RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000007722.11

ITGA3-201, Transcript of integrin subunit alpha 3, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene ITGA3, Length 3,665 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC146Q8IYE0 955 aa16.92■□□□□ 0.3
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ITGA3-201ENST00000007722 SEC24BO95487 1268 aa16.88■□□□□ 0.29
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ITGA3-201ENST00000007722 ARHGEF11O15085 1522 aa16.82■□□□□ 0.28
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ITGA3-201ENST00000007722 DNMBPQ6XZF7 1577 aa16.79■□□□□ 0.28
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ITGA3-201ENST00000007722 PLEKHH1Q9ULM0 1364 aa16.78■□□□□ 0.28
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ITGA3-201ENST00000007722 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP16.73■□□□□ 0.27
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ITGA3-201ENST00000007722 SLFN5Q08AF3 891 aa16.72■□□□□ 0.27
ITGA3-201ENST00000007722 MAPK8IP3Q9UPT6 1336 aa16.72■□□□□ 0.27
ITGA3-201ENST00000007722 BLMP54132 1417 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
ITGA3-201ENST00000007722 DNMT1P26358 1616 aaKnown RBP16.71■□□□□ 0.27
ITGA3-201ENST00000007722 PRG4Q92954 1404 aaPredicted RBP16.71■□□□□ 0.27
ITGA3-201ENST00000007722 ZMYM4Q5VZL5 1548 aa16.7■□□□□ 0.26
ITGA3-201ENST00000007722 RRP9O43818 475 aaKnown RBP16.7■□□□□ 0.26
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ITGA3-201ENST00000007722 CENPJQ9HC77 1338 aaPredicted RBP16.69■□□□□ 0.26
ITGA3-201ENST00000007722 KIAA0586Q9BVV6 1533 aa16.68■□□□□ 0.26
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ITGA3-201ENST00000007722 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa16.68■□□□□ 0.26
ITGA3-201ENST00000007722 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa16.68■□□□□ 0.26
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ITGA3-201ENST00000007722 ESPNB1AK53 854 aa16.66■□□□□ 0.26
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ITGA3-201ENST00000007722 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa16.66■□□□□ 0.26
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ITGA3-201ENST00000007722 ANTXR1Q9H6X2 564 aa16.65■□□□□ 0.26
ITGA3-201ENST00000007722 CHMP5Q9NZZ3 219 aa16.65■□□□□ 0.26
ITGA3-201ENST00000007722 HSCBQ8IWL3 235 aa16.64■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 DMRT2Q9Y5R5 561 aa16.64■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 E9PSI1 815 aa16.64■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 CCDC144AA2RUR9 1427 aa16.64■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa16.64■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 TBC1D32Q96NH3 1257 aa16.63■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 ERBINQ96RT1 1412 aa16.63■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 TNNQ9UQP3 1299 aa16.63■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 EIF3AQ14152 1382 aaKnown RBP16.63■□□□□ 0.25
ITGA3-201ENST00000007722 TESK2Q96S53 571 aa16.63■□□□□ 0.25
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