RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259467.8

PDCL-201, Transcript of phosducin like, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDCL, Length 2,813 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL-201ENST00000259467 POGZQ7Z3K3 1410 aa13.82□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 EIF4G2P78344 907 aaKnown RBP eCLIP13.82□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 FOXD1Q16676 465 aa13.82□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 KIF15Q9NS87 1388 aa13.81□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP13.81□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 CNTLNQ9NXG0 1405 aa13.81□□□□□ -0.2
PDCL-201ENST00000259467 YEATS2Q9ULM3 1422 aa13.81□□□□□ -0.2
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PDCL-201ENST00000259467 INO80Q9ULG1 1556 aaPredicted RBP13.73□□□□□ -0.21
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PDCL-201ENST00000259467 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.7□□□□□ -0.22
PDCL-201ENST00000259467 NUP155O75694 1391 aa13.69□□□□□ -0.22
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PDCL-201ENST00000259467 LAMC1P11047 1609 aa13.67□□□□□ -0.22
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PDCL-201ENST00000259467 PRAG1Q86YV5 1406 aa13.58□□□□□ -0.24
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PDCL-201ENST00000259467 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.57□□□□□ -0.24
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PDCL-201ENST00000259467 RNF17Q9BXT8 1623 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
PDCL-201ENST00000259467 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.56□□□□□ -0.24
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PDCL-201ENST00000259467 ZBED9Q6R2W3 1325 aa13.54□□□□□ -0.24
PDCL-201ENST00000259467 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP13.54□□□□□ -0.24
PDCL-201ENST00000259467 CEP152O94986 1710 aa13.53□□□□□ -0.24
PDCL-201ENST00000259467 VWDEQ8N2E2 1590 aa13.53□□□□□ -0.24
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PDCL-201ENST00000259467 BCL11AQ9H165 835 aa13.5□□□□□ -0.25
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PDCL-201ENST00000259467 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 MADDQ8WXG6 1647 aa13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 IQGAP1P46940 1657 aa13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 RGL3Q3MIN7 710 aa13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 NPATQ14207 1427 aa13.48□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 ST20-MTHFSA0A0A6YYL1 179 aa13.47□□□□□ -0.25
PDCL-201ENST00000259467 AGLP35573 1532 aa13.46□□□□□ -0.25
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