RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000198767.10

RRN3-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RRN3, Length 3,762 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3-201ENST00000198767 ARID4BQ4LE39 1312 aaPredicted RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ROCK2O75116 1388 aaKnown RBP11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ERCC6L2Q5T890 1561 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 SCAPERQ9BY12 1400 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 FAM69CQ0P6D2 419 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 EXOC6Q8TAG9 804 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 KIF14Q15058 1648 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ZBED9Q6R2W3 1325 aa11.76□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 PLIN1O60240 522 aa11.75□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ANKRD30BQ9BXX2 1392 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CCDC144AA2RUR9 1427 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CCDC7Q96M83 1385 aa11.74□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 EIF5BO60841 1220 aaKnown RBP11.73□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 TRHP20396 242 aaPredicted RBP11.73□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 WASHC2CQ9Y4E1 1318 aa11.73□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 ROCK1Q13464 1354 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 CNTLNQ9NXG0 1405 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 USP47Q96K76 1375 aa11.72□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 KDM6BO15054 1643 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 TNNT2P45379 298 aaPredicted RBP11.71□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 BRPF3Q9ULD4 1205 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 STK26Q9P289 416 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 NUDCQ9Y266 331 aa11.71□□□□□ -0.53
RRN3-201ENST00000198767 KANK1Q14678 1352 aa11.71□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 KIAA1107Q9UPP5 1409 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 PLEKHH2Q8IVE3 1493 aa11.7□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 TCOF1Q13428 1488 aaKnown RBP11.69□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 LRRIQ1Q96JM4 1722 aa11.69□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 CDCA7LQ96GN5 454 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 CCDC141Q6ZP82 1450 aa11.68□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 ARXQ96QS3 562 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 ERICH6BQ5W0A0 696 aa11.67□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 TRAPPC8Q9Y2L5 1435 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 TRAK1Q9UPV9 953 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 SYCP2Q9BX26 1530 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 PDE4AP27815 886 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 CHD1O14646 1710 aa11.66□□□□□ -0.54
RRN3-201ENST00000198767 KDM5BQ9UGL1 1544 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 TMEM132EQ6IEE7 984 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 TMF1P82094 1093 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 CFAP70Q5T0N1 1121 aa11.64□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 KNSTRNQ9Y448 316 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ASXL2Q76L83 1435 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PLEKHG5O94827 1062 aa11.63□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PANK3Q9H999 370 aa11.62□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ABCA8O94911 1581 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 RPRD2Q5VT52 1461 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 CD109Q6YHK3 1445 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 FANCAO15360 1455 aa11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP11.61□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PLCH2O75038 1416 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 PZPP20742 1482 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 RRP1P56182 461 aaKnown RBP11.6□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 RCAN3Q9UKA8 241 aa11.6□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ABCC2Q92887 1545 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ADGRL1O94910 1474 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 ABCC10Q5T3U5 1492 aa11.59□□□□□ -0.55
RRN3-201ENST00000198767 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP11.58□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 RGS3P49796 1198 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 NEUROD2Q15784 382 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 C20orf194Q5TEA3 1177 aa11.58□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 POGKQ9P215 609 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 SMG6Q86US8 1419 aaKnown RBP11.57□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 CRBNQ96SW2 442 aa11.57□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 WDR43Q15061 677 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 MBD5Q9P267 1494 aa11.56□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 PPM1GO15355 546 aaPredicted RBP11.56□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 GEMIN5Q8TEQ6 1508 aaKnown RBP eCLIP11.56□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 NUTM2FA1L443 756 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 SRPK2P78362 688 aaKnown RBP11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 BACH2Q9BYV9 841 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 FRAT1Q92837 279 aaPredicted RBP11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 WDR7Q9Y4E6 1490 aa11.55□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 FBXO31Q5XUX0 539 aaPredicted RBP11.54□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 ITSN2Q9NZM3 1697 aa11.54□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP11.54□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 TTC37Q6PGP7 1564 aa11.53□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 NFKBIBQ15653 356 aa11.53□□□□□ -0.56
RRN3-201ENST00000198767 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa11.52□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 ARHGEF12Q9NZN5 1544 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 TCERG1O14776 1098 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 FRAT2O75474 233 aaPredicted RBP11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 CDCA8Q53HL2 280 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 SOX12O15370 315 aa11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 KTN1Q86UP2 1357 aaKnown RBP11.51□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 CCDC146Q8IYE0 955 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 MINK1Q8N4C8 1332 aaPredicted RBP11.5□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 FAM135AQ9P2D6 1515 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 SAMD9LQ8IVG5 1584 aa11.5□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 RNF123Q5XPI4 1314 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 GSE1Q14687 1217 aa11.49□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 SPRYD3Q8NCJ5 442 aa11.48□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 ADGRL2O95490 1459 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 IDI1Q13907 227 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 TEX14Q8IWB6 1497 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 ERBINQ96RT1 1412 aa11.47□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 CDC42BPAQ5VT25 1732 aa11.46□□□□□ -0.57
RRN3-201ENST00000198767 MORC1Q86VD1 984 aa11.46□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.4 ms