RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000263233.8

SYP-201, Transcript of synaptophysin, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SYP, Length 2,498 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYP-201ENST00000263233 DEKP35659 375 aaKnown RBP20.04■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 RALBP1Q15311 655 aa20.04■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 ABCC10Q5T3U5 1492 aa20.04■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.03■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 IPO9Q96P70 1041 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP20.02■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 DCAF11Q8TEB1 546 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 PTPRGP23470 1445 aa20.02■□□□□ 0.8
SYP-201ENST00000263233 CARMIL2Q6F5E8 1435 aa20.01■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 RRP1P56182 461 aaKnown RBP20■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 NBR1Q14596 966 aa20■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 PLEKHD1A6NEE1 506 aa19.99■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 ABCA8O94911 1581 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 TSPY4P0CV99 314 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 TSPY10P0CW01 314 aa19.98■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 ATP10BO94823 1461 aa19.97■□□□□ 0.79
SYP-201ENST00000263233 EXOC6Q8TAG9 804 aa19.95■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 PARD3Q8TEW0 1356 aa19.95■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 TRPM1Q7Z4N2 1603 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 ARHGEF5Q12774 1597 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 RCAN3Q9UKA8 241 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 NLRP13Q86W25 1043 aa19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP19.94■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 PRAG1Q86YV5 1406 aa19.92■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 FAM135AQ9P2D6 1515 aa19.92■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP19.91■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 PDE3BQ13370 1112 aa19.9■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 PER1O15534 1290 aaPredicted RBP19.9■□□□□ 0.78
SYP-201ENST00000263233 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP19.88■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 CCDC144AA2RUR9 1427 aa19.87■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 CCDC141Q6ZP82 1450 aa19.86■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 NBPF1Q3BBV0 1214 aa19.86■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa19.86■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 GPRASP1Q5JY77 1395 aa19.85■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 CDCA7LQ96GN5 454 aa19.85■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 COL17A1Q9UMD9 1497 aaPredicted RBP19.85■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa19.84■□□□□ 0.77
SYP-201ENST00000263233 PLA2R1Q13018 1463 aa19.83■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 PDE4AP27815 886 aa19.83■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 LAMC1P11047 1609 aa19.83■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 A2MP01023 1474 aa19.82■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 RGL3Q3MIN7 710 aa19.82■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP19.82■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 PREX2Q70Z35 1606 aa19.82■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 DISP3Q9P2K9 1392 aa19.81■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 NPM2Q86SE8 214 aaKnown RBP19.81■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa19.81■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP19.81■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 TESK2Q96S53 571 aa19.81■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 INSRP06213 1382 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 CLASP1Q7Z460 1538 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 CC2D1BQ5T0F9 858 aaKnown RBP19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 BACH2Q9BYV9 841 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 UNC13BO14795 1591 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 MS4A1P11836 297 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 OSCARQ8IYS5 282 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa19.8■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 RSPH4AQ5TD94 716 aa19.78■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 MYO5CQ9NQX4 1742 aa19.77■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 PLIN1O60240 522 aa19.77■□□□□ 0.76
SYP-201ENST00000263233 PANK3Q9H999 370 aa19.77■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 ERBINQ96RT1 1412 aa19.76■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 MAST1Q9Y2H9 1570 aa19.75■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 SYCP2Q9BX26 1530 aa19.75■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 SHROOM2Q13796 1616 aa19.74■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP19.74■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 CRBNQ96SW2 442 aa19.74■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP19.74■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 IQGAP3Q86VI3 1631 aa19.73■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa19.73■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 TMF1P82094 1093 aa19.71■□□□□ 0.75
SYP-201ENST00000263233 SKAP1Q86WV1 359 aa19.69■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 TTC37Q6PGP7 1564 aa19.69■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 PLXNC1O60486 1568 aa19.68■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 ARHGAP5Q13017 1502 aa19.68■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 LAS1LQ9Y4W2 734 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 ATP10AO60312 1499 aa19.68■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP19.68■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 ADAMTS8Q9UP79 889 aa19.66■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 C20orf194Q5TEA3 1177 aa19.66■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP19.65■□□□□ 0.74
SYP-201ENST00000263233 MAGI2Q86UL8 1455 aa19.64■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 WDR7Q9Y4E6 1490 aa19.64■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 NEFMP07197 916 aa19.64■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 USP35Q9P2H5 1018 aa19.63■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 DUOX2Q9NRD8 1548 aa19.63■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 KDM2BQ8NHM5 1336 aa19.63■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa19.62■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 PPP2R1AP30153 589 aa19.61■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 DUSP27Q5VZP5 1158 aa19.6■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 IQGAP1P46940 1657 aa19.59■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 DDRGK1Q96HY6 314 aa19.59■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 KNSTRNQ9Y448 316 aa19.58■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 ZNF521Q96K83 1311 aa19.58■□□□□ 0.73
SYP-201ENST00000263233 MADDQ8WXG6 1647 aa19.58■□□□□ 0.72
SYP-201ENST00000263233 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP19.57■□□□□ 0.72
SYP-201ENST00000263233 AMER1Q5JTC6 1135 aaPredicted RBP19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 34.6 ms