RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000282096.8

PDE3B-201, Transcript of phosphodiesterase 3B, humanhuman

APPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDE3B, Length 6,076 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3B-201ENST00000282096 DDX11L8A8MPP1 907 aa21.97■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP21.97■■□□□ 1.111e-6■■■■■ 29.5
PDE3B-201ENST00000282096 TPM3P06753 285 aa21.96■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP21.96■■□□□ 1.11
PDE3B-201ENST00000282096 CCAR2Q8N163 923 aaKnown RBP21.95■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 PRM3Q9NNZ6 103 aa21.95■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 RSPH4AQ5TD94 716 aa21.95■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 PTPRGP23470 1445 aa21.94■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 KANK4Q5T7N3 995 aaPredicted RBP21.92■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 FAM69CQ0P6D2 419 aa21.92■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 PDE3BQ13370 1112 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 FAM13BQ9NYF5 915 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 NUP155O75694 1391 aa21.91■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 TMX4Q9H1E5 349 aaPredicted RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 RASSF8Q8NHQ8 419 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 ZNF592Q92610 1267 aa21.9■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 FANCIQ9NVI1 1328 aa21.89■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC34Q96HJ3 373 aa21.89■■□□□ 1.1
PDE3B-201ENST00000282096 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP21.89■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 WIZO95785 1651 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 CLUAP1Q96AJ1 413 aa21.89■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 CALRP27797 417 aaKnown RBP21.88■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP21.88■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 ST18O60284 1047 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 SMC4Q9NTJ3 1288 aa21.88■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP21.87■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 ANO8Q9HCE9 1232 aaPredicted RBP21.86■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC18Q5T9S5 1454 aa21.86■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 NUTM2DQ5VT03 806 aaPredicted RBP21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 PHLDB1Q86UU1 1377 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 PDE4AP27815 886 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 GPS2Q13227 327 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 PES1O00541 588 aaKnown RBP21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 GPATCH3Q96I76 525 aa21.84■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 KIF16BQ96L93 1317 aa21.83■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 MPHOSPH9Q99550 1183 aa21.83■■□□□ 1.09
PDE3B-201ENST00000282096 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP21.83■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 SF3A1Q15459 793 aaKnown RBP21.83■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 SKOR2Q2VWA4 1001 aaPredicted RBP21.82■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC146Q8IYE0 955 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 SMARCA4P51532 1647 aa21.82■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 GOLGA6L19H0YKK7 550 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 CEP89Q96ST8 783 aa21.81■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 MEX3CQ5U5Q3 659 aaKnown RBP21.81■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 GORABQ5T7V8 394 aa21.8■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 FHOD3Q2V2M9 1422 aa21.79■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP21.79■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 TPD52L1Q16890 204 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 CHMP3Q9Y3E7 222 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 KIF15Q9NS87 1388 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 FAM161AQ3B820 660 aa21.78■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 HMMRO75330 724 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 SLC4A10Q6U841 1118 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 TEX35Q5T0J7 233 aa21.77■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP21.77■■□□□ 1.08
PDE3B-201ENST00000282096 BECN2A8MW95 431 aa21.77■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 CENPQQ7L2Z9 268 aaPredicted RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 H3BQV1 296 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 IFFO2Q5TF58 517 aa21.76■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP21.76■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 TSR1Q2NL82 804 aaKnown RBP21.75■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 STK31Q9BXU1 1019 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 NLRP13Q86W25 1043 aa21.74■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 TERF2IPQ9NYB0 399 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 CCDC70Q6NSX1 233 aa21.73■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 ZBED9Q6R2W3 1325 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 NUTM2FA1L443 756 aa21.72■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 MYBBP1AQ9BQG0 1328 aaKnown RBP21.72■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP21.71■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 FAM43AQ8N2R8 423 aa21.71■■□□□ 1.07
PDE3B-201ENST00000282096 EVA1CP58658 441 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 PLIN1O60240 522 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 TOMM22Q9NS69 142 aa21.7■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 RILPL2Q969X0 211 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.69■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP21.68■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 AMPHP49418 695 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 KIF3AQ9Y496 699 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 TAF7LQ5H9L4 462 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 FAM184AQ8NB25 1140 aa21.68■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 TPM1P09493 284 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 EXOC6Q8TAG9 804 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 RRP1P56182 461 aaKnown RBP21.67■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 HOMER1Q86YM7 354 aa21.67■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 ZFP91-CNTFA0A0A6YYC7 529 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 ATP6V1DQ9Y5K8 247 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 ANKRD45Q5TZF3 282 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 CHMP4AQ9BY43 222 aa21.66■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 MARCH6O60337 910 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 G3V3G9 751 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 DCAF8Q5TAQ9 597 aa21.65■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 L3MBTL2Q969R5 705 aa21.64■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 FBXO3Q9UK99 471 aa21.64■■□□□ 1.06
PDE3B-201ENST00000282096 VPS53Q5VIR6 699 aa21.64■■□□□ 1.05
PDE3B-201ENST00000282096 MCTP1Q6DN14 999 aa21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.6 ms