RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319359.7

ELL3-201, Transcript of elongation factor for RNA polymerase II 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene ELL3, Length 2,352 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ELL3-201ENST00000319359 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa29■■■□□ 2.23
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ELL3-201ENST00000319359 CEP170Q5SW79 1584 aa28.99■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 SKAP1Q86WV1 359 aa28.98■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 NBPF1Q3BBV0 1214 aa28.97■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 PLEKHD1A6NEE1 506 aa28.97■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 PLIN1O60240 522 aa28.97■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 TSPY4P0CV99 314 aa28.97■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 TSPY10P0CW01 314 aa28.97■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 RGL3Q3MIN7 710 aa28.96■■■□□ 2.23
ELL3-201ENST00000319359 E9PCH4 1651 aa28.96■■■□□ 2.23
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ELL3-201ENST00000319359 JPH4Q96JJ6 628 aa28.94■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP28.93■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 PDE4AP27815 886 aa28.93■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP28.92■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 PARD3Q8TEW0 1356 aa28.92■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 ABCC10Q5T3U5 1492 aa28.92■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP28.91■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP28.9■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 SHANK2Q9UPX8 1470 aa28.89■■■□□ 2.22
ELL3-201ENST00000319359 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP28.89■■■□□ 2.21
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ELL3-201ENST00000319359 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP28.88■■■□□ 2.21
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ELL3-201ENST00000319359 ATP10BO94823 1461 aa28.87■■■□□ 2.21
ELL3-201ENST00000319359 PTPRGP23470 1445 aa28.87■■■□□ 2.21
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ELL3-201ENST00000319359 PRAG1Q86YV5 1406 aa28.85■■■□□ 2.21
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ELL3-201ENST00000319359 DISP3Q9P2K9 1392 aa28.83■■■□□ 2.21
ELL3-201ENST00000319359 FAM135AQ9P2D6 1515 aa28.82■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP28.81■■■□□ 2.2
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ELL3-201ENST00000319359 CRBNQ96SW2 442 aa28.81■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 SYNJ2O15056 1496 aa28.8■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa28.8■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 ABCA8O94911 1581 aa28.8■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 PANK3Q9H999 370 aa28.79■■■□□ 2.2
ELL3-201ENST00000319359 CCDC144AA2RUR9 1427 aa28.79■■■□□ 2.2
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ELL3-201ENST00000319359 C20orf194Q5TEA3 1177 aa28.76■■■□□ 2.2
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ELL3-201ENST00000319359 A2MP01023 1474 aa28.73■■■□□ 2.19
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ELL3-201ENST00000319359 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP28.72■■■□□ 2.19
ELL3-201ENST00000319359 MS4A1P11836 297 aa28.71■■■□□ 2.19
ELL3-201ENST00000319359 NUP160Q12769 1436 aa28.71■■■□□ 2.19
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ELL3-201ENST00000319359 CCDC141Q6ZP82 1450 aa28.68■■■□□ 2.18
ELL3-201ENST00000319359 ARHGEF5Q12774 1597 aa28.68■■■□□ 2.18
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ELL3-201ENST00000319359 IL27Q8NEV9 243 aa28.66■■■□□ 2.18
ELL3-201ENST00000319359 ERBINQ96RT1 1412 aa28.66■■■□□ 2.18
ELL3-201ENST00000319359 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP28.62■■■□□ 2.17
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ELL3-201ENST00000319359 ERCC6Q03468 1493 aa28.59■■■□□ 2.17
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ELL3-201ENST00000319359 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa28.57■■■□□ 2.16
ELL3-201ENST00000319359 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP28.57■■■□□ 2.16
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ELL3-201ENST00000319359 KDM2BQ8NHM5 1336 aa28.54■■■□□ 2.16
ELL3-201ENST00000319359 MAGI2Q86UL8 1455 aa28.53■■■□□ 2.16
ELL3-201ENST00000319359 PREX2Q70Z35 1606 aa28.53■■■□□ 2.16
ELL3-201ENST00000319359 DUSP27Q5VZP5 1158 aa28.52■■■□□ 2.16
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ELL3-201ENST00000319359 ARHGAP5Q13017 1502 aa28.48■■■□□ 2.15
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ELL3-201ENST00000319359 TTC37Q6PGP7 1564 aa28.46■■■□□ 2.15
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ELL3-201ENST00000319359 ZNF521Q96K83 1311 aa28.42■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP28.42■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 C8orf34Q49A92 452 aa28.41■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 RGS3P49796 1198 aa28.4■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 GOLGA2Q08379 1002 aa28.4■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 NFKBIBQ15653 356 aa28.39■■■□□ 2.14
ELL3-201ENST00000319359 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP28.38■■■□□ 2.13
ELL3-201ENST00000319359 MAST1Q9Y2H9 1570 aa28.37■■■□□ 2.13
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