RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000296387.5

CLDN19-201, Transcript of claudin 19, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene CLDN19, Length 2,859 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN19-201ENST00000296387 PLEKHD1A6NEE1 506 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 NUP160Q12769 1436 aa16.94■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 ADCY10Q96PN6 1610 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 TSPY4P0CV99 314 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 TSPY10P0CW01 314 aa16.93■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 RALBP1Q15311 655 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 RGL3Q3MIN7 710 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 MYT1LQ9UL68 1186 aa16.92■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 RCAN3Q9UKA8 241 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP16.91■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 NBPF1Q3BBV0 1214 aa16.91■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa16.9■□□□□ 0.3
CLDN19-201ENST00000296387 ABCC10Q5T3U5 1492 aa16.88■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP16.88■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa16.87■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 PLIN1O60240 522 aa16.87■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 NLRP13Q86W25 1043 aa16.87■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 ATP10BO94823 1461 aa16.87■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 SKAP1Q86WV1 359 aa16.87■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 E9PCH4 1651 aa16.86■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP16.86■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 SHANK2Q9UPX8 1470 aa16.85■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP16.84■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 PARD3Q8TEW0 1356 aa16.84■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP16.84■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 KDM5DQ9BY66 1539 aa16.84■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 PTPRGP23470 1445 aa16.83■□□□□ 0.29
CLDN19-201ENST00000296387 PDE4AP27815 886 aa16.82■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 PRAG1Q86YV5 1406 aa16.82■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 ABCA8O94911 1581 aa16.81■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 FAM135AQ9P2D6 1515 aa16.81■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP16.81■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 DISP3Q9P2K9 1392 aa16.81■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.8■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP16.8■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 PANK3Q9H999 370 aa16.79■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 CHD1O14646 1710 aa16.79■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa16.79■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 PDE3BQ13370 1112 aa16.78■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 TESK2Q96S53 571 aa16.77■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 CRBNQ96SW2 442 aa16.77■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 BACH2Q9BYV9 841 aa16.77■□□□□ 0.28
CLDN19-201ENST00000296387 PLA2R1Q13018 1463 aa16.76■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 A2MP01023 1474 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 C20orf194Q5TEA3 1177 aa16.75■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC141Q6ZP82 1450 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 ARHGEF5Q12774 1597 aa16.74■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP16.74■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa16.71■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 ERBINQ96RT1 1412 aa16.71■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 GPRASP1Q5JY77 1395 aa16.71■□□□□ 0.27
CLDN19-201ENST00000296387 ADAMTS8Q9UP79 889 aa16.71■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.7■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 NEFMP07197 916 aa16.7■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 MS4A1P11836 297 aa16.7■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 SYCP2Q9BX26 1530 aa16.7■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 TMF1P82094 1093 aa16.68■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa16.68■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP16.68■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 ERCC6L2Q5T890 1561 aa16.67■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 PREX2Q70Z35 1606 aa16.66■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa16.66■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 MYO5CQ9NQX4 1742 aa16.65■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 ARHGAP5Q13017 1502 aa16.64■□□□□ 0.26
CLDN19-201ENST00000296387 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.64■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 SLC4A3P48751 1232 aa16.64■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 RSPH4AQ5TD94 716 aa16.64■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.63■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 IL27Q8NEV9 243 aa16.63■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 MAGI2Q86UL8 1455 aa16.63■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 UNC13BO14795 1591 aa16.63■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 TTC37Q6PGP7 1564 aa16.62■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 PPP2R1AP30153 589 aa16.62■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 SHROOM2Q13796 1616 aa16.61■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 DUSP27Q5VZP5 1158 aa16.61■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 KNSTRNQ9Y448 316 aa16.61■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP16.6■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 LAMC1P11047 1609 aa16.59■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 KDM2BQ8NHM5 1336 aa16.59■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.59■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 RTN4Q9NQC3 1192 aaKnown RBP16.59■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 WDR7Q9Y4E6 1490 aa16.59■□□□□ 0.25
CLDN19-201ENST00000296387 IQGAP3Q86VI3 1631 aa16.58■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP16.58■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 INSRP06213 1382 aa16.58■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP16.57■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP16.57■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 CLASP1Q7Z460 1538 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP16.56■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 GOLGA2Q08379 1002 aa16.56■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.55■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 MAST1Q9Y2H9 1570 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 RGS3P49796 1198 aa16.55■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 ZNF521Q96K83 1311 aa16.54■□□□□ 0.24
CLDN19-201ENST00000296387 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 20.8 ms