RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000331563.6

PKP3-201, Transcript of plakophilin 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PKP3, Length 2,809 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP3-201ENST00000331563 RSPH6AQ9H0K4 717 aa24.14■■□□□ 1.46
PKP3-201ENST00000331563 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP24.13■■□□□ 1.453e-8■□□□□ 9.7
PKP3-201ENST00000331563 OSCARQ8IYS5 282 aa24.13■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 ARHGAP5Q13017 1502 aa24.12■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 NUP155O75694 1391 aa24.12■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 PZPP20742 1482 aa24.12■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 MBD5Q9P267 1494 aa24.12■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 RNF123Q5XPI4 1314 aa24.12■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 PDE4AP27815 886 aa24.11■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa24.11■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 KIF15Q9NS87 1388 aa24.11■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP24.1■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 CROCC2H7BZ55 1655 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 NBPF8Q3BBV2 869 aa24.09■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 ZCCHC11Q5TAX3 1644 aaKnown RBP24.08■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 ADGRL2O95490 1459 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.08■■□□□ 1.45
PKP3-201ENST00000331563 ADGBQ8N7X0 1667 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 SYCP2Q9BX26 1530 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 KIF7Q2M1P5 1343 aa24.07■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 GSE1Q14687 1217 aa24.06■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 PREX2Q70Z35 1606 aa24.04■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 EXOC6Q8TAG9 804 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 BACH2Q9BYV9 841 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 CCDC141Q6ZP82 1450 aa24.02■■□□□ 1.44
PKP3-201ENST00000331563 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP24■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 AFAP1Q8N556 730 aa24■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa23.99■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 TMC1Q8TDI8 760 aa23.99■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP23.98■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa23.98■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 ZMYND15Q9H091 742 aa23.98■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 PODXL2Q9NZ53 605 aa23.97■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa23.97■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHG5O94827 1062 aa23.97■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 SHANK2Q9UPX8 1470 aa23.97■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 DDRGK1Q96HY6 314 aa23.97■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.96■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 RRP1P56182 461 aaKnown RBP23.96■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 UHRF1BP1LA0JNW5 1464 aa23.95■■□□□ 1.43
PKP3-201ENST00000331563 NFKBIBQ15653 356 aa23.94■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 MYO5CQ9NQX4 1742 aa23.94■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 ARHGEF5Q12774 1597 aa23.93■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 PLCH2O75038 1416 aa23.93■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 MS4A1P11836 297 aa23.93■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP23.93■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 RSPH4AQ5TD94 716 aa23.93■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 TEX14Q8IWB6 1497 aa23.92■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa23.92■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 VSIG10Q8N0Z9 540 aa23.91■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 SLC4A3P48751 1232 aa23.91■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 SLC24A1O60721 1099 aa23.9■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 FAM43AQ8N2R8 423 aa23.89■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa23.89■■□□□ 1.42
PKP3-201ENST00000331563 RGL3Q3MIN7 710 aa23.88■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP23.88■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 RCAN3Q9UKA8 241 aa23.88■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 DCAF11Q8TEB1 546 aa23.84■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 WDR7Q9Y4E6 1490 aa23.84■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 SKAP1Q86WV1 359 aa23.83■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 ASXL2Q76L83 1435 aa23.83■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP23.83■■□□□ 1.41
PKP3-201ENST00000331563 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.83■■□□□ 1.4
PKP3-201ENST00000331563 SPAG9O60271 1321 aaKnown RBP23.82■■□□□ 1.4
PKP3-201ENST00000331563 FAM135AQ9P2D6 1515 aa23.8■■□□□ 1.4
PKP3-201ENST00000331563 SPATA31E1Q6ZUB1 1445 aa23.79■■□□□ 1.4
PKP3-201ENST00000331563 CYB5RLQ6IPT4 315 aa23.79■■□□□ 1.4
PKP3-201ENST00000331563 FANCAO15360 1455 aa23.76■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 ABCC1P33527 1531 aa23.75■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 PLIN1O60240 522 aa23.74■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 SCAPERQ9BY12 1400 aa23.72■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP23.71■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 KDM5DQ9BY66 1539 aa23.71■■□□□ 1.39
PKP3-201ENST00000331563 CARD11Q9BXL7 1154 aa23.7■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 MAST1Q9Y2H9 1570 aa23.69■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 USP47Q96K76 1375 aa23.69■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 PLA2R1Q13018 1463 aa23.68■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 CCDC144AA2RUR9 1427 aa23.68■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 KIF3BO15066 747 aa23.68■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 CRBNQ96SW2 442 aa23.67■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 DUOX2Q9NRD8 1548 aa23.67■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 ADGRL1O94910 1474 aa23.67■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 PLXNC1O60486 1568 aa23.65■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 NBPF1Q3BBV0 1214 aa23.65■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 CDCA7LQ96GN5 454 aa23.65■■□□□ 1.38
PKP3-201ENST00000331563 POLR1AO95602 1720 aaPredicted RBP23.63■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 ABCA9Q8IUA7 1624 aa23.63■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 PDE3BQ13370 1112 aa23.62■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 LRPPRCP42704 1394 aaKnown RBP23.62■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa23.62■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 HSP90AA2PQ14568 343 aaPredicted RBP23.61■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP23.6■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 ERBINQ96RT1 1412 aa23.6■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 UNC13BO14795 1591 aa23.6■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 ZFYVE16Q7Z3T8 1539 aa23.6■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 CD109Q6YHK3 1445 aa23.59■■□□□ 1.37
PKP3-201ENST00000331563 RAPGEF3O95398 923 aa23.59■■□□□ 1.37
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