RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000254190.3

CHSY1-201, Transcript of chondroitin sulfate synthase 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CHSY1, Length 4,550 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHSY1-201ENST00000254190 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa30.29■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 COG6Q9Y2V7 657 aa30.29■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 MYOM3Q5VTT5 1437 aa30.28■■■□□ 2.44
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L1Q9NU39 408 aa30.26■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 MCCP23508 829 aa30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 NAP1L2Q9ULW6 460 aaPredicted RBP30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 USP35Q9P2H5 1018 aa30.25■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP30.24■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L4A6NEF3 574 aa30.23■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 CALD1Q05682 793 aaKnown RBP30.23■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 CNTLNQ9NXG0 1405 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L3A6NEY3 463 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 TERF2IPQ9NYB0 399 aa30.22■■■□□ 2.43
CHSY1-201ENST00000254190 ELL2O00472 640 aaPredicted RBP30.2■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 E9PSI1 815 aa30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 CFAP44Q96MT7 982 aa30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 HDGFP51858 240 aaKnown RBP30.18■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa30.17■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 SUGP2Q8IX01 1082 aaKnown RBP eCLIP30.15■■■□□ 2.423e-6■■■□□ 18.2
CHSY1-201ENST00000254190 SYNJ1O43426 1573 aa30.15■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 GSE1Q14687 1217 aa30.15■■■□□ 2.42
CHSY1-201ENST00000254190 CGNL1Q0VF96 1302 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 GAPVD1Q14C86 1478 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 CCDC184Q52MB2 194 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 SLC4A10Q6U841 1118 aa30.12■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 CDCA7LQ96GN5 454 aa30.11■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa30.1■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 NCOA2Q15596 1464 aa30.1■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 NBPF8Q3BBV2 869 aa30.08■■■□□ 2.41
CHSY1-201ENST00000254190 ZKSCAN2Q63HK3 967 aa30.07■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 CASKIN1Q8WXD9 1431 aa30.07■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 NUTM2FA1L443 756 aa30.06■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PAK3O75914 559 aaPredicted RBP30.06■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PTPRGP23470 1445 aa30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 STK31Q9BXU1 1019 aa30.05■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 TRIM6-TRIM34B2RNG4 842 aa30.03■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 PRXQ9BXM0 1461 aa30.03■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD45Q5TZF3 282 aa30.02■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ADAMTS8Q9UP79 889 aa30.02■■■□□ 2.4
CHSY1-201ENST00000254190 ARID3AQ99856 593 aa30.01■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 PTMSP20962 102 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 ERICH3Q5RHP9 1530 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 DRC7Q8IY82 874 aa30■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CHAF1AQ13111 956 aaPredicted RBP29.99■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa29.99■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 HMMRO75330 724 aa29.98■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CFTRP13569 1480 aa29.98■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L4Q8WXT5 416 aaPredicted RBP29.97■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 CUX1P39880 1505 aa29.96■■■□□ 2.39
CHSY1-201ENST00000254190 NCAPD3P42695 1498 aa29.95■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 CDK11BP21127 795 aaKnown RBP29.94■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 AKNAQ7Z591 1439 aa29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 PANK1Q8TE04 598 aa29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 BRD4O60885 1362 aaPredicted RBP29.93■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 NBPF1Q3BBV0 1214 aa29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 WDR97A6NE52 1622 aa29.92■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 NRDCO43847 1150 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 LMOD3Q0VAK6 560 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 FYCO1Q9BQS8 1478 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 GOLGA6L6A8MZA4 724 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 KIAA2012Q0VF49 1180 aa29.91■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 EVC2Q86UK5 1308 aa29.9■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP29.89■■■□□ 2.38
CHSY1-201ENST00000254190 VGFO15240 615 aaPredicted RBP29.89■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NFKBIBQ15653 356 aa29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 LTV1Q96GA3 475 aaPredicted RBP29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX49Q9Y6V7 483 aaKnown RBP29.88■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 ST18O60284 1047 aa29.87■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX11L8A8MPP1 907 aa29.86■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 SYAP1Q96A49 352 aaPredicted RBP29.86■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NGDNQ8NEJ9 315 aaKnown RBP29.85■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 DDX19BQ9UMR2 479 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 NGEFQ8N5V2 710 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 RIPK4P57078 832 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 AMPHP49418 695 aa29.84■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 RUNDC1Q96C34 613 aa29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L6Q3SYB3 417 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 FOXD4L3Q6VB84 417 aaPredicted RBP29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 MIA2Q96PC5 1412 aa29.83■■■□□ 2.37
CHSY1-201ENST00000254190 HFM1A2PYH4 1435 aa29.82■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 LNPKQ9C0E8 428 aa29.8■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 DIAPH1O60610 1272 aaKnown RBP29.79■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 RILPL2Q969X0 211 aa29.78■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 ZNF330Q9Y3S2 320 aaPredicted RBP29.78■■■□□ 2.36
CHSY1-201ENST00000254190 PPP2R1AP30153 589 aa29.76■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TMEM132EQ6IEE7 984 aa29.76■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 CFAP70Q5T0N1 1121 aa29.75■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 GGNBP2Q9H3C7 697 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 CHMP5Q9NZZ3 219 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 COG3Q96JB2 828 aa29.74■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TCP11L2Q8N4U5 519 aa29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 MTHFSP49914 203 aa29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP29.73■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TIAM1Q13009 1591 aa29.72■■■□□ 2.35
CHSY1-201ENST00000254190 TULP1O00294 542 aaPredicted RBP29.72■■■□□ 2.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.2 ms