RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000329276.9

NOP56-201, Transcript of NOP56 ribonucleoprotein, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene NOP56, Length 2,400 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOP56-201ENST00000329276 PARD3Q8TEW0 1356 aa25.4■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 CARD11Q9BXL7 1154 aa25.39■■□□□ 1.66
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa25.38■■□□□ 1.65
NOP56-201ENST00000329276 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP25.37■■□□□ 1.65
NOP56-201ENST00000329276 ADGRL2O95490 1459 aa25.37■■□□□ 1.65
NOP56-201ENST00000329276 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP25.33■■□□□ 1.65
NOP56-201ENST00000329276 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP25.32■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP25.32■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 PKD2Q13563 968 aa25.32■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 CRBNQ96SW2 442 aa25.32■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 RSPH6AQ9H0K4 717 aa25.32■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 GRIN2AQ12879 1464 aa25.32■■□□□ 1.64
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NOP56-201ENST00000329276 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP25.31■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 FAM43AQ8N2R8 423 aa25.31■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa25.3■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 CROCC2H7BZ55 1655 aa25.29■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 FAM161AQ3B820 660 aa25.29■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 ITSN2Q9NZM3 1697 aa25.29■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 SYNJ2O15056 1496 aa25.29■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa25.29■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 CDCA7LQ96GN5 454 aa25.28■■□□□ 1.64
NOP56-201ENST00000329276 PLIN1O60240 522 aa25.25■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD30AQ9BXX3 1397 aa25.24■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa25.23■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 C8orf34Q49A92 452 aa25.21■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 SLC4A3P48751 1232 aa25.21■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 KDM5DQ9BY66 1539 aa25.21■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa25.21■■□□□ 1.63
NOP56-201ENST00000329276 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP25.2■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 CEP170Q5SW79 1584 aa25.2■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP25.19■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 SKAP1Q86WV1 359 aa25.18■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 RAPGEF6Q8TEU7 1601 aa25.17■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 ARID3CA6NKF2 412 aa25.16■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NOP56-201ENST00000329276 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
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NOP56-201ENST00000329276 KIAA0556O60303 1618 aa25.14■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA6L2Q8N9W4 650 aaPredicted RBP25.13■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 GPATCH8Q9UKJ3 1502 aaKnown RBP25.13■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 ADCY10Q96PN6 1610 aa25.12■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 NUP155O75694 1391 aa25.12■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa25.11■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 SHANK2Q9UPX8 1470 aa25.11■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 C20orf194Q5TEA3 1177 aa25.11■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP25.11■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 DCAF11Q8TEB1 546 aa25.1■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 LAMC1P11047 1609 aa25.09■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 VIRMAQ69YN4 1812 aaKnown RBP25.09■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 JPH4Q96JJ6 628 aa25.08■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa25.08■■□□□ 1.61
NOP56-201ENST00000329276 PTPRGP23470 1445 aa25.07■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 NUP160Q12769 1436 aa25.07■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 DISP1Q96F81 1524 aa25.06■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 PRAG1Q86YV5 1406 aa25.06■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 GPRASP1Q5JY77 1395 aa25.06■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 CHD1O14646 1710 aa25.05■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP25.05■■□□□ 1.6
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NOP56-201ENST00000329276 L1TD1Q5T7N2 865 aaKnown RBP25.03■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 CLASP1Q7Z460 1538 aa25.02■■□□□ 1.6
NOP56-201ENST00000329276 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP25.01■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP25■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 C9orf84Q5VXU9 1444 aa24.99■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF521Q96K83 1311 aa24.98■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 BECN1Q14457 450 aa24.98■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa24.97■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 GOLGA2Q08379 1002 aa24.96■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 RGS3P49796 1198 aa24.96■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP24.96■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 ADAMTS8Q9UP79 889 aa24.96■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 PANK3Q9H999 370 aa24.95■■□□□ 1.59
NOP56-201ENST00000329276 GLIPR1L2Q4G1C9 344 aa24.95■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa24.95■■□□□ 1.58
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NOP56-201ENST00000329276 ERBINQ96RT1 1412 aa24.94■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 DISP3Q9P2K9 1392 aa24.94■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP24.93■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 USP19O94966 1318 aa24.91■■□□□ 1.58
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NOP56-201ENST00000329276 CCDC144AA2RUR9 1427 aa24.91■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa24.91■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 TMF1P82094 1093 aa24.91■■□□□ 1.58
NOP56-201ENST00000329276 SLFN5Q08AF3 891 aa24.88■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 FAM135AQ9P2D6 1515 aa24.88■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 ABCC10Q5T3U5 1492 aa24.88■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 TRMT2AQ8IZ69 625 aaKnown RBP24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 PKNOX2Q96KN3 472 aa24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 TSPY4P0CV99 314 aa24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 TSPY10P0CW01 314 aa24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 RRAGDQ9NQL2 400 aaPredicted RBP24.87■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 NKTRP30414 1462 aaKnown RBP24.86■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 NBPF1Q3BBV0 1214 aa24.86■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 NINLQ9Y2I6 1382 aa24.85■■□□□ 1.57
NOP56-201ENST00000329276 ARHGEF5Q12774 1597 aa24.85■■□□□ 1.57
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