RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 KIF14Q15058 1648 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 PLIN1O60240 522 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CCDC7Q96M83 1385 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
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RRN3-201ENST00000198767 ROCK1Q13464 1354 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 USP47Q96K76 1375 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 KDM6BO15054 1643 aa11.71□□□□□ -0.53
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RRN3-201ENST00000198767 KANK1Q14678 1352 aa11.71□□□□□ -0.54
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RRN3-201ENST00000198767 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.7□□□□□ -0.54
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RRN3-201ENST00000198767 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.66□□□□□ -0.54
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RRN3-201ENST00000198767 PDE4AP27815 886 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 CHD1O14646 1710 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 TMF1P82094 1093 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ASXL2Q76L83 1435 aa11.63□□□□□ -0.55
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RRN3-201ENST00000198767 CD109Q6YHK3 1445 aa11.61□□□□□ -0.55
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RRN3-201ENST00000198767 PLCH2O75038 1416 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PZPP20742 1482 aa11.6□□□□□ -0.55
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RRN3-201ENST00000198767 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.59□□□□□ -0.55
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RRN3-201ENST00000198767 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 POGKQ9P215 609 aa11.57□□□□□ -0.56
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RRN3-201ENST00000198767 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
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RRN3-201ENST00000198767 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.55□□□□□ -0.56
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RRN3-201ENST00000198767 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
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RRN3-201ENST00000198767 GSE1Q14687 1217 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 ADGRL2O95490 1459 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 IDI1Q13907 227 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.47□□□□□ -0.57
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RRN3-201ENST00000198767 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.46□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 MORC1Q86VD1 984 aa11.46□□□□□ -0.57
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