RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000173357.7

Nelfe-204, Transcript of Negative elongation factor E, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Nelfe, Length 1,399 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Fhad1A6PWD2 1420 aa37.04■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Zbtb7cQ8VCZ7 619 aa37.04■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Vps8Q0P5W1 1427 aa37.02■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Clstn2Q9ER65 966 aa37.02■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kif1bQ60575 1816 aaKnown RBP37.02■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Supt6hQ62383 1726 aaKnown RBP37.01■■■■□ 3.52
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Talpid3E9PV87 1520 aa37■■■■□ 3.51
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 ShprhQ7TPQ3 1674 aa36.96■■■■□ 3.51
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pde4cQ3UEI1 686 aa36.94■■■■□ 3.5
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ttll5Q8CHB8 1328 aa36.7■■■■□ 3.47
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Adamts7Q68SA9 1657 aa36.7■■■■□ 3.47
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ccer2J3QPU5 274 aa36.69■■■■□ 3.46
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dip2bQ3UH60 1574 aa36.64■■■■□ 3.46
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Asxl1P59598 1514 aa36.62■■■■□ 3.45
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hfm1D3Z4R1 1434 aa36.62■■■■□ 3.45
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ttc21bQ0HA38 1315 aa36.62■■■■□ 3.45
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ahdc1Q6PAL7 1594 aaKnown RBP36.59■■■■□ 3.45
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mphosph9A6H5Y1 991 aa36.57■■■■□ 3.45
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Cd109Q8R422 1442 aa36.56■■■■□ 3.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Trak1Q6PD31 939 aa36.56■■■■□ 3.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tmem131lQ3U3D7 1597 aa36.53■■■■□ 3.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Bcl9Q9D219 1425 aa36.53■■■■□ 3.44
Nelfe-204ENSMUST00000173357 AnkarA2RT91 1465 aa36.53■■■■□ 3.44
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kif21bQ9QXL1 1668 aa36.41■■■■□ 3.42
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ercc6l2Q9JIM3 1537 aa36.33■■■■□ 3.41
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Hdac5Q9Z2V6 1113 aa36.32■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tarbp1E9Q368 1579 aa36.32■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Erich6D3Z6S9 713 aa36.31■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ino80Q6ZPV2 1559 aa36.31■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pkd2O35245 966 aa36.29■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Iqgap3F8VQ29 1632 aa36.29■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Tecpr2Q3UH45 1423 aa36.28■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Skint5A7XUY5 1461 aa36.28■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Chd2E9PZM4 1827 aaKnown RBP36.27■■■■□ 3.4
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kdm5aQ3UXZ9 1690 aa36.26■■■■□ 3.39
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prdm2A2A7B5 1709 aaKnown RBP36.26■■■■□ 3.39
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dhx9O70133 1380 aaKnown RBP36.22■■■■□ 3.39
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Edc4Q3UJB9 1406 aaKnown RBP36.21■■■■□ 3.39
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Stk24Q99KH8 431 aa36.18■■■■□ 3.38
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Kif13aQ9EQW7 1749 aa36.17■■■■□ 3.38
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Ankrd36D3Z4K0 1415 aa36.17■■■■□ 3.38
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dip2aQ8BWT5 1523 aa36.14■■■■□ 3.38
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Itsn1Q9Z0R4 1714 aa36.11■■■■□ 3.37
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Scn4aQ9ER60 1841 aa36.08■■■■□ 3.37
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Pik3c2gO70167 1506 aa36.07■■■■□ 3.36
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Nelfe-204ENSMUST00000173357 Dot1lQ6XZL8 1540 aa36■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Arid4bA2CG63 1314 aaKnown RBP35.99■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Mroh1E0CZ22 1640 aa35.98■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 AatkQ80YE4 1365 aa35.98■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Scaf11E9PZM7 1456 aaKnown RBP35.98■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Phlpp1Q8CHE4 1687 aa35.96■■■■□ 3.35
Nelfe-204ENSMUST00000173357 Prrc2bQ7TPM1 1486 aaKnown RBP35.95■■■■□ 3.35
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