494 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa22.9■■□□□ 1.26
HPS1-202ENST00000338546 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa22.89■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 RAPGEF3O95398 923 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 STAC3Q96MF2 364 aa22.88■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 NEURL4Q96JN8 1562 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 DIP2CQ9Y2E4 1556 aa22.87■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 PPRC1Q5VV67 1664 aaKnown RBP22.87■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 EFCAB6Q5THR3 1501 aa22.86■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 DCAF11Q8TEB1 546 aa22.84■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 HIRIP3Q9BW71 556 aaPredicted RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP22.84■■□□□ 1.25
HPS1-202ENST00000338546 PRAG1Q86YV5 1406 aa22.82■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 CEP152O94986 1710 aa22.81■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 KIF13AQ9H1H9 1805 aa22.79■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 USP47Q96K76 1375 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP22.77■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 REREQ9P2R6 1566 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP22.77■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 TSPOAP1O95153 1857 aa22.77■■□□□ 1.24
HPS1-202ENST00000338546 CLTCL1P53675 1640 aa22.76■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa22.76■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP22.76■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa22.76■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 ABCC3O15438 1527 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 WASHC2AQ641Q2 1341 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 GPRASP1Q5JY77 1395 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 LAMC1P11047 1609 aa22.75■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 ZC3H13Q5T200 1668 aaKnown RBP22.75■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 RGL3Q3MIN7 710 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 YEATS2Q9ULM3 1422 aa22.74■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 CARD11Q9BXL7 1154 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 CCDC7Q96M83 1385 aa22.73■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 GGT6Q6P531 493 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa22.72■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 CNTLNQ9NXG0 1405 aa22.71■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP22.71■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP22.71■■□□□ 1.23
HPS1-202ENST00000338546 AGLP35573 1532 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 NPATQ14207 1427 aa22.7■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 PPP6R1Q9UPN7 881 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 KIF1BO60333 1816 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 CAMSAP1Q5T5Y3 1602 aa22.69■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 ANP32CO43423 234 aa22.67■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 CCER2I3L3R5 266 aa22.65■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 MADDQ8WXG6 1647 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP22.64■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 NOS1P29475 1434 aa22.64■■□□□ 1.22
HPS1-202ENST00000338546 MYOM2P54296 1465 aa22.64■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 KIF7Q2M1P5 1343 aa22.64■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 KIAA1210Q9ULL0 1709 aa22.62■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 ADGRB3O60242 1522 aa22.61■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 ARHGEF40Q8TER5 1519 aa22.59■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 RPGRIP1LQ68CZ1 1315 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 IFT172Q9UG01 1749 aa22.58■■□□□ 1.21
HPS1-202ENST00000338546 UGGT1Q9NYU2 1555 aa22.58■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP22.57■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 NBPF1Q3BBV0 1214 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 PIK3C2BO00750 1634 aa22.57■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 NRXN1Q9ULB1 1477 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 SLC52A1Q9NWF4 448 aa22.55■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 SIGLEC1Q9BZZ2 1709 aa22.53■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 MROH2AA6NES4 1674 aa22.52■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 SYNMO15061 1565 aa22.52■■□□□ 1.2
HPS1-202ENST00000338546 CFAP65Q6ZU64 1925 aaKnown RBP22.5■■□□□ 1.19
HPS1-202ENST00000338546 IQGAP1P46940 1657 aa22.5■■□□□ 1.19
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